| تعداد نشریات | 127 |
| تعداد شمارهها | 7,117 |
| تعداد مقالات | 76,481 |
| تعداد مشاهده مقاله | 152,846,499 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 114,922,149 |
تحلیل جهشهای تکنوکلئوتیدی CXCR1 و تأثیر آن بر کیفیت شیر در نژادهای مختلف گاو شیری | ||
| علوم دامی ایران | ||
| دوره 56، شماره 4، دی 1404، صفحه 937-957 اصل مقاله (2.12 M) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2025.396788.654080 | ||
| نویسندگان | ||
| سینا عسکری1؛ محمد رکوعی1؛ غلامرضا داشاب* 1؛ مهدی وفای واله1؛ احمدرضا جهانتیغ2 | ||
| 1گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران | ||
| 2گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زابل، زابل، ایران. | ||
| چکیده | ||
| ژن کاندیدا CXCR1 یکی از ژنهای مرتبط با تولید شیر و مقاومت/حساسیت به بیماری ورم پستان در گاوهای شیری میباشد. لذا هدف از پژوهش حاضر شناسایی چندشکلی در ناحیه ژن CXCR1 و ارتباط آنها با صفات کیفی شیر در گاوهای هلشتاین، سیستانی و آمیختههای سیستانی×سیمنتال بود. نمونههای خون از سیاهرگ گردنی و شیر در طی یک دوره سه ماهه از 27 رأس گاو (سیستانی 10 رأس، هلشتاین 10 رأس و آمیختههای سیستانی×سیمنتال 7 رأس) جمعآوری و ترکیبات شیر شامل درصد چربی، پروتئین، لاکتوز و ماده خشک بدون چربی اندازهگیری گردید. استخراج DNA به روش نمکی-بهینهیافته انجام شد. قطعه 594 جفت بازی از ژن CXCR1 با یک جفت پرایمر اختصاصی تکثیر شد. توالییابی قطعه تکثیر شده به روش سانگر انجام گرفت. شناسایی جایگاههای چندشکلی و محاسبه ساختارهای ژنتیکی جوامع از نرمافزارهای MEGA11 و Dnasp5 استفاده شد و در نهایت ارتباط جایگاههای چندشکلی با صفات کیفی شیر از مدل تابعیت چندگانه و رویه GLM نرمافزار SAS9.4 استفاده گردید. نتایج نشان داد که تنوع ژنتیکی محدود در ژن CXCR1 بین نژادهای مختلف وجود دارد. نژاد هلشتاین بیشترین واگرایی ژنتیکی را داشت و آمیختهها به نژاد سیستانی نزدیکتر بودند. ده جایگاه چندشکلی و پنج تغییر آمینواسیدی در این ژن شناسایی شد و نسبت dN/dS برابر با 63/1 نشاندهنده تأثیر انتخاب طبیعی در تکامل ناحیه ژن مذکور میباشد. ارتباط معنیداری بین چندشکلیها در جایگاه SNP230 با درصد چربی، لاکتوز و ماده خشک بدون چربی شیر مشاهده شد. این یافتهها اهمیت ژن CXCR1 را در برنامههای اصلاح نژاد گاوهای شیری نشان میدهد. | ||
| کلیدواژهها | ||
| CXCR1؛ کیفیت شیر؛ گاو شیری؛ چندشکلیها؛ مقاومت به ورم پستان | ||
| مراجع | ||
منابعمقصودی، ع.، نجاتی جوارمی، ا.، حسنی بافرانی، ع.، نوری صادق، ح.، جهان، م.، سروری کلوتی، ح. و خانی بندانی، ح. 1401. بررسی عوامل مؤثر بر کاهش جمعیت گاو نژاد سیستانی و راهکارهای احیای آن. نشریه علوم دامی، 135، 39-54.
