تعداد نشریات | 161 |
تعداد شمارهها | 6,532 |
تعداد مقالات | 70,501 |
تعداد مشاهده مقاله | 124,099,342 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 97,206,861 |
پیشگویی کلاسهای ساختاری پروتئینها در دو وضعیت با استفاده از مدل ترکیبی عصبی-لوجستیک | ||
مجله علوم دانشگاه تهران (منتشر نمی شود) | ||
مقاله 5، دوره 33، شماره 1 - شماره پیاپی 1909، مرداد 1387 اصل مقاله (258.28 K) | ||
نویسندگان | ||
صمد جهاندیده؛ پرویز عبدالمالکی؛ محمد مهدی موحدی* | ||
چکیده | ||
هدف مطالعه پیشنهادی پیشگویی کلاسهای ساختاری پروتئین ها در دو وضعیت (تمام آلفا و تمام بتا) با استفاده از روش مدل سازی ترکیبی دو مرحلهای با شبکه عصبی مصنوعی (ANN) و مدل لوجستیک رگرسیون (LRM) است. ساختار شبکه و فرایند آموزش طولانی، کاربرد آن را در تمام زمینهها محدود کرده است. پیشگویی کلاسهای ساختاری پروتئینها روی یک سری داده (104n=) از پروتئینهای غیر همولوگ تکدومین کروی اجرا شد. پارامترهای معنادار آماری در مدل لوجستیک رگرسیون فراوانی تکی اسیدآمینههای والین و گلیسین همچنین فراوانی ترکیبات دوتایی لیزین-پرولین، ایزولوسین-سرین، گلوتامین- سرین و گلوتامین- پرولین بودند. در بین ترکیبات سه تایی نیز تنها فراوانی ترکیب آسپاراژین- لوسین- آسپارتیک اسید معنادار بود. پیشگویی کلاسهای ساختاری در دو وضعیت (تمام آلفا و تمام بتا) تنها بر اساس هفت شاخص ساختاری معنیدار به عنوان متغیرهای ورودی از بین 642 متغیر ساختاری 88% کارایی نشان داد. در این مطالعه، هر دو شاخص وابسته به آستانه و غیر وابسته (ROC) برای ارزیابی مدل استفاده شده است. | ||
کلیدواژهها | ||
مدل لوجستیک رگرسیون؛ شبکه عصبی مصنوعی؛ پیشگویی کلاس ساختاری پروتئین | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,258 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,884 |