مطالعه پیوستگی سراسری ژنوم با صفات تولید شیر و معیار سلولهای بدنی گاوهای هلشتاین ایران | ||
| علوم دامی ایران | ||
| دوره 51، شماره 3، پاییز 1399، صفحه 221-229 اصل مقاله (823.96 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2020.308210.653796 | ||
| نویسندگان | ||
| رستم پهلوان1؛ محمد مرادی شهربابک* 2؛ اردشیر نجاتی جوارمی2؛ رستم عبداللهی آرپناهی3 | ||
| 1دانشجوی دکتری، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران | ||
| 2استاد، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران | ||
| 3محقق، دانشگاه فلوریدا، آمریکا | ||
| چکیده | ||
| در پرورش گاوشیری هدف اصلی افزایش سود است. افزایش بیماری ورمپستان از مشکلات اصلی پرورش گاوشیری با کاهش طولعمر تولیدی و افزایش هزینهها، سبب تحمیل زیانهای اقتصادی جدی به این صنعت شدهاست. این مطالعه باهدف بررسی معماری ژنتیکی و شناسایی نواحی ژنومی مرتبط با صفات تولیدشیر و تعداد سلولهای بدنی بهعنوان یکی از شاخصهای ارزیابی کیفیت شیر و معیاری غیرمستقیم از بیماری ورمپستان، انجام شدهاست. برای بررسی ارتباط و شناسایی پنجرههای ژنومی اصلی، از روش مطالعه پیوستگی سراسری ژنوم یکمرحلهای با دادههای ژنومی 1938 راس گاو نر استفاده شد. نتایج براساس واریانس ژنتیکی افزایشی پنجرههای 5/1 مگابازی از SNPهای مجاور ارائه شده است. پنجرههایی که بیش از 1% واریانس را کنترل میکنند بهعنوان نواحی ژنومی اصلی و جهت یافتن ژنهای کاندیدا استفاده شدند. تعداد 11 پنجره ژنومی اصلی روی 9 کروموزوم اتوزوم، حاوی 94 ژن کاندیدا حدود 20% واریانس ژنتیکی معیار سلولهای بدنی را توصیف میکردند. بیشترین واریانس مربوط به پنجرهای روی کروموزوم 14 (85/3%) بود. تعداد 6 پنجره اصلی روی 6 کروموزوم شامل 89 ژن کاندیدا، مرتبط با تولیدشیر بودند. این پنجرهها 8/8% واریانس و مهمترین پنجره روی کروموزوم 10، حدود 08/2% واریانس را کنترل مینمودند. درخصوص مقدار چربی و پروتئین شیر، بهترتیب تعداد 9 منطقه روی 7 کروموزوم، حدود 6/15% و 9 پنجره روی 8 کروموزوم، حدود 6/10% از واریانس را توصیف میکردند. نتایج نشان داد که 4 ناحیه ژنومی اثر پلیوتروپی دارند. یافتههای این تحقیق میتواند بهعنوان منبع اطلاعاتی مهمی در ارزیابیهای ژنومی صفات تولید شیر و تعداد سلولهای بدنی باشد. | ||
| کلیدواژهها | ||
| پنجرههای ژنومی؛ ژنهای کاندیدا؛ معیار سلولهای بدنی؛ هلشتاین | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,194 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 859 |
||