سامانه پشتیبانی خدمات اطلاعات

  اخبار و اعلانات

 آمار

تعداد نشریات161
تعداد شماره‌ها6,552
تعداد مقالات70,714
تعداد مشاهده مقاله124,599,197
تعداد دریافت فایل اصل مقاله97,806,858
رضاخانی, هاجر, داشاب, غلامرضا, وفای واله, مهدی. (1396). تجزیۀ تبارزایی و تکاملی توالی نوکلئوتیدی جایگاه ژن FASN. , 48(2), 185-196. doi: 10.22059/ijas.2017.229395.653519
هاجر رضاخانی; غلامرضا داشاب; مهدی وفای واله. "تجزیۀ تبارزایی و تکاملی توالی نوکلئوتیدی جایگاه ژن FASN". , 48, 2, 1396, 185-196. doi: 10.22059/ijas.2017.229395.653519
رضاخانی, هاجر, داشاب, غلامرضا, وفای واله, مهدی. (1396). 'تجزیۀ تبارزایی و تکاملی توالی نوکلئوتیدی جایگاه ژن FASN', , 48(2), pp. 185-196. doi: 10.22059/ijas.2017.229395.653519
رضاخانی, هاجر, داشاب, غلامرضا, وفای واله, مهدی. تجزیۀ تبارزایی و تکاملی توالی نوکلئوتیدی جایگاه ژن FASN. , 1396; 48(2): 185-196. doi: 10.22059/ijas.2017.229395.653519

