سامانه پشتیبانی خدمات اطلاعات

  اخبار و اعلانات

 آمار

تعداد نشریات158
تعداد شماره‌ها6,230
تعداد مقالات67,758
تعداد مشاهده مقاله115,123,890
تعداد دریافت فایل اصل مقاله89,891,506
کشاورزی, فاطمه, فرخی نژاد, رضا, مهرابی کوشکی, مهدی. (1401). شناسایی قارچ‌هایی از تیره Didymellaceae همراه علائم مختلف بیماری در برخی گیاهان دارویی در استان خوزستان. , 53(2), 163-176. doi: 10.22059/ijpps.2022.341338.1007005
فاطمه کشاورزی; رضا فرخی نژاد; مهدی مهرابی کوشکی. "شناسایی قارچ‌هایی از تیره Didymellaceae همراه علائم مختلف بیماری در برخی گیاهان دارویی در استان خوزستان". , 53, 2, 1401, 163-176. doi: 10.22059/ijpps.2022.341338.1007005
کشاورزی, فاطمه, فرخی نژاد, رضا, مهرابی کوشکی, مهدی. (1401). 'شناسایی قارچ‌هایی از تیره Didymellaceae همراه علائم مختلف بیماری در برخی گیاهان دارویی در استان خوزستان', , 53(2), pp. 163-176. doi: 10.22059/ijpps.2022.341338.1007005
کشاورزی, فاطمه, فرخی نژاد, رضا, مهرابی کوشکی, مهدی. شناسایی قارچ‌هایی از تیره Didymellaceae همراه علائم مختلف بیماری در برخی گیاهان دارویی در استان خوزستان. , 1401; 53(2): 163-176. doi: 10.22059/ijpps.2022.341338.1007005

شناسایی قارچ‌هایی از تیره Didymellaceae همراه علائم مختلف بیماری در برخی گیاهان دارویی در استان خوزستان

