پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 127 |
| تعداد شمارهها | 7,196 |
| تعداد مقالات | 77,227 |
| تعداد مشاهده مقاله | 157,222,978 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 118,406,258 |
تحلیل مقایسهای بیان ژن و بیان آلل اختصاصی (ASE) در بافت های چربی داخلعضلانی و زیرجلدی در گاوهای گوشتی | ||
| علوم دامی ایران | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 14 دی 1404 | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2025.406502.654106 | ||
| نویسندگان | ||
| حمیده نوری صادق1؛ غلامرضا داشاب* 2؛ زهرا رودباری3؛ محمد حسین بنابازی4؛ توماس سادکووسکی5 | ||
| 1گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران | ||
| 2دانشیار ژنتیک و اصلاح دام، گروه علوم دامی، دانشگاه زابل | ||
| 3گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه جیرفت، جیرفت، ایران | ||
| 4گروه علوم زیستی دامی، مرکز دامپزشکی و علوم دامی، دانشگاه علوم کشاورزی سوئد، ۷۵۰۰۷ اوپسالا، سوئد. | ||
| 5گروه فیزیولوژی حیوانات، دانشکده دامپزشکی، دانشگاه علوم زیستی ورشو، لهستان | ||
| چکیده | ||
| این پژوهش با هدف بررسی بیان آلل اختصاصی (Allele- Specific Expression; ASE) در دو نوع بافت چربی گاو شامل چربی داخلعضلانی (IMF) و چربی زیرجلدی (SCAT) انجام شد، تا تفاوتهای تنظیمی ژنها در این بافتها شناسایی گردد. چربی داخل عضلانی از عوامل کلیدی تعیینکننده کیفیت گوشت گاو از نظر لطافت، طعم و آبداری است و برخلاف چربی زیرجلدی، در مراحل دیرتر رشد حیوان تشکیل میشود. برای این منظور، دادههای RNA-Seq مربوط به هشت نمونه بافت از ناحیه دندههای ۹ تا ۱۱ گاوهای نژاد دورگه آنگوس از پایگاه داده NCBI (PRJNA1053327) استخراج شدند و مراحل تجزیه با استفاده از نرمافزارهای HISAT2، GATK و VEP پردازش گردید. میانگین نرخ نگاشت خوانشها ۹۵٪ بود و در مجموع بیش از ۵۸۰ هزار واریانت ژنتیکی شناسایی شد. در بافت داخل عضلانی از میان 214613 SNP دارای قابلیت ASE، تعداد ۸۹۰ موقعیت معنیدار شناسایی و ۳۲ ژن حاوی الگوی بیان آللی اختصاصی مشخص گردید. در حالیکه در بافت زیرجلدی، از 305996 SNP دارای ویژگی ASEتعداد1094 موقعیت معنیدار شناخته شدند که با ۲۱ ژن مرتبط بودند. تنها ژن مشترک میان دو بافت، SUGCT بود که در متابولیسم اسیدهای چرب و تنظیم انرژی سلولی نقش دارد. تحلیل غنیسازی مسیرها نشان داد که در بافت SCAT مسیرهای ایمنی نظیر JAK–STAT و Necroptosis غالب بودند، در حالی که در بافت داخل عضلانی مسیرهای مرتبط با متابولیسم انرژی از جمله Hippo signaling و Ubiquinone biosynthesis فعالتر بودند. ژنهای کلیدیIFNAR1 در بافت چربی زیرجلدی و RB1در بافت چربی داخل عضلانی بهترتیب در تنظیم پاسخ ایمنی و تمایز آدیپوسیتی نقش برجستهای داشتند. | ||
| کلیدواژهها | ||
| بیان اختصاصی آلل (ASE)؛ ترانسکریپتومیکس؛ کیفیت گوشت؛ ماربلینگ | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 158 |
||
سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب