تنوع توالی سیتوکروم-b ژنوم میتوکندی در اسبهای کرد ایران | ||
| علوم دامی ایران | ||
| دوره 54، شماره 2، تابستان 1402، صفحه 139-149 اصل مقاله (993.2 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2022.342038.653886 | ||
| نویسندگان | ||
| حسن جلیلیان مجد1؛ شیدا ورکوهی* 1؛ حمیدرضا سیدآبادی2 | ||
| 1گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه رازی، کرمانشاه، ایران. | ||
| 2موسسه تحقیقات علوم دامی کشور، سازمان تحقیقات، آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران | ||
| چکیده | ||
| بررسی توالی نوکلئوتیدی ناحیه سیتوکروم-b ژنوم میتوکندری در درون جمعیتها میتواند شاخص مناسبی از میزان تنوع موجود در جمعیت مورد مطالعه باشد. تحقیق اخیر به منظور بررسی تنوع ژنتیکی در اسب کرد و رابطه فیلوژنتیکی اسب کرد با سایر نژادهای اسب در دنیا با استفاده از ناحیه سیتوکروم-b انجام شد. بدین منظور از 30 رأس اسب نژاد کرد خونگیری بعمل آمد و DNA آن به روش نمکی استخراج گردید، سپس با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ناحیه سیتوکروم-b به طول 1029جفت باز تکثیر و تمام نمونهها بعد از خالصسازی توالییابی شدند. قطعه مورد نظر پس از توالییابی، با نرمافزار BioEdit ویرایش و قطعة 882 جفت بازی از آن استخراج شد. نمونهها با توالی مرجع اسب به شماره دسترسی (X79547) با استفاده از رویه Clustal-W همردیف شدند. تعداد هاپلوتیپ، جایگاههای نوکلئوتیدی متغیر، تنوع هاپلوتیپی و تنوع نوکلئوتیدی با استفاده از نرم افزار DNASP4.0 تعیین شد. درخت فیلوژنی با استفاده از نرم افزار MEGA6.1 به روش Neighbour-joining ترسیم شد. تعداد 7 هاپلوتایپ با 7 جایگاه نوکلئوتیدی متغیر شناسایی شد. هاپلوتایپهای بدست آمده همگی در هاپلوگروه K قرار گرفتند. میزان تنوع هاپلوتیپی و نوکلئوتیدی به ترتیب 001/0±784/0 و 001/0±00218/0 برآورد شد. ترکیب نوکلئوتیدها در توالی شاخص شامل 27/21% نوکلئوتید A، 77/32% نوکلئوتید C، 15/13% نوکلئوتید G و 87/26% نوکلئوتید Tبود. بر اساس نتایج آنالیز فیلوژنی، اسب کرد از نظر ژنتیکی به نژادهایی از ژاپن، چین ، نژادی از لهستان و عربستان نزدیکتر است، که نشان دهنده تشابه ژنتیکی بیشتر اسب کرد با نژادهای آسیایی و تا حدودی اروپایی میباشد.. | ||
| کلیدواژهها | ||
| اسب کرد؛ تنوع ژنتیکی؛ ژنوم میتوکندری؛ سیتوکروم b؛ فیلوژنی | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 729 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 560 |
||