بررسی تنوع ژنتیکی گوسفند نژادهای بومی (افشاری، قزل و مغانی) و خارجی (دورپر، مرینوس و رامنی) با استفاده از اطلاعات نشانگری متراکم | ||
| علوم دامی ایران | ||
| مقاله 10، دوره 49، شماره 3، پاییز 1397، صفحه 437-451 اصل مقاله (808.62 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2018.255597.653631 | ||
| نویسندگان | ||
| رقیه نبی لو1؛ محمد باقر زندی باغچه مریم* 2؛ محمدطاهر هرکی نژاد3 | ||
| 1دانشجوی سابق کارشناسی ارشد ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان | ||
| 2استادیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان | ||
| 3دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه زنجان | ||
| چکیده | ||
| استفاده از نشانگرهای مولکولی در سالهای اخیر جهت تعیین تنوع ژنتیکی بین جمعیتها و گونههای مختلف جانوری کاربرد گستردهای یافته است. مطالعات ژنتیک مولکولی، مقایسه تنوع ژنتیکی درون و بین نژادها و بازسازی از تاریخ نژاد و جمعیت اجدادی را امکانپذیر مینماید .این تحقیق با بررسی ساختار ژنتیکی در نژادهای بومی و خارجی با استفاده از 50000 نشانگر SNP با هدف شناسایی تنوع ژنتیکی انجام شد. اطلاعات ژنوتیپی مورد نیاز از پروژه Ovine HapMapشامل نژادهای بومی (نژاد افشاری، مغانی و قزل) و خارجی (نژاد دورپر، مرینوس و رامنی) اخذ گردید. آنالیز آماری با استفاده از چندین روش لایهبندی جمعیت، بررسی ساختار جمعیت با استفاده از آمار چند متغیره بیزی و روش مبتنی بر مدل بررسی شد. نتایج بهدستآمده از آنالیز مشخص مؤلفههای اصلی، تفکیک نژادهای ایرانی و خارجی را بهخوبی نشان داد و هر دو تصویر آشکاری از ساختار ژنتیکی جمعیتهای مورد بررسی را نشان داد. در روش DAPC، برای ارزیابی شمار بهینه خوشه با معیار ارزیابی BIC، 4K=بهترین نتیجه را نشان داد. علیرغم اینکه در این مطالعه از روشهای مختلف برای بررسی ساختار جمعیت استفاده شد، همه این روشها توانستند ساختار جمعیتهای بومی و خارجی را متمایز از هم نشان دهند که نژادهای ایرانی بررسیشده (افشاری، مغانی و قزل) در مقایسه با نژادهای خارجی دارای تشابه ژنتیکی بیشتری بوده و در یک گروه نژادی و نژادهای دورپر، مرینوس و رامنی در گروههای مجزای ژنتیکی قرار گرفتند. البته زمانیکه نژادهای داخلی به تنهایی مورد بررسی قرار گرفتند. این نژادها از لحاظ ژنتیکی کاملاً از هم متمایز بودند و میزان آماره تمایز جمعیتی Fst برای نژادهای افشاری، مغانی و قزل بهترتیب 038/0، 107/0 و 298/0 برآورد شد. | ||
| کلیدواژهها | ||
| آنالیز لایهبندی جمعیت؛ تنوع ژنتیکی؛ نژاد بومی | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,319 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,626 |
||