تعداد نشریات | 161 |
تعداد شمارهها | 6,532 |
تعداد مقالات | 70,502 |
تعداد مشاهده مقاله | 124,119,262 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 97,225,614 |
بررسی تنوع ژنتیکی درون گونهای پنج رقم ارکیده فالانوپسیس شاخه بریده با استفاده از نشانگرهای مولکولی RAPD و IRAP | ||
علوم باغبانی ایران | ||
دوره 55، شماره 1، فروردین 1403، صفحه 21-33 اصل مقاله (1.1 M) | ||
نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijhs.2023.343479.2030 | ||
نویسندگان | ||
خسرو بالی لاشکی1؛ هدایت زکی زاده* 1؛ جمالعلی الفتی1؛ ابوذر سورنی2 | ||
1گروه علوم باغبانی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان، رشت، ایران | ||
2گروه زیست فناوری، دانشکده کشاورزی، دانشگاه صنعتی اصفهان، اصفهان ، ایران | ||
چکیده | ||
فالانوپسیس یکی از شناختهشدهترین جنسهای تیره ارکیده است که به دلیل قابلیت سازگاری بالا با شرایط محیطی مختلف از رشد نسبتاً مناسبی نیز برخوردار است. برنامه اصلاح فالانوپسیس و بررسی کامل نتاج بهطور معمول نیاز به سه تا پنج سال زمان دارد که با استفاده از نشانگرهای مولکولی این زمان را میتوان کاهش داد. در این تحقیق، نتاج حاصل از تلاقی 5 رقم مختلف، بهمنظور کوتاه کردن زمان جهت انتخاب ژنوتیپهای برتر با استفاده از نشانگرهای مولکولی رپید و آیرپ مورد بررسی قرار گرفتند. از مجموع 299 نوار تولید شده در رپید، 86 درصد نوارها چند شکل بودند. میانگین تعداد نوارهای چند شکل 5/13 نوار برای هر آغازگر بود. میزان حداقل تشابه ژنتیکی با استفاده از نشانگر رپید و ضریب تشابه نی بین هیبریدهای 'Sevilla'×'Sevilla' و 'Manila'×'Bombay' 43 درصد و حداکثر آن بین هیبریدهای ''Sevilla'×'Okayama و 'Okayama'×'Sevilla' معادل 72 درصد بهدست آمد. از 6 ترکیب آغازگر انتخابی آیرپ، در مجموع 83 نوار تولید شد که از این تعداد 72 نوار چند شکل بودند. بالاترین درصد چندشکلی را ترکیب آغازگرهای 3′LTR- LTR6150 و 3′LTR-3′LTR و پایینترین را Sukkula -3′LTR تولید کردند. میزان حداکثر تشابه ژنتیکی با استفاده از نشانگر آیرپ بین هیبریدهای 'Sevilla'×'Okayama' و 'Sevilla'×'Manila' با مقدار 82 درصد و کمترین همسانی بین هیبریدهای 'Sevilla'×'Sevilla' و ''Manila'×'Bombay در حد تشابه 32 درصد مشاهده شد که به ترتیب حاکی از میزان نزدیکی و دوری ژنتیکی این ژنوتیپها نسبت به یکدیگر میباشد. با استفاده از نتایج این پژوهش، ژنوتیپهای نوترکیب با الگوی باندی متفاوت از والدین میتوانند برای برنامههای بهنژادی جهت تولید و معرفی ارقام جدید استفاده شوند. | ||
کلیدواژهها | ||
چندشکلی؛ رتروترنسپوزون؛ مارکرهای مولکولی؛ رپید | ||
مراجع | ||
امیدی بخش، محمد. (2005). مطالعه تنوع ژنتیکی گندم دوروم با استفاده از نشانگر SSR. پایان نامه کارشناسی ارشد، دانشگاه تهران، تهران، ایران. Bhattacharyya, P., Kumaria, S., Kumar, S. & Tandon, P. (2013). Start Codon Targeted (SCoT) marker reveals genetic diversity of Dendrobium nobile Lindl., an endangered medicinal orchid species. Gene, 529, 21–26. Bhattacharyya, P., Kumaria, S. & Tandon, P. (2015). Applicability of ISSR and DAMD markers for phyto-molecular characterization and association with some important biochemical traits of Dendrobium nobile, an endangered medicinal orchid. Phytochemistry, 117, 306–316. Becker, J., Vos, P. & Kuiper, M. (1995). Combined mapping of AFLP and RFLP markers in barley. Molecular and General Genetics MGG, 249(1), 65-73. Chen, J. & Chang, W.C. (2006). Direct somatic embryogenesis and plant regeneration from leaf explants of Phalaenopsis amabilis. Biologia Plantarum, 50(2), 169-173. Chen, T.Y., Chen, J.T. & Chang, W.C. (2002). Multiple shoot formation and plant regeneration from stem nodal explants of Paphiopedilum orchids. In Vitro Cellular & Developmental Biology-Plant, 38(6), 595-597. Chuang, H.T. (2002). Identification of some species in the genus Phalaenopsis to Taiwan and Philippine by using RAPD and ISSR molecular markers. Master Thesis, Graduate Institute of Agriculture, National Chiayi University, Chiayi, Taiwan. (Chinese with English abstract) Chugh, S., Guha, S. & Rao, I.U. (2009). Micropropagation of orchids: a review on the potential of different explants. Scientia Horticulturae, 122(4), 507-520. Goh, M.W.K., Kumar, P.P., Lim, S.H. & Tan, H.T.W. (2005). Random amplified polymorphic DNA analysis of the moth orchids, Phalaenopsis (Epidendroideae:Orchidaceae). Euphytica 141, 11–22. Griesbach, R. (2002). Development of Phalaenopsis orchids for the mass-market. Trends in new crops and new uses. ASHS Press, Alexandria, VA, 458-465. Kalendar, R., Grob, T. & Regina, M. (1999). IRAP and REMAP: two new retrotransposon-based DNA fingerprinting techniques. Theoretical and Applied Genetics, 98(5), 704-711. Kalendar, R. & Schulman, A.H. (2006). IRAP and REMAP for retrotransposon-based genotyping and fingerprinting. Nature Protocol, 1, 2478–2484 Khadivi-Khub A, Soorni A. (2014). Comprehensive genetic discrimination of Leonurus cardiaca populations by AFLP, ISSR, RAPD and IRAP molecular markers. Molecular Biology Reports. 41(6):4007-16. Kilinc, F. M., Süzerer, V., Çiftçi, Y., Onay, A., Yıldırım, H., Uncuoğlu, A.A., Tilkat, E, Metin, O.K., Ibrahim, K. & Akdemir, O.F. (2015). Clonal micropropagation of Pistacia lentiscus L. and assessment of genetic stability using IRAP markers. Plant Growth Regulation, 75, 75–88 Kumar, R., Singh, M., Kumar, P., Singh, J. (2015). Crop Selection Method to Maximize Crop Yield Rate using Machine Learning Technique. International Conference on Smart Technologies and Management for Computing, Communication, Controls, Energy and Materials1. 0.1109/ICSTM.2015.7225403. Liu, B. (2010). Uncertain risk analysis and uncertain reliability analysis. Journal of Uncertain Systems, 4(3), 163-170. Niknejad, A., Kadir, M.A., Kadzimin, S.B., Abdullah, N.A.P. & Sorkheh, K. (2009). Molecular characterization and phylogenetic relationships among and within species of Phalaenopsis (Epidendroideae: Orchidaceae) based on RAPD analysis. African Journal of Biotechnology, 8, 5225-5240. Omidbakhsh Fard, M, (2005). Study of genetic diversity in durum wheat using SSR marker', MSc Thesis. Tehran University. Tehran, Iran. (in Persian). Powel,W., Morgante, M. & Andre, C. (1996) The comparison of RFLP, RAPD, AFLP and SSR (microsatellite) markers for germplasm analysis. Molecular breeding, 2(3), 225-238. Puchooa, D. (2004). A simple, rapid and efficient method for the extraction of genomic DNA from lychee (Litchi chinensis Sonn.). African Journal of Biotechnology, 3(4), 253-255. Spooner, D.M., McLean, K., Ramsay, G., Waugh, R. & Bryan, G.J. (2005). Single domestication for potato based on multilocus amplified fragment length polymorphism genotyping. Proceedings of the National Academy of Sciences. U.S.A. 102, 14694–14699. Stewart, S.L. & Kane, M.E. (2006) Asymbiotic seed germination and in vitro seedling development of Habenaria macroceratitis (Orchidaceae), a rare Florida terrestrial orchid. Plant Cell, Tissue and Organ Culture, 86(2), 147-158. Tsai, C.C., Shih, H.C., Wang, H.V., Lin, Y.S., Chang, C.H., Chiang, Y.C. & Chou, C.H. (2015). RNA-Seq SSRs of moth orchid and screening for molecular markers across genus Phalaenopsis (Orchidaceae). PLoS ONE, 10(11), e0141761. Xiang, N., Hong, Y. & Lam-Chan, L.T. (2003). Genetic analysis of tropical orchid hybrids (Dendrobium) with fluorescence amplified fragment length polymorphism (AFLP). Journal of the American Society for Horticultural Science, 128, 731–735. Varshney, R.K., Chabane, K. & Hendre, P.S. (2007). Comparative assessment of EST-SSR, EST-SNP and AFLP markers for evaluation of genetic diversity and conservation of genetic resources using wild, cultivated and elite barleys. Plant Science, 173(6), 638-649. Wen, W.H., Liu, J.Y. & Qin, W.J. (2007). Targeted inhibition of HBV gene expression by single‐chain antibody mediated small interfering RNA delivery. Hepatology, 46(1), 84-94. | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 218 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 206 |