سامانه پشتیبانی خدمات اطلاعات

  اخبار و اعلانات

 آمار

تعداد نشریات161
تعداد شماره‌ها6,572
تعداد مقالات71,005
تعداد مشاهده مقاله125,494,138
تعداد دریافت فایل اصل مقاله98,754,706
سلیمی, فاطمه, جوان نیکخواه, محمد, پاداشت دهکایی, فریدون, علیزاده, علیرضا, سلطانلو, حسن, یوسفی راد, ساره. (1397). پویایی قارچ Pyricularia oryzae در دو مرحلۀ بلاست برگی و گردن خوشه برنج، بر اساس ارزیابی ساختار ژنتیک جمعیت‌ها در سطح ‏های برگ، پنجه و مزرعه. , 49(2), 187-201. doi: 10.22059/ijpps.2018.214616.1006733
فاطمه سلیمی; محمد جوان نیکخواه; فریدون پاداشت دهکایی; علیرضا علیزاده; حسن سلطانلو; ساره یوسفی راد. "پویایی قارچ Pyricularia oryzae در دو مرحلۀ بلاست برگی و گردن خوشه برنج، بر اساس ارزیابی ساختار ژنتیک جمعیت‌ها در سطح ‏های برگ، پنجه و مزرعه". , 49, 2, 1397, 187-201. doi: 10.22059/ijpps.2018.214616.1006733
سلیمی, فاطمه, جوان نیکخواه, محمد, پاداشت دهکایی, فریدون, علیزاده, علیرضا, سلطانلو, حسن, یوسفی راد, ساره. (1397). 'پویایی قارچ Pyricularia oryzae در دو مرحلۀ بلاست برگی و گردن خوشه برنج، بر اساس ارزیابی ساختار ژنتیک جمعیت‌ها در سطح ‏های برگ، پنجه و مزرعه', , 49(2), pp. 187-201. doi: 10.22059/ijpps.2018.214616.1006733
سلیمی, فاطمه, جوان نیکخواه, محمد, پاداشت دهکایی, فریدون, علیزاده, علیرضا, سلطانلو, حسن, یوسفی راد, ساره. پویایی قارچ Pyricularia oryzae در دو مرحلۀ بلاست برگی و گردن خوشه برنج، بر اساس ارزیابی ساختار ژنتیک جمعیت‌ها در سطح ‏های برگ، پنجه و مزرعه. , 1397; 49(2): 187-201. doi: 10.22059/ijpps.2018.214616.1006733

پویایی قارچ Pyricularia oryzae در دو مرحلۀ بلاست برگی و گردن خوشه برنج، بر اساس ارزیابی ساختار ژنتیک جمعیت‌ها در سطح ‏های برگ، پنجه و مزرعه

دانش گیاهپزشکی ایران
مقاله 3، دوره 49، شماره 2، اسفند 1397، صفحه 187-201    اصل مقاله (779.94 K)
نوع مقاله: مقاله پژوهشی
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijpps.2018.214616.1006733
نویسندگان
فاطمه سلیمی1؛ محمد جوان نیکخواه* 2؛ فریدون پاداشت دهکایی3؛ علیرضا علیزاده4؛ حسن سلطانلو5؛ ساره یوسفی راد6
1دانشجوی دکتری، گروه گیاه‌پزشکی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
2استاد، گروه گیاه‌پزشکی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج
3استادیار، بخش تحقیقات گیاه‌پزشکی، مؤسسه تحقیقات برنج کشور، رشت
4استادیار، گروه گیاه‌پزشکی، دانشگاه شهید مدنی آذربایجان، تبریز، ایران
5دانشیار، گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه گرگان
6دانشجوی دکتری، گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه گرگان
چکیده
به‌منظور ارزیابی پویایی قارچ Pyricularia oryzaeدر دو مرحلۀ بلاست برگی و گردن خوشه برنج، ساختار ژنتیکی جمعیت‌ها برای 142 جدایه در یک مزرعه و در سه سطح با استفاده از نشانگر مولکولی SSR و پنج ترکیب آغازگر موردبررسی قرار گرفت. جدایه‌های موردپژوهش از دو مرحلۀ بلاست برگی و بلاست گردن خوشه و در سه سطح جمع‌آوری شدند. در سطح اول جدایه‌های به‌دست‌آمده از دو مرحلۀ بلاست برگی و بلاست گردن خوشه از یک مزرعه، مورد تجزیه‌وتحلیل قرار گرفتند. سطح دوم به جدایه‌های دو جمعیت برگ و گردن خوشه که از پنجه‌های یک بوته برنج به‌دست‌آمده بودند، تعلق داشتند و سطح سوم بررسی را نیز جدایه‌های سه جمعیت جداشده از سه لکۀ مجزا در سطح یک برگ از یک بوته برنج به خود اختصاص دادند. بر اساس فنوگرام تنوع ژنتیکی رسم شده، تمامی 142 جدایۀ بررسی‌شده تشابه ژنتیکی 89 تا 100درصد را نشان دادند. برآوردهای ژنتیکی در سه سطح موردبررسی به ترتیب میانگین جریان ژنی 62/57، 68/10 و 783/4 را بین جدایه‌های بررسی‌شده نشان دادند. ردیابی ایدیومورف‌های تیپ آمیزشی 142 جدایه با روش Multiplex PCR نشان داد که همۀ جدایه‌ها دارای ایدیومورف MAT1-1 هستند. این برآمدنشان‌دهندۀ عدم رخداد تولیدمثل جنسی و بیان‌کنندۀ این است که تکثیر جمعیت‌های قارچ در سطح مزارع برنج در استان گیلان فقط به صورت غیرجنسی رخ می‌دهد. تنوع ژنتیکی کم و شباهت ژنتیکی زیاد جمعیت‌های عامل بیماری بلاست برنج در استان گیلان نیز این استنتاج را تایید می‌کنند.
کلیدواژه‌ها
بلاست برنج؛ تیپ آمیزشی؛ جریان ژنی؛ نشانگر مولکولی
مراجع
  1. Bonman, J. M., Estrada, B. A. & Bandong, J. M. (1989). Leaf and neck blast resistance in tropical lowland rice cultivars. Plant Disease, 73, 388-390.
  2. Chen, D., Zeigler, R. S., Leung, H. & Nelson, R. J. (1995). Population structure of Pyricularia grisea at two screening sites in the Philippines. Phytopathology, 85, 1011-1020.
  3. Couch, B. C. & Khohn, M. L. (2002). A multilocus gene genealogy concordant with host preference indicate segregation of a new species, Magnaporthe oryzae from Magnaporthe grisea. Mycologia, 94, 683-693.
  4. Don, L. D., Tosa, Y., Nakayashiki, H. & Mayama, S. (1999). Population structure of the rice blast fungus in Vietnam. Annals of the Phytopathological Society of Japan, 65, 475-479.
  5. Ellis, M. B. (1971). Dematiaceous Hyphomycetes. Commonwealth Mycological Institute, 608 p, Kew, England.
  6. Ellis, M. B. (1976). More Dematiaceous Hyphomycetes. Commonwealth Mycological Institute, 507 p, Kew, England.
  7. Estoup, A. & Guillemaud, T. (2010). Reconstructing routes of invasion using genetic data: why, how and so what?. Molecular Ecology, 19, 4113-4130.
  8. Fisher, R. A. (1930). The Genetical Theory of Natural Selection (1st ed.). Clarendon Press, Oxford.UK.
  9. George, M. L. C., Nelson, R. J., Zeigler, R. S. & Leung, H. (1998). Rapid population analysis of Magnaporthe grisea by using rep-PCR and endogenous repetitive DNA sequences. Phytopathology, 88, 223-229.
  10. Ghatak, A., Willocquet, L., Savary, S. & Kumar, J. (2013). Variability in aggressiveness of rice blast (Magnaporthe oryzae) isolates originating from rice leaves and necks: a case of pathogen specialization?. PLoS ONE, 8(6), e66180.
  11. Hemmati, R., Javan-Nikkhah, M., Okovvat, S. M. & Ghazanfari, K. (2005). Study on genetic diversity of Magnaporthe grisea using PCR and determination of the mating type alleles distribution in Mazandaran province, Iran. Communications in Agricultural and Applied Biological Sciences,70(3), 311-313.
  12. Javan-Nikkhah, M., McDonald, B. A. & Banke, S. (2004). Genetic structure of Iranian Pyricularia grisea population based on rep-PCR fingerprinting. European Journal of Plant Pathology, 110, 909-919.
  13. Kang, S., Chumley, F. G. & Valent, B. (1994). Isolation of the mating-type genes of the phytopathogenic fungus Magnaporthe grisea using genomic subtraction. Genetics, 138, 289-296.
  14. Keller, S. M., McDermott, J. M., Pettway, R. E., Wolfe, M. S. & McDonald, B. A. (1987). Gene flow and sexual reproduction in the wheat glume blotch pathogen Phaeesospharia nodorum (anamorph Stagonospora nodorum). Phytopathology, 87, 353-358.
  15. Kumar, J., Nelson, R. J. & Zeigler, R. S. (1999). Population structure and dynamics of Magnaporthe grisea in the Indian Himalayas. Genetics, 152, 971-984.
  16. Levy, M., Romao, J., Marchetti, M. A. & Hamer, J. E. (1991). DNA fingerprinting with a dispersed repeated sequence resolves pathotype diversity in the rice blast fungus. Plant Cell, 3, 95-102.
  17. Liu, D., Coloe, S., Baird, R. & Pedersen, J. (2000). Rapid mini-preparation of fungal DNA for PCR. Journal of Clinical Microbiology, 38, 471.
  18. McDonald, B. A. & Linde, C. (2002). The population genetics of plant pathogens and breeding strategies for durable resistance. Euphytica, 124, 163-180.
  19. McDonald, B.A. (1997). The population genetics of fungi. Tools and techniques. Phytopathology, 87, 448-453.
  20. Mckenzie, E. H. C., Park, D., Bellgard, S. E. & Johnston, P. R. (2010). A new species of Pyricularia (Hyphomycetes) on cortoderia (Poaceae) in Newzealand. Mycosphere, 1, 223-228.
  21. Moumeni, A. & Leung, H. (2003). Genetic and molecular dissection of blast resistance in rice using RFLP, simple repeats and defense-related candidate gene markers. Iranian Journal of Biotechnology, 1, 47-54
  22. Mousanejad, S., Mohammadi Goltapeh, E. & Javan-Nikkhah, M. (2004). Study on the fertility status and the distribution of the mating type alleles in Magnaporthe grisea, causal agent of rice blast, in Guilan province. Iranian Journal of Plant Pathology, 40, 201-220.
  23. Noguchi, M.T., Yasuda, N. & Fujita, Y. (2007). Fitness characters in parasexual recombinants of the rice blast fungus, Pyricularia oryzae. Japan Agricultural Research Quarterly, 41, 123-131.
  24. Ou, S. H. (1985). Rice Disease (2nd ed.). Commonwealth Agricultural Bureaux. 308 pp.
  25. Peakall, R. & Smouse P. E. (2006). GENALEX 6: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research. Molecular Ecology Notes, 6, 288-295.
  26. Piotti, E., Rigano, M. M., Rodino, D., Rodolfi, M., Castiglione, S., Picco, A. M. & Sala, F. (2005). Genetic structure of Pyricularia grisea (Cooke) Sacc. isolates from Italian paddy fields. Journal of Phytopathology, 153, 80-86.
  27. Safari motlagh, M. R., Hbibi, F. & Ebadi, A. A. (2015). Genetic diversity of Pyricularia grisea, the causal agent of rice blast by SSR. Acta Scientiarum Polonorum., Hortorum Cultus, 14(1), 15-28.
  28. Salimi, F., Javan-Nikkhah, M., Padasht Dehkayi, F. & Alizadeh, A. (2014). Genetic diversity of Magnaporthe oryzae isolates at the leaf and panicle neck stages in the same rice field. 21st Iranian Plant Protection Cogress. August, 23-26, Urmia University, Urmia, Iran. (in Farsi)
  29. Sharif, Gh. & Ershad, J. (1966). A list of infecting fungi on crops, trees and shrubs in Iran. Institute of Pest and Disease Research of Iran, Tehran, Iran. (in Farsi)
  30. Shannon, C. E. & Weaver, W. (1949). The mathematical theory of communication. The University of Illinois. Urbana, Chicago, London. pp. 3–24.
  31. Silva, G. B., Prabhu, A. S., Filippi, M. C. C., Trindade, M. G., Araújo, L. G. & Zambolim, L. (2009). Genetic and phenotypic diversity of Magnaporthe oryzae from leaves and panicles of rice in commercial fields in the State of Goiás, Brazil. Tropical Plant Pathology, 34(2), 77-86.
  32. Suzuki, F., Arai, M. & Yamaguchi, J. (2006). DNA fingerprinting of Pyricularia grisea by rep-PCR using single primers designed from the terminal inverted repeat of each of the transposable elements Pot2 and MGR586. Journal of General Plant Pathology, 72, 314-317.
  33. Suzuki, F., Arai, M. & Yamaguchi, J. (2007). Genetic analysis of Pyricularia grisea population by rep-PCR during development of resistance to scytalone dehydratase inhibitors of melanin biosynthesis. Plant Disease, 91, 176-184.
  34. Suzuki, F., Fuji, S., Koba, A., Nakajima, T. & Arai, M. (2012). Analysis of genetic diversity and population structure in Pyricularia oryzae collected from western Japan using SSR markers. Japanese Journal of Phytopathology, 78, 10-17.
  35. Tharreau, D., Fudal, I., Andriantsimialona, D., Santoso, U., Tami, D., Fournier, E., Lebrun, M. H. & Notteghem, J. L. (2009). World population structure and migration of the rice blast fungus, Magnaporthe oryzae. In: G. L. Wang, B. Valent, (eds.) Advances in genetics, genomics and control of rice blast disease. (pp. 209-215).Dordrecht, the Netherlands, Springer.
  36. Tosa, Y., Osue, J., Oh, H. S., Nakayashiki, H., Mayama, S. & Leong, S. A. (2005). Evolution of an avirulence gene, AVR 1-C O 3 9, concomitant with the evolution and differentiation of Magnaporthe oryzae. Molecular Plant Microbe Interactions, 18: 1148-1160.
  37. Tredway, L., Stevenson, P. K. L. & Burpee, L. L. (2005). Genetic Structure of Magnaporthe grisea populations associated with St. augustinegrass and tall fescue in Georgia. Phytopathology, 95(5), 463-471.
  38. Xue, M., Yang, J., Li, Z., Hu, S., Yao, N. & Dean, R. A. (2012). Comparative analysis of the genomes of two field isolates of the rice blast fungus Magnaporthe oryzae. PLoS Genetics, 8, e1002869.
  39. Zarrinnia, V., Javan-Nikkhah, M., Zamanizadeh, H. R., Mehrabi, R. & Khosravi, V. (2011). An investigation of the pathogenicity characteristics of Magnaporthe grisea isolates collected from different host plants from the family Poaceae and race determination of the pathogenic isolates. Iranian Journal of Plant Protection, 42, 179-190. (in Farsi)
  40. Zeighler, R. S., Thome, J., Levy, M. & Correa-Victoria, F. (1994). Linage exclusion: A proposal for linking blast population analysis to resistance breeding. In: R. S. Zeighler, S. A. Leong and P. S. Teng. Rice Blast Disease. (pp. 267-292). Commonwealth Agricultural Bureau International, Wallingford, UK.
آمار
تعداد مشاهده مقاله: 577
تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 456





سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب