پویش ژنگان کل برای تعیین جایگاههای تحت انتخاب مثبت در گوسفندان نژاد زندی | ||
| علوم دامی ایران | ||
| مقاله 6، دوره 48، شماره 4، زمستان 1396، صفحه 533-548 اصل مقاله (1008.77 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2017.229950.653520 | ||
| نویسندگان | ||
| حسین محمدی1؛ سید عباس رافت2؛ حسین مرادی شهربابک* 3؛ جلیل شجاع4؛ محمد حسین مرادی5 | ||
| 1دانشجوی دکتری گروه علوم دامی، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه تبریز | ||
| 2استاد گروه علوم دامی، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه تبریز | ||
| 3استادیار گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج | ||
| 4گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز. | ||
| 5استادیار گروه علوم دامی، دانشکدۀ کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک | ||
| چکیده | ||
| شناسایی مناطق ژنگانی (ژنوم) که هدف انتخاب بودهاند، یکی از راهکارهای اصلی تحقیقات زیستی است. هدف این پژوهش، پویش کل ژنگان برای شناسایی مناطقی از ژنگان گوسفندان نژاد زندی که در طی سالهای مختلف هدف انتخابهای طبیعی یا مصنوعی قرار گرفتهاند، بود. بدین منظور 96 رأس گوسفند نژاد زندی با استفاده از آرایههای ژنگانی Illumina ovine SNP50K BeadChip تعیین ژنوتیپ شدند. برای شناسایی نشانههای انتخاب بر پایۀ روشهای نداشتن تعادل پیوستگی (لینکاژی) از آزمون (iHS)integrated haplotype score استفاده شد. نتایج یازده منطقۀ ژنگانی روی کروموزومهای 1 (2 منطقه)، 3، 6، 7، 8، 9، 10، 17، 22 و 26 را شناسایی کرد. تجزیهوتحلیل دادههای زیستی (بیوانفورماتیکی) نشان داد، برخی از این مناطق ژنگانی بهطور مستقیم و غیرمستقیم با ژنهای مؤثر بر سازگاری (آداپتاسیون) به آبوهوای گرم و خشک (DNAJB4، HSPA4L، MSRB3)، پاسخ ایمنی (IL23A، STAT6، LY96)، توسعه و اندازۀ بدن (STAC3، LAP3)، توسعۀ نظام ساختار بدنی یا اسکلتی (SPP1، MEPE، IBSP) و سوختوساز (متابولیسم) انرژی (ATP5B، GLS2، CS) همپوشانی دارند. درنهایت بررسیQTLهای گزارششده در ژنگان گوسفند نشان داد، این مناطق با QTLهای صفات مهم اقتصادی از جمله صفات مرتبط با رشد، لاشه و پشم در ارتباط است. بههرحال، برای شناسایی دقیق این ژنها و QTLها لازم است بررسیهای پیوستگی و عملکردی بیشتری انجام شود. | ||
| کلیدواژهها | ||
| آزمونiHS؛ پویش ژنگانی؛ سازگاری؛ شناسایی نشانههای انتخاب | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 880 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 820 |
||