دانش گیاهپزشکی ایران
مقاله 2، دوره 53، شماره 2، بهمن 1401، صفحه 163-176    اصل مقاله (1.63 M)
نوع مقاله: مقاله پژوهشی
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijpps.2022.341338.1007005
نویسندگان
فاطمه کشاورزی؛ رضا فرخی نژاد؛ مهدی مهرابی کوشکی*
گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید چمران اهواز
چکیده
اکالیپتوس (Eucalyptus sp..)، بارهنگ (Plantago sp. )، خارشتر (Alhagi sp..)، سه‏پستان (Cordia myxa)، شیرین‏بیان (Glycyrrhiza glabra)، شوید (Anethum graveolens)، رزماری (Rosmarinus officinalis) و هندوانه ابوجهل (Citrullus colocynthis) از گیاهان دارویی در مناطق مختلف استان خوزستان هستند که می‌توانند میزبان تعداد زیادی قارچ‏های بیماری‌زای و غیر بیماری‏زای گیاهی باشند. در این مطالعه درطول سال‌های 98-1397، 30 نمونه از گیاهان دارویی فوق با علائم لکه‏برگی، شانکر و نکروز ساقه جمع‏آوری و 23 جدایه از شش گونه در تیره Didymellaceae شناسایی شدند. ویژگی-‏های ریخت‌شناسی روی محیط کشت سیب‌زمینی - دکستروز- آگار (PDA) بررسی شد. برای شناسایی مولکولی، بخش‌هایی از ناحیه‏های ITS (بعضی جدایه‏ها)، tub2 (تمام جدایه‏ها) و rpb2 (بعضی‏جدایه‏ها) با استفاده از آغازگرهای مناسب تکثیر و توالی‌یابی شدند. بر اساس تبارزایی مولکولی و ریخت‏شناسی، گونه‏های Allophoma labilis، Didymella glomerata، Epicoccum italicum، Neodidymelliopsis farokhinejad، Nothophoma raii و Xenodidymella glycyrrhizicola شناسایی شدند. براساس دانش ما، این اولین گزارش گونه‌های فوق روی میزبان‏های ذکر شده و اولین ثبت از گونه‏های Epicoccum italicum و . N. raii برای میکوبیوتای ایران است.
کلیدواژه‌ها
تبارزایی مولکولی؛ ریخت‏ شناسی؛ پیکنیدیوم؛ کنیدیوم؛ میزبان گیاهی
عنوان مقاله [English]
Identification of Didymellaceae fungi associated with different disease symptoms in some medicinal plants of Khuzestan Province, Iran
نویسندگان [English]
Fatemeh Keshavarzi؛ Reza Farrokhinejad؛ Mehdi Mehrabi-Koushki
Department of Plant protection, Faculty of Agriculture, Shahid Chamran University of Ahvaz
چکیده [English]
Bitter apple (Citrullus colocynthis), camelthorn (Alhagi sp.), cordia (Cordia myxa), dill (Anethum graveolens), eucalyptus (Eucalyptus sp.), licorice (Glycyrrhiza glabra), plantain (Plantago sp.), and rosemary (Rosmarinus officinalis) are medicinal plants distributed in different parts of Khuzestan province. These plants could be host to many pathogenic and non-pathogenic fungi. In this study, 30 samples from medicinal plants showing leaf spot, stem canker and stem necrosis were collected during 2019-2020, and in which 23 isolates of six species in the family Didymellaceae were identified. Molphological characteristics were studied on potato – dextrose - agar (PDA). For molecular study, partial regions of tub2 gene were amplified using appropriate primers and sequenced. Based on molecular phylogeny in combination with morphology, the isolates were identified as follow: Allophoma labilis, Didymella glomerata, Epicoccum italicum, Neodidymelliopsis farokhinejad, Nothophoma raii and Xenodidymella glycyrrhizicola. In our knowledge, this is the first report of above species on surveyed hosts and first record of both E. italicum and N. raii for mycobiota of Iran.
کلیدواژه‌ها [English]
Molecular phylogeny, morphology, pycnidium, conidium, plant host
مراجع
  1. Ahmadpour, S.A., Mehrabi-Koushki, M. & Farokhinejad, R. (2017a). Neodidymelliopsis farokhinejadii, a new fungal species from dead branches of trees in Iran. Sydowia, 69, 171–182.
  2. Ahmadpour, S.A., Farokhinejad, R. & Mehrabi-Koushki, M. (2017b). Further characterization and pathogenicity of Didymella microchlamydospora causing stem necrosis of Morus nigra in Iran. Mycosphere, 8(7), 835–852.
  3. Ahmadpour, S.A., Mehrabi-Koushki, M., Farokhinejad, R. & Asgari B. (2022a). New species of the family Didymellaceae in Iran. Mycological Progress, 21, 28. DOI: 10.1007/s11557-022-01800-5
  4. Ahmadpour, S.A., Mehrabi-Koushki, M., Farokhinejad, R. & Asgari B. (2022b). Xenodidymella iranica sp. nov. and new hosts of X. glycyrrhizicola in Iran. Tropical Plant Patholology, 47, 430–441.
  5. Alidadi, A., Kowsari, M., Javan-Nikkhah, M., Salehi-Jouzani, G.R., & Ebrahimi Rastaghi, M. (2019). New pathogenic and endophytic fungal species associated with Persian oak in Iran. Europian Journal of Plant Pathology, 155(3), 1017-1032.
  6. Amirdehi, E., Fotouhifar, K.B. & Javan-Nikkhah, M. (2017). Morphological and molecular study on some species of Phoma and related taxa in Iran. Rostaniha, 18 (1), 59–76. (In Farsi)
  7. Aveskamp, M.M., de Gruyter, J. & Crous, PW. (2008). Biology and recent developments in the systematics of Phoma, a complex genus of major quarantine significance. Fungal Diversity, 31, 1–18.
  8. Aveskamp, M.M. (2010). Highlights of the Didymellaceae: a polyphasic approach to characterize Phoma and related pleosporalean genera. Studies in Mycology, 65, 1–60.
  9. Babaahmadi, G., Mehrabi-Koushki, M. & Hayati, J. (2018). Allophoma hayatii sp. nov., an undescribed pathogenic fungus causing dieback of Lantana camara in Iran. Mycological Progress, 17(3), 365–379.
  10. Boerema, G.H., de Gruyter, J., Noordeloos, M.E. & Humers, M.E.C. (2004). Phoma identification manual. Differentiation of specific and infra-specific taxa in culture. CABI Publishing, Wallingford, UK.
  11. Chen, Q., Jiang, J. R. & Zhang G. Z. (2015). Resolving the Phoma enigma. Studies in Mycology, 82, 137–217.
  12. Chen, Q., Hou, L. W., Duan, W. J., Crous, P. W. & Cai, L. (2017). Didymellaceae revisited. Studies in Mycology, 87, 105–159.
  13. Corda, A. C. J. 1840. Icones Fungorum Hucusque Cognitorum. Vol 4, Prague.
  14. Crous, P.W., Wingfield, M.J., Burgess, T.I., Carnegie, A.J., Hardy, G.E.St.J. et al. (2017). Fungal planet description sheets: 625–715. Persoonia, 39, 270–467.
  15. Darriba D., Taboada, G.L., Doallo, R. & Posada, D. (2012). jModelTest 2: more models, new heuristics and parallel computing. Nature Methods, 9(8), 772.
  16. de Gruyter, J., Noordeloos, M.E. & Boerema, G.H. (1993). Contributions towards a
    monograph of Phoma (Coelomycetes) – I. 2. Section Phoma: additional taxa with very small conidia and taxa with conidia up to 7 μm long. Persoonia, 15, 369–400.
  17. Edler, D., Klein, J., Antonelli A. & Silvestro, D. (2021). raxmlGUI 2.0 beta: a graphical interface and toolkit for phylogenetic analyses using RAxMl. Methods in Ecology and Evolution, 12, 373–377.
  18. Ershad, D. (2009). Fungi of Iran (3nd ed.). Agricultural Research, Education & Extension Organization Publication, Tehran, 531 pp.
  19. Farr, D.F. & Rossman, A.Y. (2022). Fungal Databases. U.S. National Fungus Collections, ARS, USDA. Retrieved February 7, 2022 from https://nt.ars-grin.gov/fungaldatabases/.
  20. Heidari, K. (2018). Detection and identification of fungal pathogens causing anthracnose of some plants in Khouzestan province. M.Sc. dissertation, Shahid Chamran University of Ahvaz, Ahvaz.
  21. Hou, L.W., Groenewald, J.Z., Pfenning, L.H., Yarden, O., Crous, P.W. & Cai, L. (2020). The phoma-like dilemma. Studies in Mycology, 96, 309–396.
  22. Howizeh, H., Dinarvand, M. & Salehi, H. (2003). Medicinal plants of Khuzestan. Iranian Journal of Medicinal and Aromatic Plants, 14(1), 55–72. (In Farsi)
  23. Khodaei, S., Arzanlou, M., Babai-Ahari, A., Rota-Stabelli, O. & Pertot, I. (2018). Characterisation of several plant pathogenic species belonging to the family Didymellaceae based on multigene and morphological analyses in East and West Azarbaijan provinces. Iranian Journal of Plant Pathology, 54(2), 87–110. (In Farsi)
  24. Kumar, S., Stecher, G., & Tamura, K. (2016). MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets. Molecular Biology and Evolution, 33, 1870–1874.
  25. Larki, R., Mehrabi-Koushki, M. & Farokhinejad, R. (2019). Ectophoma iranica sp. nov. and new hosts and records of Allophoma spp. in Iran. Journal of Phytopathology, 167, 538–545.
  26. Liu, Y.J., Whelen, S. & Hall, B.D. (1999). Phylogenetic relationships among Ascomycetes: evidence from an RNA polymerse II subunit. Molecular Biology and Evolution, 16, 1799–1808.
  27. O’Donnell, K. (1993). Fusarium and ITS near relatives. In: Reynolds, D. R. & Taylor, J. W. (eds), The Fungal Holomorph: Mitotic, Meiotic and Pleomorphic Speciation in Fungal Systematics. UK: CAB International, pp. 225–233.
  28. Raeder, U. & Broda, P. (1985). Rapid preparation of DNA from filamentous fungi. Letters in Applied Microbiology, 1 (1), 17–20.
  29. Ronquist, F., Teslenko, M., Van Der Mark, P., Ayres, D.L., Darling, A. et al. (2012). MrBayes 3.2: efficient Bayesian phylogenetic inference and model choice across a large model space. Systematic Biology, 61, 539–542.
  30. Safi, A. (2020). A survey on pathogenic and non-pathogenic cultivable mycoflora of some wooden ornamentals in Ahvaz landscapes. M.Sc. dissertation, Shahid Chamran University of Ahvaz, Ahvaz.
  31. Sharafzadeh, S. & Alizadeh, O. (2012). Some medicinal plants cultivated in Iran. Journal of Applied Pharmaceutical Science, 2, 134–137.
  32. Sullivan, R.F. & White, J.F. (2000). Phoma glomerata as a mycoparasite of powdery mildew. Applied and Environmental Microbiology, 66(1), 425–427.
  33. Sung, G. H., Sung, J. M., Hywel-Jones, N. L., & Spatafora, J. W. (2007). A multi-gene phylogeny of Clavicipitaceae (Ascomycota, Fungi): Identification of localized incongruence using a combinational bootstrap approach. Molecular Phylogenetics and Evolution, 44, 1204–1223.
  34. White, T. J., Bruns, T., Lee, S. & Taylor, J. (1990). Amplification and direct sequencing of fungal ribosomal RNA genes for phylogenetics. In: Innis, M. A., Gelfand, D. H., Sninsky, J. J. & White, T. J. (eds), PCR Protocols: a guide to methods and applications. Academic Press, New York, USA, pp. 315–322.
  35. Woudenberg, J., Aveskamp, M., de Gruyter, J., Spiers, A., & Crous, P. (2009). Multiple Didymella teleomorphs are linked to the Phoma clematidina morphotype. Persoonia, 22, 56–62.
آمار
تعداد مشاهده مقاله: 274
تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 329


سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب