بررسی ساختار جمعیت و شناسایی نواحی تحت انتخاب در ژنگان اسبهای کرد و عرب ایرانی | ||
| علوم دامی ایران | ||
| مقاله 12، دوره 48، شماره 3، 1396، صفحه 429-438 اصل مقاله (757.67 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2017.245215.653580 | ||
| نویسندگان | ||
| صابر محمد مقصودی1؛ حسن مهربانی یگانه2؛ اردشیر نجاتی جوارمی3؛ نوید یوسفی مشعوف4 | ||
| 1دانشجوی دکتری، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج | ||
| 2دانشیار، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج | ||
| 3استاد، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج | ||
| 4دانشجوی سابق کارشناسی ارشد، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج | ||
| چکیده | ||
| اسب عرب از قدیمیترین نژادهای اسب جهان است. این نژاد عملکرد بسیار خوبی در مسابقات استقامتی و بهطورکلی عملکرد ورزشی داشته و در تشکیل برخی نژادهای مهم جهان نقش داشته است. در مقابل، اسب کرد که بیشتر در زمینهای ناهموار و مناطق کوهستانی زندگی میکند، مناسب سواری در مناطق کوهستانی و مسابقات چوگان است. برای بررسی ساختار جمعیت و شناسایی قطعههای کروموزمی تحت انتخاب در این دو جمعیت، از 38 اسب عرب و 58 اسب کرد نمونۀ خون و مو گرفته شد. نمونهها پس از استخراج DNA، توسط 670K Axiom Equine Genotyping Array تعیین نژادگان (ژنوتیپ) شدند. تحلیل مؤلفههای اصلی (PCA) روی دادههای بهدستآمده از تعیین نژادگان انجام شد؛ سپس آمارۀ Fst برای هر SNP محاسبه و برای جلوگیری از اثر تنوع تصادفی ذاتی Fst محاسبهشده برای تک SNP، آنها در طول هر کروموزوم همگن شدند. نتایج بهدستآمده از تحلیل مؤلفههای اصلی این دو جمعیت نشان داد اسبهای عرب ایرانی نسبت به اسبهای کرد تنوع ژنتیکی بالاتری دارند. در این تحقیق، نشانههای انتخاب در شش جایگاه ژنگانی (ژنومی) شناسایی شد که بالاترین میزان آمارۀ Fst در کروموزم شماره 8 مشاهده شد. حاشیهنویسی جایگاههای تحت انتخاب منجر به شناسایی ژنهایی همانند ژنهای CaMKK2، ATP2A2 و MLXIP شد، که بهاحتمال با عملکرد در مسابقات استقامتی و بهطورکلی عملکرد ورزشی در اسبها مرتبط هستند و برای بررسیهای بیشتر پیشنهاد میشوند. | ||
| کلیدواژهها | ||
| تنوع ژنتیکی؛ نژاد اسب عرب؛ نژاد اسب کرد؛ نشانههای انتخاب | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,202 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 933 |
||