پویش کل ژنوم هشت نژاد گاو بومی ایران برای شناسایی نشانه های انتخاب | ||
| تولیدات دامی | ||
| مقاله 1، دوره 18، شماره 2، 1395، صفحه 201-213 اصل مقاله (3.81 M) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/jap.2016.55320 | ||
| نویسندگان | ||
| نادر فروغ عامری* 1؛ مسعود اسدی فوزی2؛ علی اسمعیلی زاده کشکوئیه3 | ||
| 1دانشجوی دکتری، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران | ||
| 2دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران | ||
| 3استاد، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان، کرمان، ایران | ||
| چکیده | ||
| در تحقیق حاضر، قسمتهایی از ژنوم گاوهای بومی ایران که شواهدی از انتخاب برای جهشهای مختلف را نشان میدهند، شناسایی شد. بدین منظور از دادههای 777962 نشانگر چندشکلی تکنوکلئوتید پراکنده در سرتاسر ژنوم و 90 حیوان از هشت نژاد گاو بومی ایران (سرابی، کرمانی، سیستانی، نجدی، کردی، تالشی، پارس و مازندرانی) برای شناسایی نشانههای انتخاب استفاده شد. بررسی تمایز جمعیتی با استفاده از روش شاخص تثبیت (Fst) تصحیح شده برای اندازه نمونه (θ) نشان داد که در چندین مکان ژنی شواهدی از انتخاب در این هشت نژاد وجود دارد. در طول 30 کروموزوم گاو، تعداد هفت ناحیه ژنومی شناسایی شد که نشانههای انتخاب در آنها وجود داشت. این نواحی بر روی کروموزومهای یک، دو، هفت، هشت، 12، 13 و X واقع بودند. بررسی ژنها و QTL های پیشین گزارش شده در مکانهایی از ژنوم گاو که تحت تأثیر انتخاب بودهاند، نشان داد که این مکانها با ژنها و QTL های صفات مهم اقتصادی نظیر صفات مرتبط با تولید و اجزای شیر، وزن بدن، مقاومت به سرما و صفات تولیدمثل مرتبط هستند. نتایج تحقیق حاضر، اطلاعات مفیدی از وجود تنوع ژنتیکی و نشانه های انتخاب در گاوهای بومی ایران فراهم کرد. | ||
| کلیدواژهها | ||
| تفرق جمعیت؛ شاخص تثبیت؛ کاوش ژنومیک؛ گاو بومی ایران؛ نشانه انتخاب | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 2,606 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 2,148 |
||