تعداد نشریات | 161 |
تعداد شمارهها | 6,573 |
تعداد مقالات | 71,036 |
تعداد مشاهده مقاله | 125,506,837 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 98,770,797 |
شناسایی جایگاههای ژنومی مرتبط با چندقلوزایی تحت انتخاب بین نژادهای گوسفندان بومی ایران و گوسفند نژاد رومانوف با عملکرد تولیدمثلی بالا | ||
علوم دامی ایران | ||
مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 20 تیر 1403 اصل مقاله (808.56 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2024.369473.653982 | ||
نویسندگان | ||
پرویز عزیزی1؛ محمد مرادی شهربابک* 2؛ حسین مرادی شهربابک3؛ مهدی مخبر4 | ||
1گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تهران، کرج. ایران | ||
2گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه تهران. کرج. ایران | ||
3گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی ، دانشگاه تهران، کرج. ایران | ||
4گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی، دانشگاه ارومیه، ارومیه، ایران. | ||
چکیده | ||
به منظور شناسایی ژنهای مرتبط با عملکرد تولیدمثلی تحت انتخاب بین نژادهای گوسفندان بومی ایران و نژاد رومانوف روسی از اطلاعات ژنومی 233 رأس گوسفند استفاده شد. دادههای مربوط به گوسفندان نژاد رومانوف از پایگاه اطلاعاتی iSheep و اطلاعات ژنومی گوسفندان ایرانی از پایگاه اطلاعاتی به آدرس https://disk.yandex.ru/d/3N2wEv0-9_NL0w، تهیه شدند. فیلتراسیون و کنترل کیفی دادهها، آنالیز شاخص تمایز ژنتیکی (FST) و آنالیز مولفههای اصلی (PCA) جهت تعیین گروههای ژنتیکی با استفاده از نرم افزار PLINK1.9، صورت گرفت. برآوردگر نااریب FST (θ) و آمارهی XPEHH جهت کاوش نشانههای انتخاب مورد استفاده قرار گرفتند. استخراج ژنهای مرتبط با مناطق ژنومی تحت انتخاب توسط پایگاه اطلاعاتی آنلاین BIOMART با انطباق روی ژنوم گوسفند (Oar_v3.1) انجام شد. تعداد 489 ژن مرتبط با مناطق ژنومی تحت انتخاب (معادل 1/0 درصد کل نشانگرهای مورد مطالعه) شناسایی شد.ند بررسی مناطق ژنومی تحت انتخاب نشان داد، از میان 489 ژن شناسایی شده مرتبط با تفاوتهای موجود بین دو گروه مورد مطالعه، تعداد 7 ژن درگیر در مسیرهای بیولوژیکی مرتبط با سنتز استروئید و استروئیدوژنز تخمدان بودند که بهعنوان موارد تحت انتخاب مرتبط با صفت چندقلوزایی، شناسایی شدند. شناسایی این مسیرهای بیولوژیکی و تلفیق آن با سایر اطلاعات مرتبط با صفت چندقلوزایی میتواند در طراحی برنامههای اصلاح نژادی جهت بهبود عملکرد تولیدمثلی، موثر باشد. | ||
کلیدواژهها | ||
جاروب انتخاب؛ آرایههای ژنومیکی؛ چندقلو زایی؛ گوسفندان بومی؛ نژاد رومانوف | ||
مراجع | ||
| ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 133 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 70 |