تعداد نشریات | 161 |
تعداد شمارهها | 6,532 |
تعداد مقالات | 70,501 |
تعداد مشاهده مقاله | 124,093,867 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 97,198,500 |
مطالعه تنوع ژنی مجتمع سازگاری نسجی و ارتباط آن با ژن فاکتور رشد شبه انسولینی 1 در طیور بومی خراسان | ||
مجله تحقیقات دامپزشکی (Journal of Veterinary Research) | ||
مقاله 15، دوره 71، شماره 4، دی 1395، صفحه 481-489 اصل مقاله (818.31 K) | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/jvr.2016.60005 | ||
نویسندگان | ||
عاطفه اسماعیل نژاد* 1؛ غلامرضا نیکبخت بروجنی2 | ||
1گروه پاتوبیولوژی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه شیراز، شیراز، ایران | ||
2گروه میکروبیولوژی و ایمونولوژی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران، ایران | ||
چکیده | ||
زمینه مطالعه: مجتمع سازگاری نسجی (MHC) در طیور با حساست یا مقاومت نسبت به بیماریها، صفات تولیدی و تولیدمثلی در ارتباط است و تشخیص تنوع آن در جمعیتهای در حال اصلاح نژاد میتواند به انتخاب جمعیتهای مقاوم به بیماریها همراه با خصوصیات تولیدی برتر کمک نماید. ارتباط MHC با صفات کمی میتواند به عدم تعادل پیوستگی جایگاه MHC با ژنهای اصلی کنترلکننده صفات کمی مربوط باشد. هدف: بررسی تنوع ژنهایMHC و احتمال پیوستگی آن با ژن فاکتور رشد شبه انسولینی 1 (IGF1) در جمعیت طیور بومی خراسان. روش کار: در مطالعه حاضر تعداد 313 نمونه DNA مربوط به جمعیت طیور بومی خراسان آزمایش شدند. به منظور تعیین ژنوتیپهای MHC از ریزماهواره LEI0258 و روش تحلیل قطعهای استفاده شد. تنوع تک نوکلئوتیدی (SNP) در ناحیه UTR- '5 ژن IGF1 با کمک آزمون RFLP و آنزیم محدودیت PstI مورد بررسی قرار گرفت. پیوستگی بین دو جایگاه ژنتیکی MHC و IGF1 نیز با با کمک نرمافزار SAS/Genetics و آزمون نسبت درست نمایی مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج: در جمعیت طیور بومی خراسان در مجموع 25 آلل (185 تا 493 جفت باز) و 76 ژنوتیپ از ریزماهواره LEI0258 تشخیص داده شد. دو آلل (PstI -) اAاو (PstI +) اBاو سه ژنوتیپ (AA، AB و BB) نیز برای ژن IGF1 شناسایی شدند. در جمعیت حاضر عدم تعادل پیوستگی بین دو جایگاه ژنتیکیMHC و IGF1 مشاهده شد (0083/0=p). نتیجهگیری نهایی: نتایج این مطالعه بیانگر تنوع ژنتیکی بالای MHC در جمعیت طیور بومی خراسان و نشاندهنده اهمیت این توده بومی به عنوان یک ذخیره ژنتیکی ارزشمند است. نتایج مطالعه پیوستگی ژنی موید فرضیه ارتباط MHC با صفات تولیدی از طریق پیوستگی آللهای MHC با ژنهای کنترلکننده این صفات است. | ||
کلیدواژهها | ||
مجتمع سازگاری نسجی؛ IGF1؛ پیوستگی ژنی؛ طیور بومی | ||
مراجع | ||
Abbasi, H.A., Kazemi, M. (2011) Detection of polymorphism at the Insulin Like Growth Factor-I gene in Mazandaran native chicken using polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism method. Am J Vet Sci. 6: 80-83.
Bashalkhanov, S., Pandey, M., Rajora, O. (2009) A simple method for estimating genetic diversity in large populations from finite sample sizes. BMC Genetics. 10: 84.
Bulut, Z., Kurar, E., Ozsensoy, Y., Nizamlioglu, M., Garip, M., Yilmaz, A., Caglayan, T., Dere, S., Kurtoglu, V., Dogan, M. (2013) Determination of chromosomal regions affecting body weight and egg production in Denizli X White Leghorn F2 populations. Eurasian J Vet Sci. 29: 30-38.
Chang, C.S., Chen, C.F., Berthouly-Salazar, C., Chazara, O., Lee, Y.P., Chang, C.M., Chang, K.H., BedHom, B., Tixier-Biochard, M. (2011) A global analysis of molecular markers and phenotypic traits in local chicken breeds in Taiwan. Anim Genet. 43: 172-182.
Chatterjee, R., Sharma, R.P., Bhattacharya, T.K., Niranjan, M., Reddy, B.L. (2010) Microsatellite variability and its relationship with growth, egg production, and immunocompetence traits in chickens. Biochem Genet. 48: 71-82.
Cheng, H.H. (2003) 21 Selection for Disease Resistance: Molecular Genetic Techniques.In: Poultry Genetics, Breeding, and Biotechnology.Muir, W.M., Aggrey, S.E. (eds.). (1st ed.) CABI publishing, UK. p. 385-399.
Dunnington, E.A., Larsen, A.S., O’Sullivan, N.P., Siegel, P.B. (1992) Growth and egg production traits in chickens as influenced by major histocompatibility types and background genomes. J Anim Breed Genet. 109: 188-196.
Ewald, S.J., Ye, X., Avendano, S., McLeod, S., Lamont, S.J., Dekkers, J.C. (2007) Associations of BF2 alleles with antibody titres and production traits in commercial pure line broiler chickens. Anim Genet. 38: 174-176.
Fulton, J.E., Juul-Madsen, H.R., Ashwell, C.M., McCarron, A.M., Arthur, J.A., O’Sullivan, N.P., Taylor Jr, R.L. (2006) Molecular genotype identification of the Gallus gallus major histocompatibility complex. Immunogenetics. 58: 407-421
Hoffmann, I. (2009) The global plan of action for animal genetic resources and the conservation of poultry genetic resources. World Poult Sci J. 65: 286-297.
Hunt, H.D., Jadhao, S., Swayne, D.E. (2010) Major histocompatibility complex and background genes in chickens influence susceptibility to high pathogenicity avian influenza virus. Avian Dis. 54: 572-575.
Izadi, F., Ritland, C., Cheng KM. (2011) Genetic diversity of the major histocompatibility complex region in commercial and noncommercial chicken flocks using the LEI0258 microsatellite marker. Poult Sci. 90: 2711-2717.
Javanrouh Aliabad, A., Seyedabadi, H., Taheri Dezfuli, B. (2011) Association of insulin-like growth factor-I gene with body comosition traits in Iranian commercial broiler lines. World App Sci J. 14: 71-76.
Joiner, K.S., Hoerr, F.J., Van, S.E., Ewald, S.J. (2005) The avian major histocompatibility complex influences bacterial skeletal disease in broiler breeder chickens. Vet Pathol. 42: 275-281.
Kim, M.H., Seo, D.S., Ko, Y. (2004) Relationship between egg productivity and insulin-like growth factor-I genotypes in Korean native Ogol chickens. Poult Sci. 83: 1203-1208. Lakshmanan, N., Gavora, J.S., Lamont, S.J. (1997) Major histocompatibility complex class II DNA polymorphisms in chicken strains selected for Marek’s disease resistance and egg production or for egg production alone. Poult Sci. 76: 1517-1523.
Li, H.F., Zhu, W., Chen, K., Song, W., Shu, J., Han, W. (2010) Effect of the polymorphism of GHR gene and IGF-I gene on egg quality in wenchang chicken. Res J Poult Sci. 3: 19-22.
Lima-Rosa, C.A.D.V., Canal, C.W., Fallavena, P.R.V., Freitas, L.B.D., Salzano, F.M. (2005) LEI0258 microsatellite variability and its relationship to B-F haplotypes in Brazilian (blue-egg Caipira) chickens. Genet Mol Biol. 28: 386-389.
Lunden, A., Edfors-Lilja, I., Johansson, K., Liljedahl, L.E. (1993) Associations between major histocompatibility complex genes and production traits in White Leghorns. Poult Sci. 72: 989-999.
Lwelamira, J., Kifaro, G.C., Gwakisa, P.S., Msoffe, P.L.M. (2008) Association of LEI0258 microsatellite alleles with antibody response against Newcastle disease virus vaccine and body weight in two Tanzania chicken ecotypes. Afr J Biotechnol. 7: 714-720.
Malago, J.J., Baitilwake, M.A. (2009) Egg traits, fertility, hatchability and chick survivability of Rhode Island Red, local and crossbred chickens. Tanz Vet J. 26: 24-36.
McConnell, S.K., Dawson, D.A., Wardle, A., Burke, T. (1999) The isolation and mapping of 19 tetranucleotide microsatellite markers in the chicken. Anim Genet. 30: 183-189.
Miller, M.M., Bacon, L.D., Hala, K., Hunt, H.D., Ewald, S.J., Kaufman, J., Zoorob, R., Briles, W.E. (2004) Nomenclature for the chicken major histocompatibility (B and Y) complex. Immunogenetics. 56: 261-279.
Mueller, J. (2004) Linkage disequilibrium for different scales and applications. Brief Bioinform. 5: 355-364.
Muir, W.M., Wong, G.K.S., Zhang, Y., Wang, J.M. Groenen, A., Crooijmans, R.P., Megens, H.J., Zhang, H., Okimoto, R., Vereijken, A., Jungerius, A., Albers, G.A.A., Lawley, C.T., Delany, M.E., MacEachern, S., Cheng, H.H. (2008) Genome-wide assessment of worldwide chicken SNP genetic diversity indicates significant absence of rare alleles in commercial breeds. Proc Natl Acad Sci. 105: 17312-17317.
Nagaraja, S.C., Aggrey, S.E., Yao, J., Zadworny, D., Fairfull, R.W., Kuhnlein, U. (2000) Trait association of a genetic marker near the IGFI gene in egg-laying chickens. J Hered. 91: 150-156.
Nikbakht, G., Esmailnejad, A., Barjesteh, N. (2013) LEI0258 Microsatellite Variability in Khorasan, Marandi, and Arian Chickens. Biochem Genet. 51: 341-349.
Notter, D.R. (1999) The importance of genetic diversity in livestock populations of the future. J Anim Sci. 77: 61-69.
Owen, J.P., Delany, M.E., Mullens, B.A. (2008) MHC haplotype involvement in avian resistance to an ectoparasite. Immunogenetics. 60: 621-631.
Safalaoh, C.L. (2001) Village chicken upgrading programme in Malawi. World Poult Sci J. 57: 180-187.
Sander, J.E. (1993) The major histocompatiblity complex and its role in poultry production. World Poult Sci J. 49: 132.
Schou, T.W., Permin, A., Juul-Madsen, H.R., Sorensen, P., Labouriau, R., Nguyen, T.L., Fink, M., Pham, S.L. (2007) Gastrointestinal helminths in indigenous and exotic chickens in Vietnam: association of the intensity of infection with the Major Histocompatibility Complex. Parasitology. 134: 561-573.
Sheldon, B.L. (2000) Research and development in 2000: Directions and priorities for the World’s Poultry Science Community. Poult Sci. 78: 147-158.
Suzuki, K., Matsumoto, T., Kobayashi, E., Uenishi, H., Churkina, I., Plastow, G., Yamashita, H., Hamasima, N., Mitsuhashi, T. (2010) Genotypes of chicken major histocompatibility complex B locus associated with regression of Rous sarcoma virus J-strain tumors. Poult Sci. 89: 651-657.
Tadelle, D., Alemu,Y., Peters, K.J. (2000) Indigenous chickens in Ethiopia: genetic potential and attempts at improvement. World Poult Sci J. 56: 45-54.
Tang, S., Sun, D., Ou, J., Zhang, Y., Xu, G., Zhang, Y. (2010) Evaluation of the IGFs (IGF1 and IGF2) genes as candidates for growth, body measurement, carcass, and reproduction traits in Beijing You and Silkie chickens. Anim Biotech. 21: 104-113.
Vali, N. (2008) Indigenous chicken production in Iran: A Review. Pak J Biol Sci. 11: 2525-2531.
Van der Most, P.J., De Jong, B., Parmentier, H.K., Verhulst, S. (2011) Trade-off between growth and immune function: a meta-analysis of selection experiments. Funct Ecol. 25: 74-80
Weigend, S., Matthes, S., Solkner, J., Lamont, S.J. (2001) Resistance to Marek’s disease virus in White Leghorn chickens: effects of avian leukosis virus infection genotype, reciprocal mating, and major histocompatibility complex. Poult Sci. 80: 1064-1072.
Yeh, F.C., Yang, R.C., Boyle, T.B.J., Mao, J.X. (1997) POPGENE software: Microsoft Windows-based freeware for population genetic analysis. (version 1.32) Center for International Forestry Research, University of Alberta. Edmonton, Canada.
| ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,602 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 968 |