| تعداد نشریات | 126 |
| تعداد شمارهها | 7,094 |
| تعداد مقالات | 76,235 |
| تعداد مشاهده مقاله | 151,659,067 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 113,765,789 |
پیشگویی کلاسهای ساختاری پروتئینها در دو وضعیت با استفاده از مدل ترکیبی عصبی-لوجستیک | ||
| مجله علوم دانشگاه تهران (منتشر نمی شود) | ||
| مقاله 5، دوره 33، شماره 1 - شماره پیاپی 1909، مرداد 1387 اصل مقاله (258.28 K) | ||
| نویسندگان | ||
| صمد جهاندیده؛ پرویز عبدالمالکی؛ محمد مهدی موحدی* | ||
| چکیده | ||
| هدف مطالعه پیشنهادی پیشگویی کلاسهای ساختاری پروتئین ها در دو وضعیت (تمام آلفا و تمام بتا) با استفاده از روش مدل سازی ترکیبی دو مرحلهای با شبکه عصبی مصنوعی (ANN) و مدل لوجستیک رگرسیون (LRM) است. ساختار شبکه و فرایند آموزش طولانی، کاربرد آن را در تمام زمینهها محدود کرده است. پیشگویی کلاسهای ساختاری پروتئینها روی یک سری داده (104n=) از پروتئینهای غیر همولوگ تکدومین کروی اجرا شد. پارامترهای معنادار آماری در مدل لوجستیک رگرسیون فراوانی تکی اسیدآمینههای والین و گلیسین همچنین فراوانی ترکیبات دوتایی لیزین-پرولین، ایزولوسین-سرین، گلوتامین- سرین و گلوتامین- پرولین بودند. در بین ترکیبات سه تایی نیز تنها فراوانی ترکیب آسپاراژین- لوسین- آسپارتیک اسید معنادار بود. پیشگویی کلاسهای ساختاری در دو وضعیت (تمام آلفا و تمام بتا) تنها بر اساس هفت شاخص ساختاری معنیدار به عنوان متغیرهای ورودی از بین 642 متغیر ساختاری 88% کارایی نشان داد. در این مطالعه، هر دو شاخص وابسته به آستانه و غیر وابسته (ROC) برای ارزیابی مدل استفاده شده است. | ||
| کلیدواژهها | ||
| مدل لوجستیک رگرسیون؛ شبکه عصبی مصنوعی؛ پیشگویی کلاس ساختاری پروتئین | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,360 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 2,027 |
||