تعداد نشریات | 161 |
تعداد شمارهها | 6,532 |
تعداد مقالات | 70,502 |
تعداد مشاهده مقاله | 124,117,376 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 97,222,920 |
مقایسه حساسیت دو روش RT-PCR و RRT-PCR برای تشخیص ویروس بیماری نیوکاسل در طیور | ||
مجله تحقیقات دامپزشکی (Journal of Veterinary Research) | ||
مقاله 3، دوره 70، شماره 3، مهر 1394، صفحه 255-261 اصل مقاله (1.61 M) | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/jvr.2015.55266 | ||
نویسندگان | ||
سمیه ستاری1؛ شیدا ورکوهی* 2؛ محمد حسین بنابازی3؛ میثم طباطبایی پژوه4 | ||
1گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه رازی | ||
2گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی دانشگاه رازی، کرمانشاه-ایران | ||
3بخش پژوهشهای بیوتکنولوژی، موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، کرج-ایران | ||
4پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی ایران، کرج - ایران | ||
چکیده | ||
زمینه مطالعه: بیماری نیوکاسل یکی از مخرب ترین بیماریهای ویروسی طیور در سرتاسر جهان است. هدف: با توجه به اینکه روشهای سنتی قابلیت محدودی در کنترل این بیماری دارند، انجام این مطالعه به منظور استفاده از تکنولوژیهای نوین برای تشخیص به موقع بیماری جهت کاهش خسارت پیش روی صنعت طیور میباشد. روش کار: استخراج RNA با استفاده از کیت RNease mini و بر اساس دستورالعمل شرکت سازنده انجام شد. RNA استخراج شده با 109×23/68 رونوشت اولیه به صورت سری رقتهای µL100، برای انجام واکنش RT-PCRو RRT-PCR تهیه شد. واکنش RT-PCR با استفاده از کیت RNease mini و واکنش RRT-PCR با استفاده از کیت تجاری (شرکت Genekam Biotechnology ،آلمان) انجام شد. نتایج: برای روش RRT-PCR تا سری رقت تهیه شده 34-10 تکثیر صورت گرفت و برای روش RT-PCR تا سری رقت تهیه شده 20- 10 بر روی ژل آگارز 5/1٪ باند مشاهده شد. براساس نتایج مشاهده شده روش RRT-PCR قادر به تشخیص 34-10×1رونوشت و روش RT-PCR قادر به تشخیص 20-10×1 رونوشت از نمونه اولیه است. نتیجهگیرینهایی: حساسیت روش RRT-PCR تقریباً دو برابر روش RT-PCR است و در مقایسه با روش RT-PCR، قادر به تشخیص ویروس بیماریزای نیوکاسل در نمونههای آلودهای با 10000 برابر رونوشت کمتر از RNA ویروسی میباشد. | ||
کلیدواژهها | ||
ویروس بیماری نیوکاسل؛ تشخیص؛ RRT-PCR؛ RT-PCR؛ حساسیت | ||
مراجع | ||
Aghakhan, S.M., Abshar, N., Fereidouni, S.R., Marunesi, C., Khodashenas, M. (1994) Studies on avian viral infectious in Iran. Arch Razi Inst. 44: 1-5. Alexander, D.J. (2003) Newcastle disease, other avian paramyxoviruses, and pneumovirus infections In: Diseases of Poultry. B.W. Calnek, H.J., Barnes, C.W., Beard, W. M., Reid and H. W., Yoder, Jr. (eds.). (11th ed.) Iowa State University Press. p. 63-99. Alexander, D.J., Senne, D.A. (2008) Newcastle Disease, Other Avian Paramyxoviruses and Pneumovirus Infections. In: Diseases of Poultry. Saif, Y.M. (ed.). (12th ed.). Blackwell, Ames, Iowa, USA. p. 75-115. AL-Garib, S.O., Gielkens, A.L.J., Gruys, E., Koch, G. (2003) Review of Newcastle disease virus with particular references to immunity and vaccination. J World’s Poult Res. 59: 185-200. Ballagi, Wehmann, A., Herczeg, E., Belak, J., Lomniczi, S.B. (1997) The structure of the fusion glycoprotein of Newcastle disease virus suggests a novel paradigm for the molecular mechanism of membrane fusion. Arch Virol. 141: 243-261. Beard, C.W., Wilkes, W.J. (1985) A comparison of Newcastle disease haemagglutination test results from diagnostic laboratories in the southeastern United States. Avian Dis. 29: 1048-1056. Enders, K.O.N., Peter, K.C.C., Antia, Y.Y.N., Hoang, T.L., Wilina, W.L.L. (2005) Influenza AH5N1 detection”. EmerInf Dis. 11: 1303-1305. Ferrira, L., Villar, E., Munoz-Barroso, I. (2004) Conformational changes of Newcastle disease virus envelope glycoproteins triggered by gangliosides. Eur J Biochem. 271: 581-588. Gravel, K.A., Morrison, T.G. (2003) Interacting domains of the hemagglutinin-neuramini-dase and fusion proteins of newcastle disease virus. J Virol Method. 77: 11040-11049. Guan, M.K., Cheng, H.L., Liang, Y.K., Wen, T.J., Chulu, J.L., Liao, M.H., Chang, T.J., Liu, H.J. (2006) Development of a quantitative Light Cycler real-time RT-PCR for detection of avian reovirus. J Virol Method. 