شناسایی و تجزیه و تحلیل miRNA ها و ایزومیرهای جدید و ژنهای هدف آنها در گاوهای شیری مبتلا به ورم پستان | ||
| تولیدات دامی | ||
| مقاله 1، دوره 18، شماره 4، 1395، صفحه 647-659 اصل مقاله (830.74 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/jap.2016.58923 | ||
| نویسندگان | ||
| الهام جعفری1؛ محمدرضا بختیاری زاده* 2؛ عبدالرضا صالحی3 | ||
| 1دانشجو | ||
| 2پردیس ابوریحان، تخصص: ژنتیک و اصلاح نژاد دام/ ژنتیک مولکولی/ بیوانفورماتیک | ||
| 3lهیئت علمی | ||
| چکیده | ||
| ورم پستان یکی از بیماریهای عفونی غدد پستان است که هزینههای زیادی را به صنعت گاو شیری تحمیل میکند. مکانیسم تنظیمی این بیماری پیچیده بوده و تحت کنترل ژنهای تنظیمی مختلفی قرار دارد. در مطالعه حاضر به منظور درک بهتر عناصر تنظیمی درگیر در بیماری ورمپستان، نمونههای شیر گاوهای سالم و آلوده در طی سری زمانی صفر، ۱۲، ۳۶،۲۴ و ۴۸ ساعت پس از آلودگی جمعآوری گردید. دادههای miRNA-seq از نمونههای شیر بدست آمد و با استفاده از روشهای بیوانفورماتیکی پیشرفته، miRNAهای جدید، ژنهای هدف آنها، عملکرد احتمالی آنها، ایزومیرها و همچنین miRNA*های جدید شناسایی شد. نتایج منجر به شناسایی نود و دو miRNA جدید شد که تعداد بیست و شش miRNA دارای ژن همولوگ و شصت و شش miRNA فاقد ژن همولوگ در دیگر گونهها بود. بررسی گروه-های کارکردی ژنهای هدف، مؤید نقش miRNAهای جدید در بسیاری از مکانیسمهای مقابله با التهاب و آلودگی از جمله، پاسخ به تحریکات داخلی و خارجی، مرگ سلولی و تولید ایمنوگلوبین است. همچنین علاوه بر این، صد و سی و پنجmiRNA* جدید نیز شناسایی شد. در مطالعه حاضر ۴۹۳ ایزومیر جدید شناسایی شد که در گونههایی نظیر انسان و موش دارای عملکردهای مرتبط با ایمنی میباشند. بر اساس نتایج حاصل از این مطالعه ژنهای هدف miRNAهای جدید در مسیرهای مرتبط با بیماری ورم پستان از جمله ایمنی، مرگ سلولی و التهاب نقش دارند و این مطلب میتواند مؤید نقش احتمالی و تنظیمی miRNAهای جدید شناسایی شده در بروز ورم پستان باشد. | ||
| کلیدواژهها | ||
| التهاب؛ پاسخ ایمنی؛ توالییابی نسل بعد؛ سیستم پستانی؛ miRNA-seq | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,476 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 689 |
||