شناسایی و ارزیابی الگوی بیان ژنهای دخیل در مسیرهای سیگنالدهی در آجیلوپس (Aegilops tauschii) تحت تنش شوری | ||
| علوم گیاهان زراعی ایران | ||
| مقاله 6، دوره 47، شماره 2، 1395، صفحه 205-216 اصل مقاله (699.37 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijfcs.2016.58855 | ||
| نویسندگان | ||
| مهدی منصوری1؛ محمد رضا نقوی* 2؛ هوشنگ علیزاده3؛ قاسم محمدی نژاد4؛ سید احمد موسوی5؛ قاسم حسینی سالکده6 | ||
| 1دانشجوی دکتری، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج | ||
| 2استاد پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج | ||
| 3استادیار، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج | ||
| 4دانشیار گروه زراعت و اصلاح نباتات دانشگاه شهید باهنر کرمان | ||
| 5گروه سلولهای بنیادی، مرکز تحقیقات علوم سلولی جهاد دانشگاهی، پژوهشگاه رویان، تهران | ||
| 6دانشیار، بخش ژنومیکس پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی کرج | ||
| چکیده | ||
| شور شدن زمینهای کشاورزی یکی از مهمترین عاملهای محدودکنندۀ تولیدات کشاورزی و تهدیدکنندۀ امنیت غذایی در کشورهای جهان بهشمار میآید. فعال شدن مسیرهای سیگنالی نخستین رخداد در شناسایی تنشهای محیطی برای گیاهان بهشمار میآید. شناسایی اجزای شبکۀ سیگنالی در پاسخ به تنش شوری با استفاده از روش RNA Seq در گیاه آجیلوپس بهعنوان منشأ ژنگان (ژنوم) DD در گندم، اهمیت زیادی دارد. توالییابی RNA به همراه استفاده از نرمافزار MapMan برای تفسیر عملکردی نتایج بیان ژن روش مناسب برای بررسیهای ژننامه شناسی (ژنومیکس) کارکردی در گیاهان به شمار میآید. لذا در این تحقیق با استفاده از کتابخانۀ تهیهشده از RNA استخراجشده از گیاهان کنترل و تحت تنش، اقدام به شناسایی و ارزیابی کمی ژنهای دخیل در فرآیندهای سیگنالی شد. نتایج بیان ژن نشان داد که از بین 4506 رونوشت دارای تغییر بیان معنیدار، فرآیندهای سیگنالی با 603 عدد BIN (59/11 درصد) بیشترین شمار را به خود اختصاص داد. همچنین مشخص شد که از بین اجزای شبکۀ سیگنالی، گیرندة (رسپتور) کینازها بیشترین شمار (222 عدد BIN) از ژنهای تغییربیانیافته را شامل میشوند که درواقع بیانکنندۀ اهمیت آنها است. این تحقیق بهعنوان یک بررسی بنیادی به شمار میآید که زمینه برای انجام بررسیهای انتقال ژنهای مقاومت به شوری به گیاه گندم را فراهم میکند. | ||
| کلیدواژهها | ||
| توالییابی؛ شوری؛ فرآیندهای سیگنالی؛ RNA Seq | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 2,071 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 2,135 |
||