تعداد نشریات | 161 |
تعداد شمارهها | 6,532 |
تعداد مقالات | 70,501 |
تعداد مشاهده مقاله | 124,097,824 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 97,205,459 |
مطالعۀ ژنتیکی موسیر ایرانی (Allium hirtifolium Boiss.) با استفاده از نشانگرهای مورفولوژیکی و مولکولی | ||
علوم باغبانی ایران | ||
مقاله 5، دوره 45، شماره 3، آبان 1393، صفحه 267-277 اصل مقاله (499.66 K) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijhs.2014.52873 | ||
نویسندگان | ||
راهله ابراهیمی1؛ محمد رضا حسندخت* 2؛ ذبیح اله زمانی3؛ عبدالکریم کاشی4؛ ایزابل رولدان رویز5 | ||
1دانشجوی سابق دکتری، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران | ||
2دانشیار پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران | ||
3استاد پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران | ||
4استاد، گروه علوم باغبانی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران | ||
5استاد بخش علوم گیاهی مرکز تحقیقات کشاورزی و شیلات بلژیک | ||
چکیده | ||
در این پژوهش، تنوع ژنتیکی 21 تودۀ موسیر (Allium hirtifolium Boiss.) وحشی ایران از مناطق جنوب، جنوب غرب، غرب و مرکز ایران با استفاده از صفات مورفولوژیکی و نشانگرهای AFLP ارزیابی شد. نتایج نشان داد تودۀ خوانسار دارای بیشترین عرض برگ (42/5 سانتیمتر)، میانگین تعداد برگ در بوته (41/5)، قطر سوخ (84/10 سانتیمتر)، ارتفاع سوخ (95/4 سانتیمتر) و وزن متوسط سوخ (5/122گرم) بود و بنابراین، تودۀ مناسبی برای اهلیسازی و کشت است. براساس تجزیۀ کلاستر تودههای مطالعهشده از نظر صفات مورفولوژیکی در سه گروه قرار گرفتند که تا حد زیادی براساس نزدیکی و دوری جغرافیایی بود. در بررسی مولکولی توسط نشانگرهای AFLP از چهار ترکیب آغازگری EcoRI و MseI دارای سه نوکلئوتید انتخابی استفاده شد. در آنالیز مولکولی، 376 نشانگر حاصل شد که 204 نشانگر (28/53 درصد) چندشکلی نشان دادند. براساس دندروگرام حاصل از دادههای مولکولی، تودههای موسیر بومی ایران در حد تشابه 70 درصد در پنج گروه قرار گرفتند که مطابقت زیادی با پراکنش جغرافیایی آنها نشان داد. همچنین تودۀ کازرون از منطقۀ گرمتر جنوبی با تودههای شمالیتر که از مناطق سردتر بوند تفاوتهای ژنتیکی بارزتری داشت. نتایج نشان داد تکنیک AFLP ابزار مناسبی در ارزیابی تنوع ژنتیکی تودههای موسیر ایرانی است. | ||
کلیدواژهها | ||
اهلیسازی؛ تجزیۀ کلاستر؛ تنوع ژنتیکی؛ تودۀ بومی؛ AFLP | ||
مراجع | ||
Barker, J.H.A., Matthes, M., Arnold, G.M., Edwards, K.J., Ahman, I., Larsson, S. & Karp, A. (1999). Characterization of genetic diversity in potential biomass willows by RAPD and AFLP analysis. Genome, 42, 173-183.
2. Dashti, F. (2003). The study of genetic diversity and phylogeny of Tareh Irani in Alliums using morphological characters and molecular markers. Ph.D. Dissertation in Horticultural Science, University of Tehran, pp. 103. (In Farsi)
3. Doyle, J.J. & Doyle, J.L. (1987). Isolation of DNA from fresh plant tissue. Focus, 12, 13-15.
4. Ebrahimi, R., Zamani, Z. & Kashi, A. (2008). Genetic diversity evaluation of Persian shallot (Allium hirtifolium Boiss.) genotypes using morphological characters. Iranian Journal of Agricultural Sciences, 39(1), 147-154. (In Farsi)
5. Ebrahimi, R., Zamani, Z. & Kashi, A. (2009). Genetic diversity evaluation of wild Persian shallot (Allium hirtifolium Boiss.) using morphological and RAPD markers. Scientia Horticulturae, 119, 345–351.
