بررسی تغییر نسبت واریانس پلیژنی باقیمانده بر توانایی پیش بینی ارزیابی ژنومی نتاج آمیخته | ||
| علوم دامی ایران | ||
| دوره 55، شماره 2، تابستان 1403، صفحه 339-348 اصل مقاله (1.51 M) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2023.359139.653946 | ||
| نویسندگان | ||
| سمیه بارانی1؛ سید رضا میرائی آشتیانی* 2؛ اردشیر نجاتی جوارمی1؛ هادی دکتر هادی اسفندیاری3؛ مجید خان سفید4 | ||
| 1گروه علوم دامی، دانشکده .کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران | ||
| 2گروه علوم دامی، دانشکدگان .کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران | ||
| 3سازمان ملی پرورش و اصلاحنژاد گاو گوشتی(TYR)، هامار، نروژ. | ||
| 4بخش تحقیقات کشاورزی، وزارت کشاورزی استرالیا ، ویکتوریا، باندورا، استرالیا گروه زیست شناسی سامانه های کاربردی، دانشگاه لاتروب، | ||
| چکیده | ||
| ارزیابی ژنومی نتاج آمیخته به دلیل محدودیت دسترسی به شجره، ژنوتیپ و عملکرد آنها، معمولا بر اساس اطلاعات جمعیتهای خالص والدینی با هدف بهبود عملکرد نتاج آمیخته انجام میگیرد. به کارگیری ارزیابی ژنومی تکمرحلهای (ssGBLUP) علیرغم استفاده همزمان از اطلاعات حیوانات تعیین ژنوتیپ شده و فاقد ژنوتیپ برای افزایش توانایی پیشبینی، به دلیل عدم سازگاری ماتریسهای خویشاوندی ژنومی و شجرهای، ممکن است موجب پراکندگی بیشتر و اریب رو به بالا ارزش اصلاحی پیشبینی شده نسبت به روش BLUP شود. لذا در این مطالعه توانایی پیشبینی ارزش اصلاحی ژنومی افراد آمیخته بر اساس اطلاعات شبیه سازی شده جمعیتهای خالص والدینی و نتاج آمیخته با استفاده از روش ssGBLUP با در نظر گرفتن نسبتهای مختلف واریانس پلیژنی باقیمانده بررسی شده است. بر اساس نتیجه این پژوهش استفاده از نسبتهای مختلف واریانس پلیژنی باقیمانده (β) در ترکیب ماتریس خویشاوندی ژنومی و شجرهای، تاثیر قابل ملاحظهای بر صحت، اریب، پراکندگی پیشبینی ارزشاصلاحی ژنومی افراد آمیخته ندارد. بعلاوه در امتزاج ماتریس های خویشاوندی ژنومی و خویشاوندی شجرهای، نسبتهای مختلف واریانس پلیژنی باقیمانده(β) در مدت زمان رسیدن به نقطه همگرایی اثری نداشت. بنابراین برای سادگی بیشتر مدل، استفاده از حالت پیشفرض β (معادل 05/0) در تشکیل معکوس ماتریس خویشاوندی قابل توصیه میباشد. | ||
| کلیدواژهها | ||
| آمیخته گری؛ ارزیابی ژنومی تکمرحلهای؛ توانایی پیشبینی؛ شبیهسازی | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 626 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 470 |
||