REFERENCES Ablondi M., Summer A., Stocco G., Degano L., Vicario D., Stefanon B., Sabbioni A. and Cipolat-Gotet C. (2023). Heritability and genetic correlations of total and differential somatic cell count with milk yield and composition traits in Italian Simmental cows. Journal of Dairy Science, 106(12), 9071-9077. Asadpour, R., Feyzi, L., Jafari-Joozani, R., Hamali, H., Abolfaz, H., Hajibemani H. and Firouzamandi, M. (2020). The relationship between polymorphism of the CXCR1 gene and the risk of endometritis in Holstein dairy cows. Veterinarski Arshiv, 90(6), 557-563. Beecher C., Daly M., Ross R. P., Flynn J., McCarthy T. V. and Giblin L. (2012). Characterization of the bovine innate im mune response in milk somatic cells following intramammary infection with Streptococcus dysgalactiae subspecies dysga lactiae. J. Dairy Sci., 95, 5720-5729. Berglund B. (2008). Genetic improvement of dairy cow reproductive performance. Reproduction in Domestic Animals, 43, 89-95. Brown, A. J., Joseph, P. R., Sawant, K. V. and Rajarathnam, K. (2017). Chemokine CXCL7 heterodimers: structural insights, CXCR2 receptor function, and glycosaminoglycan interactions. Int. J. Mol. Sci., 18(4), 748. doi:10.3390/ijms18040748. Chen, L., Fan, J., Chen, H., Meng, Z., Chen, Z., Wang, P. and et al. (2014). The IL-8/CXCR1 axis is associated with cancer stem cell-like properties and correlates with clinical prognosis in human pancreatic cancer cases. Sci Rep., 4, 5911. doi: 10.1038/srep05911. Galvão, K. N., Pighetti, G. M., Cheong, S. H. and et al. (2011). Association between interleukin-8 receptor-α (CXCR1) polymorphism and disease incidence, production, reproduction, and survival in Holstein cows. J. Dairy Sci., 94, 2083-2091. Goertz, I., Baes, C., Weimann, C., Reinsch, N. and et al. (2009). Association between single-nucleotide polymorphisms in the CXCR1 gene and somatic cell score in Holstein dairy cattle. J. Dairy Sci., 92, 4018-4022.http://dx.doi.org/10.3168/ jds.2008-1536. Grosse, W. M., Kappes, S. M., Laegreid, W. W. and Keele, J. W. (1999). Single-nucleotide polymorphism (SNP) discovery and linkage mapping of bovine cytokine genes. Mammalian Genome, 10, 1062-1069. Hosseini Moghaddam, S. H., Ayatollahi1, M., Ahadzadeh, O., Mirhoseini, S. Z., Khataminejad, R. and Alaei, H. (2021). Genotyping of Lactoferrin and CXCR1 genes in Guilan native cows and its association with milk somatic cell score. Irani an Journal of Applied Animal Science, 11(1), 87-93. Kim, H. Y., Choi, J. H., Kang, Y. J., Park, S. Y., Choi, H. C. & Kim, H. S. (2011). Reparixin, an inhibitor of CXCR1 and CXCR2 receptor activation, attenuates blood pressure and hypertension-related mediators expression in spontaneously hypertensive rats. Biological & Pharmaceutical Bulletin, 34(1), 120–127. https://doi.org/10.1248/bpb.34.120 Kosciuczuk, E. M., Lisowski, P., Jarczak, J., Krzyzewski, J., Zwierzchowski, I. and Bagnicka, E. (2014). Expression patterns of β-defensin and cathelicidin genes in parenchyma of bovine mammary gland infected with coagulase-positive or coagulase-negative Staphylococci. BMC. Vet. Res., 10, 1. DOI: 10.1186/s12917-014-0246-z. Lee, D. W. and et al. (2015). T cells expressing CD19 chimeric antigen receptors for acute lymphoblastic leukaemia in children and young adults: a phase 1 dose-escalation trial. Lancet, 385, 517–528. Leyva-Baca, I., Schenkel, F., Martin, J. and Karrow, N. A. (2008). Polymorphisms in the 5’ upstream region of the CXCR1 chemokine receptor gene, and their association with somatic cell score in Holstein cattle in Canada. J. Dairy Sci., 91, 407-417. Librado, P. and Rozas, J. (2009). DnaSP v5: software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data. Journal of Bioinformatics, 25, 1451-1452. doi.org/10.1093/bioinformatics/btp187. Lopez, A. and Bonasora, M. G. (2017). Phylogeography, genetic diversity and population structure in a Patagonian endemic plant. AoB Plants, 16(4), 275-285. Maghsoudi, A., Nejati-Javaremi, A., Hasani Baferani, A., Noure Sadegh, H., Jahan, M., Sarvari-Kalouti, H. and Khani-Bandani, H. (2021). Evaluation of the effective factors on reducing the population of Sistani cattle and the revitalization strategies. Animal Science Journal (Pajouhesh & Sazandegi), 135, 39-54. (In Persian) Magotra, P. A., Bangar, Y. C., Patil, C. S., Kamaldeep, P., Sindhu, V., Malik, D., Chaudhary, P., Garg, A. R. and Kumar, S. (2023). Association of CXCR1 gene polymorphism with clinical mastitis, reproductive disorders and performance traits in Hardhenu (Bos taurus × Bos indicus) cattle. Reproduction in Domestic Animals, 58(9), 