پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 161 |
| تعداد شماره‌ها | 6,573 |
| تعداد مقالات | 71,036 |
| تعداد مشاهده مقاله | 125,506,822 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 98,770,788 |
مطالعه‌ی پویش کل ژنوم جهت شناسایی جایگاه‌های ژنتیکی مرتبط با بیماری لکوز در گاوهای هلشتاین ایران | ||
| علوم دامی ایران | ||
| مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده، انتشار آنلاین از تاریخ 17 تیر 1402 اصل مقاله (952.66 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2023.354617.653932 | ||
| نویسندگان | ||
| فرناز ارجمندکرمانی* 1؛ حسین مرادی شهربابک1؛ محمد مرادی شهربابک1؛ حسین محمدی2؛ مهدی جوان نیکخواه3؛ یونس دوستی1 | ||
| 1گروه علوم دامی ، دانشکده کشاورزی دانشگاه تهران، کرج، ایران | ||
| 2گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی دانشگاه اراک، اراک، ایران | ||
| 3گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی دانشگاه تهران، جلفا، ایران | ||
| چکیده | ||
| عفونت ویروس لوسمی گاوی بیشتر در گله های شیری شیوع داشته و تاکنون هیچ درمان یا واکسنی برای این بیماری شناخته نشده است. هدف از این پژوهش، مطالعه‌ی پویش کل ژنوم (GWAS) برای شناسایی مناطق ژنومی و ژن‌های کاندیدا مرتبط با عفونت به BLV بود. این مطالعه با استفاده از گاوهای هلشتاین ایران که به طور طبیعی آلوده به BLV بودند انجام گرفت. بدین منظور از 150 راس گاو هلشتاین در یکی از گاوداری صنعتی اصفهان، نمونه‌خون جمع‌آوری و از آن‌ها استخراج DNA و سرم انجام گردید. سپس نمونه‌های DNA آماده شده، با استفاده از تراشه‌های k30 (SNPchip30k) تعیین ژنوتیپ شدند. کنترل کیفیت نشانگرهای تعیین ژنوتیپ شده براساس شاخص‌های فراوانی آلل نادر (05/0 PMAF <)، ژنوتیپ از دست رفته (05/0PMIND >)، نرخ تعیین ژنوتیپ (05/0PGENO >) و تعادل هاردی_واینبرگ (6-10×1PH-W <) توسط نرم‌افزار PLINK انجام شد. بعد از آنالیز کنترل کیفیت 140 راس گاو (77 بیمار و 68 شاهد) و 22868 نشانگر برای ادامه آنالیز باقی‌ماند. پس از انجام آنالیز پویش ژنوم در برنامه PLINK در نهایت هشت نشانگر بالاتر از حد آستانه معنی‌داری، شناخته شدند. سپس با بررسی بیوانفورماتیکی مناطق ژنومی معنی‌دار با استفاده از پایگاه‌های برخط ensemble و genecards، ژن‌های مرتبط با نشانگرهای معنی‌دار، شناسایی شدند که مهم‌ترین آن‌ها شامل GRK4، TP53BP1، SCAPER، GLRB، PDGFC، TNIP2، PSTPIP1، CEP350، MR1، TOM1L2، SREBF1، COPS و TNFRS13B بود. آنالیز هستی‌شناسی ژن (GO) نشان داد که این ژن‌ها بیشتر در تنظیم فعالیت آنزیمی، پایداری DNA ، فعالیت لیپیدی، پاسخ ضد ویروسی ، پاسخ ایمنی ذاتی و مقاومت در برابر بیماری‌ها نقش دارند. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| ژنوتیپ؛ لنفوسیت؛ لوسمی گاوی؛ GWAS؛ SNP | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 259 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 207 |
||
سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب