مطالعه ارتباط ژنومی برای شناسایی ژنهای کاندیدا در مراحل اولیه رشد در مرغ | ||
| علوم دامی ایران | ||
| دوره 55، شماره 4، زمستان 1403، صفحه 651-664 اصل مقاله (1.12 M) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2024.372924.654003 | ||
| نویسندگان | ||
| زینب عسگری* 1؛ علیرضا احسانی2؛ علی اکبر مسعودی2؛ رسول واعظ ترشیزی1 | ||
| 1گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران | ||
| 2گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران. | ||
| چکیده | ||
| تاکنون روشهای متعددی برای شناسایی فاکتورهای ژنتیکی مؤثر بر صفات پلیژنیک مورداستفاده قرارگرفته است. روشهای رایج استفادهشده شامل آنالیز رگرسیونی مبتنی بر حداقل مربعات، آنالیز رگرسیونی مبتنی بر حداکثر درست نمایی و روشهای بیزی میباشد. از برتری روشهای بیزین نسبت به سایر روشها میتوان به امکان استفاده همزمان از کل مارکرها در مدل اشاره نمود که منجر به جلوگیری از بیش برآورد اثرات نشانگرها شده و احتمال شناسایی SNPهای مثبت واقعی را افزایش میدهد. ازاینرو، در مطالعه حاضر برای شناسایی SNPهای مرتبط با وزن بدن در سنین اولیه (2 هفتگی)، در یک جمعیت F2 از مرغان آمیخته، از روش بیز Cpi استفاده شد. سپس، برای تعیین ژنوتیپ جمعیت حاضر شامل 312 مرغ F2، چیپهای تجاریIllumina 60K استفاده گردید. درنهایت، 16 مارکر SNP که دارای فاکتور بیز بین 20 تا 150 بودند، بهعنوان مارکرهای پیشنهادی برای وزن بدن در این سن در نظر گرفته شد. این SNPها بر روی 4 کروموزوم توزیعشدهاند و بهصورت سببی و یا بهواسطه وجود عدم تعادل پیوستگی با 16 ژن ارتباط نزدیک دارند. از ژنهای شناساییشده 12 ژن، کد کننده پروتئین و 4 ژن RNA غیرکدکننده میباشند. برای شناسایی ژنهای مرتبط با هر SNP در مناطق کاندیدا، Mb 5/0 اطراف هر SNP معنیدار در نظر گرفته شد. | ||
| کلیدواژهها | ||
| مطالعه پویش ژنوم؛ مرغ؛ چندشکلی تک نوکلئوتیدی؛ روش بیزین؛ ژنهای کاندید | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 601 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 387 |
||