پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 127 |
| تعداد شمارهها | 7,196 |
| تعداد مقالات | 77,227 |
| تعداد مشاهده مقاله | 157,208,869 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 118,400,365 |
تأثیر پیشین های مختلف پارامتر تنظیم بیز LASSO بر پیش بینی های ژنومی صفات با معماری های ژنتیکی مختلف | ||
| علوم دامی ایران | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 14 دی 1404 | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2025.397606.654084 | ||
| نویسنده | ||
| سیّد مهدی حسینی وردنجانی* | ||
| گروه علوم دامی- ژنتیک و اصلاح نژاد دام وطیور- دانشکده کشاورزی- دانشگاه لرستان- خرم آباد- ایران | ||
| چکیده | ||
| بیز LASSO یک روش رگرسیون جریمهای و دارای پتانسیل انتخاب متغیر با استفاده از پارامتر تنظیم λ است. در چارچوب کاملاً بیزی امکان تصادفی تلقی کردن λ وجود دارد و میتوان به آن پیشینهای مختلف اختصاص داد. در این مطالعه اثر اختصاص سه نوع پیشین مختلف شامل توزیع گاما، بتا و ثابت بر قابلیت پیشبینی و برآورد پارامترهای ژنتیکی با استفاده از دادههای ژنوم موش و هفت صفت با معماریهای ژنتیکی مختلف بررسی شد. نتایج نشان داد که برآورد مؤلفههای واریانس و وراثتپذیری به شدّت تحت تأثیر پیشین انتخابی قرار میگیرند. مدل λی ثابت بیشترین واریانس ژنتیکی و وراثتپذیری و کمترین میزان واریانس باقیمانده را برای صفات مختلف برآورد کرد. میانگین صحّت بدست آمده برای هر صفت با استفاده از پیشینهای مختلف نسبتاً مشابه بود ولی همواره صحّت مدل λی ثابت دارای انحراف استاندارد بالاتر در مقایسه با دو پیشین دیگر بود. مقایسه مقادیر کمینه و بیشینهی صحّت مدلها در قالب اعتبارسنجی متقابل پنج طرفه نشان داد که بالاترین مقادیر صحّت با تخصیص توزیعهای گاما و بتا به پارامتر تنظیم بدست میآید. با افزایش مقدار وراثتپذیری و تعداد QTL پس زمینهای صفت، صحّت مدلها افزایش و تفاوت بین سه پیشین مختلف کاهش یافت. تفاوت مدلها در رابطه با اریب پیشبینیها بیشتر بود ولی عموماً همان روند صحّت را دنبال میکرد، یعنی مدلهایی که بالاترین صحّت را داشتند کمترین اریب پیشبینی را نیز داشتند. بر اساس نتایج حاضر، تخصیص پیشین مناسب به λ برای صفاتی که تحت تأثیر تعداد کمی ژن هستند و یا وراثتپذیری پایینتری دارند ضروریتر است. | ||
| کلیدواژهها | ||
| رویکرد بیزی؛ پیشبینی ژنومی؛ قابلیت پیشبینی؛ پیشین مناسب؛ انتخاب متغیر | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 99 |
||
سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب