سامانه پشتیبانی خدمات اطلاعات

  اخبار و اعلانات

 آمار

تعداد نشریات161
تعداد شماره‌ها6,532
تعداد مقالات70,501
تعداد مشاهده مقاله124,108,013
تعداد دریافت فایل اصل مقاله97,212,671
درویش‌نیا, فاطمه, فاخری, براتعلی, نظریان فیروزآبادی, فرهاد, پنجکه, ناصر. (1394). بررسی تنوع ژنتیکی کلزا (Brassica napus L.) با استفاده از نشانگر‌های مولکولی SSR و ISJ. , 46(1), 1-14. doi: 10.22059/ijfcs.2015.54041
فاطمه درویش‌نیا; براتعلی فاخری; فرهاد نظریان فیروزآبادی; ناصر پنجکه. "بررسی تنوع ژنتیکی کلزا (Brassica napus L.) با استفاده از نشانگر‌های مولکولی SSR و ISJ". , 46, 1, 1394, 1-14. doi: 10.22059/ijfcs.2015.54041
درویش‌نیا, فاطمه, فاخری, براتعلی, نظریان فیروزآبادی, فرهاد, پنجکه, ناصر. (1394). 'بررسی تنوع ژنتیکی کلزا (Brassica napus L.) با استفاده از نشانگر‌های مولکولی SSR و ISJ', , 46(1), pp. 1-14. doi: 10.22059/ijfcs.2015.54041
درویش‌نیا, فاطمه, فاخری, براتعلی, نظریان فیروزآبادی, فرهاد, پنجکه, ناصر. بررسی تنوع ژنتیکی کلزا (Brassica napus L.) با استفاده از نشانگر‌های مولکولی SSR و ISJ. , 1394; 46(1): 1-14. doi: 10.22059/ijfcs.2015.54041

بررسی تنوع ژنتیکی کلزا (Brassica napus L.) با استفاده از نشانگر‌های مولکولی SSR و ISJ

علوم گیاهان زراعی ایران
مقاله 1، دوره 46، شماره 1، فروردین 1394، صفحه 1-14    اصل مقاله (964.99 K)
نوع مقاله: مقاله پژوهشی
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijfcs.2015.54041
نویسندگان
فاطمه درویش‌نیا1؛ براتعلی فاخری* 2؛ فرهاد نظریان فیروزآبادی3؛ ناصر پنجکه4
1دانشجوی سابق کارشناسی ارشد، گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه زابل
2دانشیار، گروه اصلاح نباتات و بیوتکنولوژی، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه زابل
3استادیار اصلاح نباتات، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه لرستان
4دانشیار بیماریهای گیاهی، گروه گیاهپزشکی، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه زابل
چکیده
به‌منظور بررسی تنوع ژنتیکی 21 رقم کلزا از 20 جفت آغازگر اختصاصی SSR و نیمه‌تصادفی ISJ استفاده شد. آغازگرها در مجموع 158 (05/81 درصد) باند چند­شکل (51 باند SSR و 107 باند ISJ) تولید کردند. متوسط تعداد باند چندشکل برای آغازگرهای ISJ، SSR و ترکیب آنها به‌ترتیب 7/10، 1/5 و 9/7 عدد برآورد شد. میزان اطلاعات چندشکلی (PIC) از 015/0 در آغازگر اختصاصی O110D08 تا 3420/0 در آغازگر نیمه‌اختصاصی ET15-33 متغیر بود. بین آغازگرهای نیمه‌اختصاصی IT و ET برای میزان چندشکلی تفاوت معنی‌داری مشاهده نشد. نمودار درختی حاصل از تجزیة خوشه­ای به‌روش UPGMA و ضریب تشابه دایس با استفاده از آغازگر­های ISJ، SSR و ترکیب آنها، ژنوتیپ‌های کلزا را به‌ترتیب در سه، شش و چهار گروه اصلی تقسیم‌ کرد. تنوع ژنتیکی از الگوی جغرافیایی تبعیت نمی­کرد و ژنوتیپ‌های ایرانی و خارجی در گروه‌های مجزا طبقه­بندی نشدند. این موضوع قرابت و خویشاوندی ژنوتیپ‌های ایرانی و خارجی را نشان ‌داد. دو رقم Licord و SLM096 با اینکه دارای منشأ یکسانی بودند، دو گروه مجزا را به خود اختصاص دادند و فاصلة ژنتیکی زیادی با سایر نمونه­ها داشتند. بنابراین در برنامه­های به‌نژادی آینده می­توان از آنها استفاده کرد.
 
کلیدواژه‌ها
تنوع ژنتیکی؛ کلزا؛ ISJ؛ SSR
مراجع
 

  1. Dellaporta, S. C., Wood, F. & Hicks, J. B. (1983). A Plant DNA minipreparation. Version II. Plant Mol. Biol. Rep., 1(4), 19- 21.
  2. Devos, K. M. & Gale, M. D. (1992). The use of random amplified polymorphic DNA markers in wheat. Theor Appl Genet, 84, 567-572.
  3. Dongre, A. B., Bhandarkar, M. & Banerjee, Sh. (2007). Genetic diversity in tetraploid and diploid cotton (Gossypium spp.) using ISSR and microsatellite DNA markers. Indian J. Biotechnol., 6, 349-353.
  4. Erlich, H. A. (1989). PCR Technology: Principle and Applications for DNA Amplification. Stockton Press, New York, USA.
  5. Gawel, M., Wisniewska, I. & Rafalski, A. (2002). Semi-specific PCR for evaluation of diversity among cultivars of Wheat and Triticale. Cell. Mol. Biol. Lett., 7, 577- 582.
  6. Food and Agriculture Organization (FAO). (2007). Available at http://www.faostat.fao.org /site/567/efault.aspx.Last access on 01.12.2008.
  7. Hasan, M., Seyis, F., Badani, A. G., Pons-Kuhnemann, J., Friedt, W., Luhs, W. & Snowdon, R. J. )2006). Analysis of genetic diversity in the Brassica napus L. gene pool using SSR markers. Genet. Resour. Crop Evol., 53, 793- 802.
  8. Junjian, N., Colowit, P. M. & Mackill, D. (2002). Evaluation of genetic diversity in rice subspecies by microsatellite markers. Crop Sci., 42, 601-607.
  9. Kashi, Y., King, D. & Soller, M. (1997). Simple sequence repeats as a source of a quantitative genetic variation. J. Trends Genet., 13(1), 74-78.
  10. Kimber, D. S. and McGregor D. I. (1995). Brassica Oilseed: Production and Utilization. CAB Intl., UK.
  11. Kumar, L. S. (1999). DNA marker in plant improvement. Biot. Adv., 17(2-3), 143-182.
  12. Lit, M. & Luty, J. A. (1989). A hypervariable microsatellite revealed by in vitro amplification of a dinucleotide repeat within the caradiac muscle actine gene. American J. Human Genet., 44(3), 397- 401.
  13. Manifesto, M. M., Schlatter, A. S., Hopp, H. E., Suarez, E. Y. & Dubcovky, J. (2001). Quantitative evaluation of genetic diversity germplasm using molecular markers. Crop Sci., 41, 682-690.
  14. Moghaddam, M., Mohammadi, S. A., Mohebalipour, N., Toorchi, M., Aharizad, S. & Javidfar, F. (2009). Assessment of genetic diversity in rapeseed cultivars as revealed by RAPD and microsatellite markers. African J. Biotech., 8 (14), 3160-3167.
  15. Moghaieb, R. E. A., Mohammed, E. H. K. & Youssief, S. S. (2014). Genetic diversity among some canola cultivars as revealed by RAPD, SSR and AFLP analyses. 3 Biot., 4, 403–410.
  16. Mohammadi, S. A. & Prasanna, B. M. (2003). Analysis of genetic diversity in crop plants: Salient statistical tools and consideration. Crop Sci., 43, 1235-1248.
  17. Nowoseielski, J., Podyma, W. & Sielska, D. N. W. (2002). Molecular research on the genetic diversity of Polish varieties and landraces of Phaseoluscocclineus L. and Phaseolus vulgaris L. using the RAPD and AFLP methods. Cell. Mol. Biol. Lett., 7, 753- 762.
  18. Odonougue, L. S., Souza, E., Tanksley, S. D. & Sorrell, M. E. (1999). Relationships among North American oat cultivars based on restriction fragment length polymorphism. Crop Sci., 34, 1251- 1258.
  19. Pejic, I., Ajmone-Marsan, P., Morgante, M., Kozumplick, V., Castiglioni, P., Taramino, G. & Motto, M. (1998). Comparative analysis of genetic similarity among maize inbred lines detected by RFLPs, RAPDs, SSRs and AFLPs. Theor. Appl. Genet., 97, 1248-1255.
  20. Plieske, J. & Struss, D. (2001). Microsatellite markers for genome analysis in Brassica. I. Development in Brassica napus and abundance in  Brassicaceae species. Theor. Appl.Genet., 102, 689- 694.
  21. Qu, C., Hasan, M., Lu, K., Liu, L., Liu, X., Xie, J., Wang, M., Lu, J., Odat, N., Wang, R., Chen, L., Tang, Z. & Li, J. (2012). Genetic diversity and relationship analysis of the Brassica napus germplasm using simple sequence repeat (SSR) markers. Afr J Biotechnol., 11(27), 6923–6933.
  22. Rafalski, A., Gidzinska, M. & Wisniewska, I. (1997). PCR-based system for evolution of relationships among Maize inbreebs. P: 106-111. Tsaftaries, A. S. (ed). Genetics and Biotechnology of Maize and Sorghom. Societyof Chemistry, Cambridge. UK.
  23. Rafalski, A., Madej, L., Wisniewska, I. & Gawelo, M. )2002). The genetic diversity of components of rye hybrids. Cell. Mol. Biol. Lett., 7, 471- 475.
  24. Rohlf, F. J. (1998). ntsys-pc. Numerical taxonomy and multivariate analysis system, version 2.5. Exeter Software, Setauket, NY.
  25. Saal, B., Plieske, J., Hu, J., Quiros, C. F. & Struss, D. (2001). Microsatellite markers for genome analysis in Brassica. II. Assignment of rapeseed microsatellites to the A and C genomes and genetic mapping in Brassica oleracea L. Theor. Appl.Genet., 102, 695- 699.
  26. Salahvarzi, E., Salahvarzi, A., and & Drikvand, R. (2013). Assessment of genetic diversity in (Lens culinaris M.) using ISJ marker. Ann. Biol. Res., 4 (7), 157-160.
  27. Senior, M. L. & Heun, M. (1993). Mapping maize microsatellites and polymerase chain reaction confirmation of the targeted repeats using a CT primer. Genome, 36, 884-889.
  28. Sharma, K. K., Crouch, J. H. & Hash, C. T. (2002). Application of Biotechnology for crop improvement prospect and constraints. J. Plant Sci., 163(3), 381-395.
  29. Siahsar, B. A., Allahdoo, M. & hahsavand Hasani, H. (2010). Evaluation of Genetic Diversity of Tritipyrum, Triticale and Wheat Lines through RAPD and ISJ Markers. Iran. J. Ffield Crop Sci., 41(3), 555-568.
  30. Soengas, P., Velasco, P., Padilla, G. & Ordás, A. (2006). Genetic relationships among Brassica napus crops based on SSR markers. Hort Sci., 41(5), 1195-1199.
  31. Thiyam-Holländer, U., Eskin, N. A. M. & Matthäus, B. (2012). Canola and Rapeseed: Production, Processing, Food Quality, and Nutrition. CRC Press. 374 P.
  32. Uzunova, M. I. & Ecke, W. (1999). Abundance, polymorphism and genetic mapping of microsatellite in oilseed rape (Brassica napus L.). Plant Breed., 118, 323-326.
  33. Weining, S. & Langridge, P. (1991). Identification and mapping of polymorphism in cereals based on polymerase chain reaction. Theor. Appl.Genet., 82, 209-216.
  34. Westman A, Kresovich, S. 1999. Simple sequence repeat (SSR)-based marker variation in Brassica nigra genebank accessions and weed populations. Euphytica, 109, 85-92.
  35. Yang, Y. X., Wu, W., Zheng, Y. L., Chen, L., Liu, R. J. & Huang, C. Y. (2007). Genetic diversity and relationship among safflower (Carthamus tinctorius L.): Analysis by intersimple sequence repeats (ISSR). Genet. Resour. Crop Evol., 54, 1043- 1051.
آمار
تعداد مشاهده مقاله: 2,247
تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,257


سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب