تعداد نشریات | 161 |
تعداد شمارهها | 6,572 |
تعداد مقالات | 71,003 |
تعداد مشاهده مقاله | 125,492,944 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 98,753,343 |
بررسی الگوی ترجیح کدونی و ارتباط آن با ژنهایی با بیان متفاوت در بین دو جمعیت گاوهای خالص و آمیخته سیستانی و مونتبیلیارد | ||
تولیدات دامی | ||
مقاله 1، دوره 22، شماره 2، تیر 1399، صفحه 187-198 اصل مقاله (1.12 M) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/jap.2020.292780.623470 | ||
نویسندگان | ||
بتول اصغری اسفدن1؛ غلامرضا داشاب* 2؛ محمدحسین بنابازی3؛ محمد رکوعی4 | ||
1دانشجوی دکتری، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران | ||
2دانشیار ژنتیک و اصلاح دام، گروه علوم دامی،دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل | ||
3استادیار،بخش پژوهشهای بیوتکنولوژی،موسسه تحقیقات علوم دامی کشور،سازمان تحقیقات،آموزش و ترویج کشاورزی،کرج،ایران | ||
4دانشیار، گروه علوم دامی،دانشکده کشاورزی،دانشگاه زابل،زابل،ایران | ||
چکیده | ||
هدف از پژوهش حاضر، بررسی الگوی ترجیح کدونی و ارتباط آنها با بیان ژن برای ژنهای با بیان متفاوت در بین نژادهای خالص و آمیخته سیستانی و مونتبیلیارد بود. در این مطالعه، از نتایج تجزیه بیان ژن افتراقی با استفاده از فنآوری RNA-Seq مربوط به نژادهای خالص و آمیخته سیستانی و مونتبیلیارد (دو تیمار و هر تیمار دو تکرار بیولوژیک) استفاده شد. به همین منظور پس از تعیین نواحی ORF برای این ژنها، از نرمافزار CodonW جهت برآورد شاخصهای الگوی ترجیح کدونی ازجمله CAI، ENC، GC و GC3s استفاده شد. تجزیه ترجیح کدونی برای نواحی ORF ژنهای با بیان متفاوت، وجود همبستگی بالا و معنیداری (0/74) بین مقادیر شاخص GC کل و GC3s نشان داد. همچنین همبستگی بالا و معنیداری بین مقادیر ENC با GC کل و GC3sTو (0/65و0/77) مشاهده شد که نشاندهندهی نقش جهش در شکلگیری کدونها میباشد. بر اساس نتایج بدست آمده در این پژوهش، عواملی ازجمله مقدار GC، جهش و سطح بیان ژن نقش مهمی در شکلگیری کدونها در ژنهای موردمطالعه در این تحقیق داشتند. این مطالعه اولین مقایسه بین گاوهای خالص و آمیخته سیستانی و مونتبیلیارد میباشد که به درک بهتر ساز وکارهای تکاملی شکلگیری الگوی ترجیح کدونی و نیز بررسی ارتباط آن با بیان ژن کمک میکند. | ||
کلیدواژهها | ||
گاو آمیخته سیستانی و مونتبیلیارد؛ ژنهای متفاوت بیان شده؛ ترجیح کدونی؛ گاو خالص سیستانیRNA-Seq | ||
مراجع | ||
1. Barazandeh A, Mohammadabadi MR, Ghaderi M and Nezamabadipour H (2016) Predicting CpG islands and their relationship with genomic feature in cattle by hidden Markov model algorithm. J. App. Anim. Sci. 6: 571579. (in Persian) | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 542 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 400 |