133: 6-13. Hairul, A.H., Omar, A.R., Mohd Hair-Bejo, Ideris, A. (2004) Comparison of SybrGreen I, ELISA and conventional agarose gel-based PCR in the detection of infectiousbursal disease virus.Microbiol Res. 163: 556-63. Kant, A., Koch, G., VanRoozelaar, D.J., Balk, F., TerHuurne, A. (1997) Differentintion of virulent and non- virulent strain of Newcastle Disease virus within 24 hours polymerase chain reaction. Avian Pathology. 26: 837-849. Kho, C.L., Mohd, M.L., Arshad, S.S., Yusoff, K. (2000) performance of an RT-nested PCR –ELISA for detection of Newcastle disease virus. J Virol Method. 86: 71-83. Kovics, S., Horvath, J. (2000) Newcastle disease virus (NDV): brief history of its oncolytic strains. J ClinVirol. 16: 1-15. Liu, H., Zhao, Y., Zheng, D., Lv, Y., Zhang, W., Xu, T., Li, J., Wang, Z. (2011) Multiplex RT-PCR for rapid detection and differentiation of class I and class II Newcastle disease viruses. J Virol Method. 171: 149-155. Lu, B.L.W. (1982) Failure to detect hemagglutinationinhibiting antibodies with intact avian influenza virions. Infect Immunlogi J Annals Internal Med. 38: 530–535. Majed, H.M., AbdelAmeer, H.Z., Kadhim, L.I., Hasoon, M.F. (2013) Conventional and Molecular Detection of Newcastle Disease and Infectious Bursal Disease in Chickens. J World’s Poult. Res. 3: 5-12. Mass, R., Komen, M., Diepenvan, M., Oei, H.L., Classen, I.J.M. (2003) Correlation of haemagglutininneraminidase and fusion protein content with protective antibody response after immunization with inactivated Newcastle disease vaccines. Vaccine Journal Virology. 21: 3137-3142. Michelle, A., Lin, T.L., Wu, C.C. (2005) Real-timeRT-PCR differentiation and quantitation of infectious bursal disease virus strains using dual -labeled fluorescent probes. J Virological Method. 127: 87-95. Munir, M., Linde, A.M., Zohari, S., Stahl, K., Baule, C., Engstrom, B. (2011) Whole genomesequencing and characterization of a virulent Newcastle disease virus isolated from an outbreak in Sweden. Virus Genes. 43: 261-271. Nidzworski, D., Rabalski, L., Gramadzka, B. (2010) Detection and differentiation of virulent and avirulent strains of Newcastle disease virus by real-time PCR. J Virological Method. 173: 144-149. Pham, H.M., Konnai, S., Usui, T., Chang, K.S., Murata, S., Mase, M., Ohashi, K., Onuma, M. (2005) Rapid detection and differentiation of Newcastle disease virus by real-time PCR with melting-curve analysis. J Arch Virol. 150: 2429-2438. Seal, B.S., King, D.J., Locke, D.P., Senne, D.A., Jackwood, M.W. (1998) Phylogenetic relationships among highly virulent Newcastle disease virus isolates obtained from exotic birds and poultry from 1989 to 1996. Clinical Microbol. 36: 1141-1145. Semitanka, K., Minta, Z., Domanska, B.K. (2005) Detection of Newcastle Disease Virus in infected chicken embryos and chichen Tissues by RT-PCR. Bulletin Veterinary Institute in puawy. 50: 3-7. Sharawi, S., Al-Habeeb, M.A., Mohamed, M.H.A. (2013) Detection and characterization of Newcastle disease virus in clinical samples using real time RT-PCR and melting curve analysis based on matrix and fusion genes amplification. J Vet World. 10: 239-243. Stauber, N., Brechtbuhl, K., Brechner, L., Hofmann, M.A. (1995) Detection of Newcastle disease virus in poultry vaccines using the polymerase chain reaction and direct sequencing of amplified cDNA. J Clinical Virol. 13: 360-364. Soares, P.B.M., Demetrio, C., Sanfilippo, L., Kawanoto, A.H.N., Brentano, L., Durigon, E.L. (2005) Standardization of a duplex RT-PCR for the detection of Influenza A and Newcastle disease viruses in migratory birds. J Virol Method. 123: 125–130. Tevfik Dorak, M. (2006) Real-time PCR. Taylor & Francis e-Library New york, NY, USA. p. 333. Wang, X.J., Bai, Y.D., Zhang, G.Z., Zhao, J.X. (2005) Structure and Function Study of Paramyxovirus Fusion Protein Heptad Repeat Peptides. Arch Biochem Biophys. 436: 316-322. Wang, Z., Vreede, F.T., Mitchell, J.O., Viljoen, G.J. (2001) Rapid detection and differentiation of Newcastle disease virus isolates by a triple one-step RT-PCR. Onderstepoort. J Vet Res. 68: 131-134. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,804 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 4,791 |