تمییز آلل های MHC سگ (DLA-DRB1) با روش تحلیل دقیق دمای شکافت DNA | ||
| مجله تحقیقات دامپزشکی (Journal of Veterinary Research) | ||
| مقاله 11، دوره 73، شماره 1، بهار 1397، صفحه 93-100 اصل مقاله (2.25 M) | ||
| نوع مقاله: هماتولوژی و بیوشیمی درمانگاهی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/jvr.2018.137896.2392 | ||
| نویسندگان | ||
| سید میلاد واحدی1؛ شهرام جمشیدی1؛ لیلا لنکرای مهاجر1؛ غلامرضا نیکبخت بروجنی* 2 | ||
| 1گروه بیماریهای داخلی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران | ||
| 2گروه میکروبیولوژی و ایمونولوژی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران | ||
| چکیده | ||
| زمینه مطالعه: نقش مهم مولکولهای مجتمع عمده پذیرش بافتی (MHC) اتصال به پپتیدهای پادگنی و عرضه آنها به لنفوسیتهای T است. از اینرو تنوع MHC با حساسیت و یا مقاومت در برابر بسیاری از بیماریهای عفونی و بیماری های خودایمن مرتبط است. یک روش نوین بررسی تنوع ژنتیکی، تحلیل دقیق دمای شکافت (HRM-High Resolution Melting) DNA است که می توان آنرا برای بررسی تنوع MHC به کار برد. هدف: تمییز آلل های MHC سگ (DLA-DRB1) با روش تحلیل دقیق دمای شکافت DNA روش کار: تعداد 40 نمونه خون از سگ های ارجاعی به بیمارستان دامهای کوچک دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران جمع آوری گردید. پس از استخراج DNA و افزوده سازی اگزون دوم ژن DLA-DRB1، تحلیل HRM و منحنی ذوب صورت گرفت. برای تطبیق الگوهای HRM با توالی نوکلئوتیدی آلل ها، از روش تعیین توالی مستقیم استفاده شد. نتایج: بر اساس تنوع مشاهده شده در نتایج HRM و منحنی ذوب، 40 نمونه به 8 ژنوتیپ (A تا H) قابل تقسیمبندی بودند. بیشترین فراوانی مربوط به تیپ A (00/25 %) و سپس تیپ C و E (هر کدام 00/15 %) بود. در مجموع 5/82 % نمونه ها هتروزیگوت و 5/17 % نمونه ها هوموزیگوت بودند. نتیجه گیری: مطالعه حاضر اولین مطالعهای است که برای تایپیگ آللهای ژن DLA-DRB1 از تکنیک HRM استفاده شده است. تطبیق نتایج HRM با توالی آلل ها نشان داد که این روش میتواند برای تفکیک آللهای DLA-DRB1 به کار رود. | ||
| کلیدواژهها | ||
| مجتمع عمده پذیرش بافتی؛ سگ؛ DLA-DRB1؛ تحلیل دقیق دمای شکافت | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 870 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 729 |
||