تجزیۀ تبارزایی و تکاملی توالی نوکلئوتیدی جایگاه ژن FASN

علوم دامی ایران
مقاله 4، دوره 48، شماره 2، شهریور 1396، صفحه 185-196    اصل مقاله (894.17 K)
نوع مقاله: مقاله پژوهشی
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2017.229395.653519
نویسندگان
هاجر رضاخانی1؛ غلامرضا داشاب* 2؛ مهدی وفای واله2
1دانشجوی سابق کارشناسی ارشد، گروه علوم دامی، دانشگاه زابل
2استادیار، گروه علوم دامی، دانشگاه زابل
چکیده
در این بررسی به‌منظور آگاهی از روند تکاملی و مولکولی توالی نوکلئوتیدی جایگاه ژن FASN در پستانداران شمار 38 رأس گاو هلشتاین شیری (18 رأس کم تولید و 20 رأس پر تولید) انتخاب و خون‌گیری از ورید دمی آن‌ها انجام شد. استخراج DNA از خون کامل به روش فنول-کلروفرم صورت گرفت. واکنش زنجیره­ای پلیمراز برای افزایش قطعۀ 750 جفت بازی واقع در ناحیۀ اگزون 37 تا 39 جایگاه ژن FASN با استفاده از جفت آغازگرهای اختصاصی انجام گرفت و محصول PCR تعیین توالی شدند. توالی نوکلئوتیدی جایگاه ژن FASN در جمعیت مورد بررسی با دیگر توالی­های DNA جایگاه یادشده در پستانداران بر پایۀ جستجو در بانک اطلاعاتی ژنگان یا ژنوم (NCBI) به‌دست‌آمده و هم­تراز شدند. درصد جانشینی و جایگزینی نوکلئوتیدها با استفاده از روش بیشترین درستنمایی و همچنین ترسیم درخت تبارزایی (فیلوژنتیک) و تعیین روند انتخاب طبیعی به روش اتصال-همسایگی NJ (Neighbor- Joining) و UPGMA با نرم‌افزارهای MEGA6 و Dnasp5.1 انجام گرفت. نتایج به‌دست‌آمده از بررسی‌های داده‌های زیستی (بیوانفورماتیک) نشان داد، در درصد جانشینی در بازهای پورین  بیشتر از بازهای پیریمیدین بود. میزان عددی نسبت جایگزینی dN/dS در مقایسۀ توالی جایگاه ژن FASN در بین دو گروه گاوهای شیری پر تولید و کم تولید و همچنین در مقایسه با دیگر گونه­ها به ترتیب برابر با 16/1 و 12/1 محاسبه شدند که نشان‌دهندۀ انتخاب مثبت در فرآیند تکامل این ژن است. درخت تبارزایی برای ژن یادشده در موجودهای مختلف نشان داد، که در دستۀ پستانداران بوفالو و گاومیش، گربه و یوزپلنگ خویشاوندی بیشتری دارند (98%، 57%). نتایج نشان می­دهد، تفرق و انتخاب در طی سالیان متمادی سبب به وجود آمدن رقم­های جدید، پروتئین­های جدید و از سویی سبب تثبیت عملکرد آن‌ها در طی روند تکامل و پیشرفت در جهت خالص­سازی عملکرد آن‌ها شده است.
کلیدواژه‌ها
تبدیل ژنی؛ تکامل؛ توالی‌یابی؛ جهش تقاطعی؛ گاو هلشتاین
مراجع
  1. Chakravarthy, M. V., Zhu, Y., Yin, L., Coleman, T., Pappan, K. L., Marshall, C. A. & Semenkovich, C. F.(2009). Inactivation of hypothalamic FAS protects mice from diet-induced obesity and inflammation. Journal of Lipid Research, 50(4), 630-640.
  2. Chirala, S. S., Chang, H., Matzuk, M., Abu-Elheiga, L., Mao, J., Mahson, K., Finegold, M. & Wakil, S. J. (2003). Fatty acid synthesis is essential in embryonic development: Fatty acid synthase null mutants and most of the heterozygotes die in utero. ProctionNatl Academy Science, USA, 100, 6358-6363.
  3. Korber, B. (2000). HIV Signature and Sequence Variation Analysis. Computational Analysis of HIV Molecular. Sequences, Chapter 4, pages 55-72. Allen G. Rodrigo and Gerald H. Learn, eds. Dordrecht, Netherlands: Kluwer Academic Publishers.
  4. Li, W.H. (1997). Molecular Evolution. Sinauer, Sunderland, MA.
  5. Librado, P. & Rozas, J. (2009). DnaSP v5: software for comprehensive analysis of DNA polymorphism data. Journal of Bioinformatics, 25, 1451-1452.
  6. Morris, C. A., Cullen, N. G., Glass, B. C., Hyndman, D. L., Manley, T. R. , Hickey, S. M., McEwan, J. C., Pitchford, W. S., Bottema, C. D. & Lee, M. A. (2007). Fatty acid synthase effects on bovine adipose fat and milk fat. Mammalian Genome, 18, 64-74.
  7. Muñoz, G., Ovilo, C., Noguera, J. L., Sánchez, A., Rodríguez, C. & Silio, L. (2003). Assignment of the fatty acid synthase (FASN) gene to pig chromosome 12 by physical and linkage mapping. Animal Genetics, 34(3), 234-235.
  8. Nei, M. & Kumar, S. (2000). Molecular evolution and phylogenetics. New York: Oxford University Press. (pp. 51-72).
  9. Niranjan, S. K., Goyal, S., Dubey, P. K., Kumari, N., Mishra, S. K., Mukesh, M., & Kataria, R. S. (2016). Genetic diversity analysis of buffalo fatty acid synthase (FASN) gene and its differential expression among bovines. Gene, 575(2), 506-512
  10. Oztabak, K., Gursel, F. E., Akis, I., Ates, A., Yardibi, H. & Turkay, G.(2014). FASNGene Polymorphism in Indigenous Cattle Breeds of Turkey. Folia Biologica (Krakaw), 62, 29-35.
  11. Qiao, Y., Huang, Z., Li, Q., Liu, Z., Hao, C., Shi, G. & Xie, Z. (2007). Developmental changes of the FAS and HSL mRNA expression and their effects on the content of intramuscular fat in Kazak and Xinjiang sheep. Journal of Genetics and Genomics, 34(10), 909-917.
  12. Senaris, R., Garcia-Caballero, T., Casabiell, X., Gallego, R., Castro, R., Considine, R.V., Dieguez, C. & Casanueva, F. F. (1997). Synthesis of leptin in human placenta. Endocrinology, 138, 4501- 4504.
  13. Smith, S., Witkowski, A. & Joshi, A. K.(2003). Structural and functional organization of the animal fatty acid synthase. Prog Lipid Research, 42, 289-317.
  14. Suburu, J., Shi, L., Wu, J., Wang, S., Samuel, M., Thomas, M. J. & Chen, Y. Q. (2014). Fatty acid synthase is required for mammary gland development and milk production during lactation. American Journal of Physiology-Endocrinology and Metabolism, 306(10), 1132-1143. ‏
  15. Tamura, K. & Nei, M. (1993). Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees. Molecular Biology and Evolution, 10, 512-526.
  16. Tamura, K., Stecher, G., Peterson, D., Filipski, A. & Kumar, S. (2013). MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 6.0. Molecular Biology and Evolution, 30, 2725-2729.
  17. ‏Techenmacher, H. & Koch, G. (1991). Opioids in the milk, Etidocrine Regulation, 25, 147-150.
  18. Yang, C. Y., Huang, W. Y., Chirala, S. & Wakil, S. J. (1988). Complete amino acid sequence of the thioesterase domain of chicken liver fatty acid synthase. Biochemistry, 27(20), 7773-7777.
آمار
تعداد مشاهده مقاله: 657
تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 657





سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب