شناسایی مناطق ژنومی مرتبط با قطر پشم در نژادهای گوسفند ایرانی | ||
| علوم دامی ایران | ||
| مقاله 9، دوره 46، شماره 1، 1394، صفحه 65-72 اصل مقاله (519.64 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2015.54592 | ||
| نویسندگان | ||
| مهدیه راستی فر1؛ اردشیر نجاتی جوارمی* 2؛ محمد حسین مرادی3؛ رستم عبداللهی آرپناهی4 | ||
| 1دانشجوی کارشناسی ارشد، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج | ||
| 2دانشیار، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران و قطب علمی بهبود کمیت و کیفیت لاشة گوسفندان، کرج | ||
| 3استادیار، دانشکدة کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه اراک، اراک | ||
| 4استادیار، پردیس ابوریحان، دانشگاه تهران، پاکدشت | ||
| چکیده | ||
| هدف از این پژوهش پویش ژنوم گوسفند برای شناسایی جایگاههای مؤثر بر قطر پشم در نژادهای بومی کشور بود. برای این منظور نمونههای خون 94 حیوان، شامل 47 رأس از نژاد ایرانی زل و 47 رأس از نژاد ایرانی لریبختیاری تهیه شد و پس از استخراج DNA، نمونهها با استفاده از آرایههای Ovine 50k SNP Chip تعیین ژنوتیپ شدند. دادههای حاصل به منظور بررسی کیفی آنالیز شدند. پس از این مراحل، در نهایت مجموع 48056 نشانگر SNP مربوط به 90 حیوان آنالیز شدند. نمونة پشم این حیوانات نیز جمعآوری و صفات میانگین قطر الیاف و نسبت الیاف مساوی یا بیشتر از 30 میکرومتر، با استفاده از فناوری OFDA اندازهگیری شدند. در آنالیزهای آماری اثر عوامل ثابت گله، سال تولد و جنس حیوان بررسی شد. پس از شناسایی تأثیرات معنادار، آزمون پویش ژنومی در نرمافزار PLINK ارزیابی و برای کنترل نرخ اشتباه از تصحیح FDR استفاده شد. با در نظر گرفتن این نتایج در آنالیزهای پویش ژنومی، در مجموع سه جایگاه نشانگری روی کروموزومهای 1 و 6 با یک اثر معناداری روی صفت نسبت الیافی که مساوی یا بیشتر از 30 میکرومتر هستند، شناسایی شد (05/0p<). بررسی ژنهای شناساییشده در این مناطق نیز نشاندهندة وجود ژنهای مهم تأثیرگذار بر کیفیت پشم در این مناطق است. | ||
| کلیدواژهها | ||
| پویش ژنومی؛ جایگاههای صفات کمی؛ قطر پشم؛ گوسفند ایرانی | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 2,395 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,735 |
||