1234-1243. Martinez, L., Lucas, P., Navarro, G., Checa, A. I., Franco, R., Martínez-A, C., Rodríguez-Frade, J. M. & Mellado, M. (2009). Dynamic regulation of CXCR1 and CXCR2 homo- and heterodimers. Journal of Immunology, 183(11), 7337–7346. https://doi.org/10.4049/jimmunol.0901802. Mitchell, G. B., Albright, B. N. and Caswell, J. L. (2003). Effect of interleukin-8 and granulocyte colony-stimulating factor on priming and activation of bovine neutrophils. Infect. Immun., 71, 1643-1649. DOI: 10.1128/iai.71.4.1643-1649.2003. Muller, J. K. and Leweke, F. M. (2016). Bipolar disorder: clinical overview. Medizinische Monatsschrift fur Pharmazeuten, 39(9), pp.363-9. Nilsen, H., Olsen, H. G., Hayes, B., Nome, T. and et al. (2009). Characterization of a QTL region affecting clinical mastitis and protein yield on BTA6. Anim. Genet., 40, 701-712. http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-2052.2009.01908.x. Ogorevc, J., Prpar, S. and Dovc, P. (2000). Establishment and characterization of a caprine mammary epithelial cell line. In vitro Cell Development Biology Science, 36(1), 26-37. doi: 10.1290/1071-2690(2000)036<0026:EACOAC>2.0.CO;2. Paape, M. J., Shafer-Weaver, K., Capuco, A. V., Van Oostveldt, K. and et al. (2000). Immune surveillance of mammary tissue by phagocytic cells. Adv. Exp. Med. Biol., 480, 259-277. http://dx.doi.org/10.1007/0-306-46832-8_31. Petersen, G. and Seberg, O. (2003). Phylogenetic analyses of the diploid species of Hordeum (Poaceae) and a revised classification of the genus. Systematic Botany, 28, 293-306. DOI:10.1043/0363-6445-28.2.293. Pighetti, G. M. and Rambeaud, M. (2006). Genome conservation between the bovine and human interleukin-8 receptor complex: improper annotation of bovine interleukin-8 receptor b identified. Vet. Immunol. Immunopathol., 114, 335–340. Pighetti, G. M., Kojima, C. J., Wojakiewicz, L. and Rambeaud, M. (2012): The bovine CXCR1 gene is highly polymorphic. Vet. Immunol. Immunopathol., 145, 464-470. Pokorska, J., Dusza, M., Kułaj1, D., Żukowski, K. and Makulska, J. (2015). Single-nucleotide polymorphisms in the CXCR1 gene and its association with clinical mastitis incidence in Polish Holstein-Friesian cows. Genetics and Molecular Research, 15(2), gmr.15027247. Rekik, B., Ajili, N., Hani, H. B., BenGara, A. and Rouissi, H. (2008). Effect of somatic cell count on milk and protein yields and female fertility in Tunisian Holsteins cows. Livest. Sci., 106, 309-317. SAS Institute. (2004). SAS®/STAT Software, Release 9.4. SAS Institute, Inc., Cary, NC. USA. Shankarappa, B., Nagaraja, R., Yathish, H. M. and Prasanna, S. B. (2021). Identification of CXCR1 gene variants and their association with somatic cell count in HF crossbred and Deoni cattle. The Pharma Innovation Journal, SP-10(11), 2098-2102. Tamura, K. and Nei, M. (1993). Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees. Molecular Biology and Evolution, 10, 512-526. DOI: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a040023. Tamura, K., Stecher, G. and Kumar, S. (2021). MEGA 11: Molecular evolutionary genetics analysis version 11. Molecular Biology and Evolution, https://doi.org/10.1093/molbev/msab120. Verbeke, J., Piepers, S., Peelman, L., Van Poucke, M. and De Vliegher, S. (2012). Pathogen-group specific association between CXCR1 polymorphisms and subclinical mastitis in dairy heifers. Journal of Dairy Research, 79(3), 341–51. Youngerman, S. M., Saxton, A. M. and Pighetti, G. M. (2004a). Novel single-nucleotide polymorphisms and haplotypes within the bovine CXCR2 gene. Immunogenetics, 56, 355–359. Youngerman, S. M., Saxton, A. M., Oliver, S. P. and Pighetti, G. M. (2004b). Association of CXCR2 polymorphisms with sub clinical and clinical mastitis in dairy cattle. J. Dairy Sci. 87: 2442–2448. Zhang, C., Fan, X., Yu, H. Q., Zhang, H. Q., Wang, X. L. and Zhou, Y. H. (2009). Phylogenetic analysis of questionable tetraploid species in Roegneria and Pseudoroegneria (Poaceae: Triticeae) inferred from a gene encoding plastid acety1-CoA carboxylase. Biochemical Systematics and Ecology, 37, 412-420. https://doi.org/10.1016/j.bse.2009.04.011. Zhang, C., Wang, Y., Chen, H., Fang, X. and Gu, C. (2012). The chemokine receptor 1 gene polymorphism and its association with somatic cell score and milk production traits in dairy cattle. Animal Science Papers and Reports, 30(1), 25–33. Zhou, L., Wang, H. M., Ju, Z. H. and et al. (2013). Association of novel single nucleotide polymorphisms of the CXCR1 gene with the milk performance traits of Chinese native cattle. Genet. Mol. Res., 12, 2725-2739.
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 179 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 126 |
||