تعداد نشریات | 161 |
تعداد شمارهها | 6,532 |
تعداد مقالات | 70,501 |
تعداد مشاهده مقاله | 124,093,150 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 97,197,509 |
شناسایی مناطق ژنومی مرتبط با ذخیره چربی در برخی از نژادهای گوسفند آسیایی و آفریقایی بر پایه روش نشانه های انتخاب | ||
علوم دامی ایران | ||
مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 20 تیر 1403 اصل مقاله (1.08 M) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2024.374928.654010 | ||
نویسندگان | ||
سوسن رادپور1؛ محمدتقی بیگی نصیری1؛ محمدحسین مرادی* 2؛ علی اسمعیلی زاده کشکوئیه3 | ||
1گروه علوم دامی، دانشکده علوم دامی و صنایع غذایی، دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی خوزستان، ملاثانی، ایران. | ||
2گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و محیط زیست، دانشگاه اراک، اراک، ایران | ||
3بخش علوم دامی، دانشکده کشاورزی ,و منابع طبیعی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان. ایران | ||
چکیده | ||
پژوهش حاضر با هدف شناسایی مناطق ژنومی، ژنهای کاندید و مسیرهای زیستی مؤثر بر ذخیره چربی در دنبه در برخی از نژادهای گوسفند آسیایی و آفریقایی بر اساس بررسی نشانههای انتخاب و آنالیز غنیسازی مجموعههای ژنی انجام شده است. بدین منظور، از مجموع اطلاعات ژنومی مربوط به 49034 جایگاه نشانگری SNP متعلق به 404 نمونه حیوان شامل 13 نژاد دنبهدار و 7 نژاد بدون دنبه، با ابعاد دنبه و دم نسبتاً مشابه که در مناطق مختلف آسیا و آفریقا پراکنش داشتند، استفاده شد. جهت بررسی نحوه قرار گرفتن حیوانات در گروههای نژادی خود از آنالیز مؤلفههای اصلی (PCA) و برای ردیابی نشانههای انتخاب مثبت از آزمون نااریب FST (تتا) استفاده شد. سپس ژنهای گزارش شده در مناطق تحت انتخاب شناسایی گردید و آنالیز غنیسازی مجموعه ژنی با هدف شناسایی مسیرهای بیولوژیکی (و ژنهای کاندیدای) مرتبط با ذخیره چربی انجام شد. آنالیز مؤلفههای اصلی (PCA) نشان داد که تمام حیوانات در گروههای نژادی خود قرار میگیرند و نژادهای دنبهدار و بدون دنبه را میتوان بر اساس مؤلفههای مختلف از هم تفکیک نمود. در این پژوهش 19 منطقه ژنومی تحت انتخاب بین نژادهای دنبهدار و بدون دنبه شناسایی شد. بررسی ژنهای گزارش شده در این مناطق منجر به شناسایی چندین مسیر بیولوژیکی (و ژنهای کاندیدا) شد که به طور مستقیم یا غیر مستقیم با مورفولوژی دم (NDUFB، ANO4، ASXL2، ABHD2 و NID2)، اندازه دنبه (ACADL)، اسکلت و یا ساختار اندازه بدن (PDGFD، ACAN،HOXC ،HOXB ، BMP2 و (BMP4، پاسخ ایمنی (ATG5، IL4، IL5 و IL13) و تنظیم ملانوسیتها (KITLG) مرتبط میباشند. | ||
کلیدواژهها | ||
ژنهای کاندید؛ شاخص تمایز جمعیتی؛ گوسفندان آسیایی؛ گوسفندان آفریقایی؛ نشانههای انتخاب | ||
مراجع | ||
| ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 132 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 14 |