شناسایی ژنهای موثر بر صفات رشد در جوجه های گوشتی با استفاده از روشهای رگرسیون خطی و یادگیری ماشین | ||
| علوم دامی ایران | ||
| دوره 55، شماره 3، پاییز 1403، صفحه 583-602 اصل مقاله (1.76 M) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2023.363825.653963 | ||
| نویسندگان | ||
| حسین بانی سعادت1؛ رسول واعظ ترشیزی* 2؛ علی اکبر مسعودی3؛ علیرضا احسانی3؛ صالح شاهین فر4 | ||
| 1گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران | ||
| 2گروه علوم دامی دانشکده کشاورزی دانشگاه تربیت مدرس تهران ایران | ||
| 3گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران. | ||
| 4تحقیقات کشاورزی ویکتوریا، مرکز آگریبایوساینس، بوندورا، ویکتوریا ۳۰۸۳، استرالیا. | ||
| چکیده | ||
| آگاهی از ارتباط چندشکلیهای تکنوکلئوتیدی با صفات مهم اقتصادی یکی از ابزارهای مهم برنامههای اصلاح نژاد در صنعت طیور است. مطالعات پویش ژنومی برای کشف چندشکلیهای تکنوکلئوتیدی (نشانگرها) مرتبط با این صفات، اغلب با استفاده از مدلهای خطی ساده صورت میگیرد که به دلیل وجود برخی از فرضیات این مدلها، ممکن است بعضی از نشانگرها شناسایی نشوند. این مطالعه با هدف ارزیابی کارآیی روشهای جنگل تصادفی و گرادیان بوستینگ و ارزیابی عملکرد آنها در مقابل مدل خطی برای شناسایی نشانگرهای همبسته با صفات وزن بدن در سنین 6 و 9 هفتگی در جوجههای گوشتی نسل دوم حاصل از تلاقیهای دوطرفه لاین تجاری آرین با پرندههای بومی ارومیه انجام شد. نتایج نشان داد که دو روش یادگیری ماشین توانستند نشانگرهای مهمی از جمله GGaluGA308573، GGaluGA255033، Gga_rs13614212، Gga_rs13743072، GGaluGA258772، Gga_rs14034395 و Gga_rs13858398 را برای صفات وزن بدن شناسایی کنند که به ترتیب با ژنهای MAP2، ACSL1، CAMSAP2، FAM117B، SLC4A4، TIMP4 و LncRNA در ارتباط بودند. تقسیم سلولی، کنترل رشد، تنظیم ساختار اسکلت سلولی و میکروتوبول، و فعالیت رونویسی مهمترین فرآیند بیولوژیکی این ژنها میباشند. مطالعه ژنهای جدید شناسایی شده توسط روشهای یادگیری ماشین، که مدل خطی قادر به شناسایی آنها در جمعیت مورد مطالعه نبودند، میتواند بینش جدیدی را برای کنترل ژنتیکی صفات رشد در جوجههای گوشتی باز کند. علاوه بر این، نشانگرهای با اهمیت کشف شده، قابلیت استفاده در برنامههای اصلاح ژنتیکی جوجههای گوشتی را دارند. | ||
| کلیدواژهها | ||
| چندشکلیهای تکنوکلئوتیدی؛ مطالعات پویش ژنومی؛ جوجه های گوشتی؛ یادگیری ماشین | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 994 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 635 |
||