6. Fritsch, R.M. & Friesen, N. (2002). Evolution, domestication and taxonomy. In: Rabinowitch H.D., Currah L. (eds.) Allium Crop Science: Recent Advances. Wallingford, UK: CABI Publishing, 5–30.
7. Ghahreman, A. (1984). Color Atlas of Iranian Plants. Institute of Forestries and Grasslands, Botany Division, No. 5, 512 pp. (In Farsi)
8. Hassandokht, M.R. & Campion, B. (2002). Low temperature, medium and genotype effect on the gynogenic ability of onion (Allium cepa L.) flowers cultured in vitro. Advances in Horticultural Science, 16 (2), 72- 78.
9. Ipek, M. & Simon, P.W. (2001). Genetic diversity in garlic (Allium sativum L.) as assessed by AFLPs and Isozymes. American Society for Horticultural Science 98th Annual Conference and Exhibition.
10. Ipek, M., Ipek, A. & Simon, P.W. (2003). Comparison of AFLPs, RAPD markers, and isozymes for diversity assessment of garlic and detection of putative duplicates in germplasm collections. Journal of the American Society for Horticultural Science, 128, 246–252.
11. Ipek, M., Ipek, A. & Simon, P.W. )2008a). Genetic characterization of Allium tuncelianum: An endemic edible Allium species with garlic odor. Scientia Horticulturae, 115, 409–415.
12. Ipek, M., Ipek, A. & Simon, P.W. )2008b). Molecular characterization of Kastamonu garlic: An economically important garlic clone in Turkey. Scientia Horticulturae, 115, 203–208.
13. Lee, M., Lim, Y.P. & Bang, J.W. (2002). Genetic analysis of garlic (Allium sativum L.) cultivars using AFLP. Korean Journal of Genetics, 24(1), 75- 81.
14. Matus, I., Gonzalez, M.I. & Del Poso, A. (1999). Evaluation of phenotypic variation in a chilean collection of garlic (Allium sativum L.) using multivariate analysis. International Plant Genetic Resources Institute (IPGRI). Newsletter, 117, 31-36.
15. Mehdi-Khanlou, Kh., Vandepitte, K., Kheibarshekan, L. & Van Bockstaele, E. (2011). Towards an optimal sampling strategy for assessing genetic variation within and among white clover (Trifolium repens L.) cultivars using AFLP. Genetics and Molecular Biology, 34(2), 252-258.
16. Sadeghzadeh-Ahari, D. (2010). Evaluation of drought and genetic diversity of Iranian fenugreek landraces using AFLP markers. Ph.D. Thesis in Horticultural Science, Islamic Azad University, Science and Research Branch, Tehran, pp. 194 (In Farsi)
17. Vafaee, Y., Dashti, F., Mardi, M. & Ershadi, A. (2009). A detection of genetic diversity among Iranian garlic clones (Allium sativum L.) via morphological characters and AFLP marker. Iranian Journal of Agricultural Sciences, 40(1), 13-22. (In Farsi)
18. Volk, G.M., Henk, A.D. & Richards, Ch.M. (2004). Genetic diversity among U.S. garlic clones as detected using AFLP methods. Journal of the American Society for Horticultural Science, 129(4), 559- 569.
19. Vos, P., Hogers, R., Bleeker, M., Reijans, M., Van de Lee, T., Hornes, M., Frijters, A., Pot, J., Peleman, J., Kuiper, M. & Zabeau, M. (1995). AFLP: A new technique for DNA fingerprinting. Nucleic Acids Research, 23, 4407– 4414. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 2,984 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,678 |