تعداد نشریات | 161 |
تعداد شمارهها | 6,573 |
تعداد مقالات | 71,033 |
تعداد مشاهده مقاله | 125,502,896 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 98,767,078 |
بررسی تنوع ژنتیکی گردوی ایرانی (Juglans regia L.) با نشانگرهای SSR | ||
نشریه جنگل و فرآورده های چوب | ||
مقاله 6، دوره 69، شماره 2، شهریور 1395، صفحه 277-286 اصل مقاله (955.09 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/jfwp.2016.59043 | ||
نویسندگان | ||
آیدا طاهری؛ نسرین سیدی* ؛ بابک عبدالهی مندولکانی | ||
دانشگاه ارومیه | ||
چکیده | ||
تعیین میزان تنوع ژنتیکی در مواد گیاهی اولین گام برای شناسایی، حفظ و نگهداری ذخایر توارثی و اساس تحقیقات ژنتیکی و برنامههای اصلاحی است. استفاده از نشانگرهای مولکولی یکی از ابزارهای مهم در ارزیابی تنوع ژنتیکی گیاهان بومی است. در این پژوهش تنوع ژنتیکی 62 نهال گردوی ایرانی با استفاده از 10 جفت آغازگر SSR مطالعه شد. ده مکان SSR در مجموع 53 آلل تولید کرد. کمترین و بیشترین تعداد آلل، بهترتیب مربوط به مکانهای 69WGA، 71WGA (4 آلل) و 1WGA (7 آلل) بود. بیشترین میزان هتروزیگوتی مشاهدهشده توسط مکان 276WGA ثبت شد. همۀ مکانهای SSR در نهالهای بررسیشده انحراف معنیداری (01/0 ≥p ) از تعادل هاردی- واینبرگ نشان دادند. تجزیۀ خوشهای به روش UPGMA براساس ضرایب تشابه دایس، نهالهای بررسیشده را به چهار گروه اصلی تقسیم کرد. بررسی ساختار جمعیت با نرمافزار 2.3.1 Structure، دو گروه (2K=) احتمالی را شناسایی کرد. اطلاعات حاصل براساس ماتریس سهم عضویت افراد و میزان Fst نشان داد که تمایز چشمگیری بین زیرگروههای احتمالی وجود ندارد. از اطلاعات حاصل از این تحقیق میتوان در برنامههای اصلاحی تولید هیبرید در گردو برای شناسایی نهالهای دارای فاصلۀ ژنتیکی کافی بهمنظور بهرهبرداری از هتروزیس مفید باشد. | ||
کلیدواژهها | ||
تعادل هاردی-واینبرگ؛ تنوع ژنتیکی؛ گردوی ایرانی؛ نرم افزار Structure | ||
مراجع | ||
[1]. Gerard, W.K., Crocker, T.F., and Bertrand, P.F. (2003). Minor Fruits and Nuts in Georgia. University of Georgia, 214 p.
[2]. Ducci, F., Rogatis, A., and Proietti, R. (1997). Protezione delle risorse genetiche di Juglans regia L. Annali Istituto Sperimentali Selvicultura, 26: 35–55.
[3]. McGranahan, G.H., Charles, A., Leslie, C.A., Philips, H.A., and Dandaker, A. (1998). Walnut Propagation. In: D. Ramos (ed.), Walnut Production Manual, University of California, DANRPubl., Davis, pp 71-83.
[4]. Sehgal, D., and Raina, S.N. (2008). DNA markers and germplasm resource diagnostics: new perspectives in crop improvement and conservation strategies. In: Arya ID, Arya S (eds) Utilization of biotechnology in plant sciences. Microsoft Printech (I) Pvt. Ltd, Dehradun, pp 39–54.
[5]. Vahdati, K., and Zareie, N. (2006). Evaluation of side-stub and hypocotyle grafting efficiency for walnut propagation in Iran. Acta Horticulturae, 705: 175-179.
[6]. Ruiz-Garcia, L., Lopez-Ortega, G., Fuentes Denia, A., and Frutos Tomas, D. (2011). Identification of a walnut (Juglans regia L.) germplasm collection and evaluation of their genetic variability by microsatellite markers. Spanish Journal of Agricultural Research, 9(1): 179-192.
[7]. Aly, M.M., Robert, A., Fjellstrom, G., McGranahan, G.H., and Parfitt, E. (1992). Origin of walnut somatic embryos determine by RFLP and Isozyme analysis. Hort Science, 27(1): 61-63.
[8]. Niceses, F.P., Hormaza, J.I., and McGranahan, G.H. (1998). Molecular characterization and genetic relatedness among walnut (Juglans regia L.) genotypes based on RAPD markers. Euphytica, 101:199-206.
[9]. Bayazit, S., Kazan, K., Golbitti, S., Cevik, V., Ayanogla, H., and Ergul, A. (2007). AFLP analysis of genetic diversity in low chill requiring walnut (Juglans regia L.) genotyping from Hatay. Turkey, Scientia Horticulturae, 111: 394-398.
[10]. Foroni, I., Woeste, K., Monti, L.M., and Rao, R. (2007). Identification of ‘Sorrento’ walnut using simple sequence repeats (SSRs). Genetic Resources and Crop Evolution, 54:1081-109.
[11]. Nazeer Ahmed, J.I.M., ReyazulRouf, M., Nazir Ahmad, R., Rizwan, R., Shabir, H., Wani WajidaShafi Hidayatullah, M., and Sheikh, M.A. (2012). SSR and RAPD analysis of genetic diversity in walnut (Juglans regia L.) genotypes from Jammu and Kashmir, India. Physiology and Molecular Biology of Plants, 18(2): 149–160.
[12]. Mahmoodi, R., Rahmani, F., and Rezaee, R. (2013). Genetic diversity among Juglans regia L. genotypes assessed by morphological traits and microsatellite markers. Journal of Agricultural Research, 11(2), 431-437.
[13]. Dangl, G.S., Woeste, K.E., Aradhya, M.K., Koehmstedt, A., Simon, C., Potter, D., Leslie, C.A., and McGranahan, G.H. (2005). Characterization of fourteen microsatellite markers for genetic analysis and cultivar identification of walnut. Journal of the American Society for Horticultural Science, 130(3): 348-354.
[14]. Peakall, R., and Smouse, P.E. (2006). GENALEX 6.4: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research. Molecular Ecology Notes, 6: 288 -295.
[15]. Rohlf, F.J. (1998). NTSYSpc: Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System Version 2.0. Setauket, New York.
[16]. Pritchard, J.K., Stephens, M., and Donnelly, P. (2000). Inference of population structure using multilocus genotype data. Genetics, 155:945-959.
[17]. Foroni, I., Woeste, K., Monti, L.M., and Rao, R. (2006). Identification of ‘Sorrento’ walnut using simple sequence repeats (SSRs). Genetic Resources and Crop Evolution, 85: 311-321.
[18]. Victory, E.R., Glaubitz, J.C., Rhodes, O.E., and Woeste, K.E. (2006). Genetic homogeneity in Juglans nigra (Juglandaceae) at nuclear microsatellites. American Journal of Botany, 93:118-126.
[19]. Karimi, R., Ershadi, A., and Vahdati, K. (2008). Analysis of Genetic Diversity Among Some Persian Walnut Populations of Hamedan Province Using SSR Markers. Plant Production Technology, 9(2): 43-53. (In Farsi).
[20]. Fornari, B., Malvolti, M.E., Taurchini, D., Fineschi, S., Beritognolo, I., McCaglia, E., and Cannata, F. (2001). Isozym and organellar DNA analysis of genetic diversity in natural/naturalised European and Asiatic walnut (Juglans regia L.) populations. ActaHorticulturae, 544: 167-178. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,099 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 703 |