تعداد نشریات | 161 |
تعداد شمارهها | 6,573 |
تعداد مقالات | 71,036 |
تعداد مشاهده مقاله | 125,507,096 |
تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 98,770,967 |
مطالعه تنوع ژن BuLA-DRB3 در گاومیش رودخانه ای خوزستان | ||
مجله تحقیقات دامپزشکی (Journal of Veterinary Research) | ||
مقاله 5، دوره 71، شماره 1، فروردین 1395، صفحه 33-40 اصل مقاله (1007.63 K) | ||
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/jvr.2016.57397 | ||
نویسندگان | ||
محمد مهدی رنجبر1؛ غلامرضا نیکبخت بروجنی* 1؛ علیرضا قدردان مشهدی2؛ مهران دباغیان3 | ||
1گروه میکروبیولوژی و ایمونولوژی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران-ایران | ||
2دانشکده دامپزشکی، دانشگاه شهید چمران اهواز، اهواز، ایران | ||
3دانش آموخته دوره دکترای تخصصی ایمنی شناسی، دانشکده دامپزشکی دانشگاه تهران، تهران-ایران | ||
چکیده | ||
زمینه مطالعه: مجتمع اصلی سازگاری نسجی (MHC) شامل گروهی از ژنها است که نقش مهمی در پاسخهای ایمنی دارند. اگزون 2 از ژن BuLA-DRB3 بخشی از MHC کلاس 2 در گاومیش است که تنوع بسیار بالایی داشته و آللهای آن با مقاومت/حساسیت به بیماریها و همچنین با خصوصیات تولیدی مرتبط هستند. هدف: شناسایی تنوع ژن BuLA-DRB3 در گاومیشهای خوزستان و مقایسه آن با سایر جمعیتهای گاومیش ایران و جهان. روش کار: نمونههای خون از 136 گاومیش رودخانهای خوزستانی غیر خویشاوند تهیه گردید. پس از استخراج DNA، اگزون دو از ژن BuLA-DRB3 با روش seminested PCR افزوده سازی شد. سپس قطعات حاصل از افزودهسازی اگزون دو به وسیله آنزیم محدوداثر RsaI برش داده شدند. در ادامه، فراوانی آللی، فراوانی ژنوتیپی، هوموزیگوتی و هتروزیگوتی مورد انتظار و مشاهده شده محاسبه گردید. نتایج: در آنالیز قطعات برشی به ترتیب 13 و 24 الگوی آللی و ژنوتیپی برای آنزیم برشی RsaI شناسایی گردید. 10 مورد از این آللها پیش از این گزارش شده بودند. فراوانترین ژنوتیپ oo (0.1691) بوده که به دنبال آن ژنوتیپهای hh (0.1544)، ll (0.1103)، lw (0.0955)، lh (0.0808)، ha (0.0661) و lo (0.0514) قرار داشتند. همچنین چهار آلل با فراوانی بالا به ترتیب آللهای o (0.2721)، h (0.2316)، l (0.2316) و w (0.1176) بودند. این هفت ژنوتیپ و چهار آلل به ترتیب 72.76% و 74.29% فراوانی ژنوتیپی و آللی جمعیت را در بر میگیرند. به علاوه، تخمین هتروزیگوتی/هوموزیگوتی و انحراف از تعادل جمعیت مربوطه حاکی از این مورد است که هوموزیگوتی مشاهده شده بیش از هتروزیگوتی مشاهده شده است و جمعیت از تعادلهاردی واینبرگ انحراف دارد. بحث: نتایج مطالعه حاضر حاکی از تنوع بالای اگزون دو از ژن BuLA-DRB3 در میان جمعیت گاومیشهای خوزستان بوده و در عین تفاوتها درتنوع ژنتیکی MHC گاومیشها در نقاط مختلف دنیا، جمعیت گاومیش خوزستان با جمعیت گاومیش مصر مشابهت بیشتری دارد. | ||
کلیدواژهها | ||
آلل؛ اگزون دو از BuLA-DRB3؛ فراوانی؛ گاومیش رودخانه ای خوزستانی؛ تنوع | ||
مراجع | ||
Acharya, C.P., Pipalia, D.L., Rank, D.N., Joshi, C.G., Brahmkshtri, B.P., Solanki, J.V., Shah, R.R. (2002) BOLA-DRB3 gene polymorphism in Jafarabadi and Mehsani buffaloes as revealed by PCR-RFLP. Ind Vet J. 79: 652-656.## Behl, J.D., Verma, N.K., Behl, R., Mukesh, M., Ahlawat, S.P.S. (2007) Characterization of genetic polymorphism of the bovine lymphocyte antigen DRB3.2 locus in Kankrej cattle (Bos indicus). J Dairy Sci. 90: 2997-3001.## De, S., Singh, R.K., Butchaiah, G. (2002) MHC-DRB exon 2 allele polymorphism in Indian river buffalo (Bubalus bubalis). Anim Genet. 33: 215-219.## Kumar, S., Sangwan, M.L., Rupender, A. (2008) Polymorphismin DRB3 exon 2 by PCR-RFLP and its association with mastitis in Nili-Ravi breed. Indian J Biotech. 7: 398-400.## Kumar, S., Sangwan, M.L., Ahlawat, S., Barwar, A. (2011) Polymorphismin DRB3 exon 2 by PCR-RFLP and its association with mastitis in Murrah buffaloes. Indian J Biotech. 10: 232-234.## Levene, H. (1949) On a matching problem arising in genetics. Ann Math Stat. 20: 91-94.## Mosafer, J., .Heydarpour, M., Manshad, E., Russell, G., Sulimova, G.E. (2012) Distribution of BoLA-DRB3 Allelic Frequencies and Identification of Two New Alleles in Iranian Buffalo Breed. Sci World J. 12: 22-28.## Nanda, A.S., Nakao, T. (2003) Role of buffalo in the socioeconomic development of rural Asia: Current status and future prospectus. Anim Sci J. 74: 443-455.## Nei, M. (1973) Analysis of gene diversity in subdivided populations. Proc Natl Acad Sci. 70: 3321-3323.## Othman, O.E., Ahmed, S.S. (2010) Genetic polymorphism of BoLA-DRB3 exon 2 in egyptian buffalo. Genes Genomes Genomics. 4: 70-73.## Pasha, T.N., Hayat, Z. (2012) Present situation and future perspective of buffalo production in Asia. J Anim and Plant Sci. 22: 250-256.## Pipalia, D.L., Joshi, C.G., Rank, D.N., Brahmshktri, B.P., Solanki, J.V. (2004) PCR-SSCP typing of MHC in cattle and buffaloes. Ind J Anim Sci. 74: 637-639.## Rahimnahal, S., Fayazi, J., Mirzadeh, K., Nassiry, M.T., Roshanfekr, H. (2010a) Detection of allelic polymorphism in a gene of the major histocompatibility complex of Iranian buffalo. J Anim Vet Adv. 9: 1902-1904.## Rahimnahal, S., Fayazi, J., Mirzadeh, K., Nassiry, M.T., Roshanfekr, H. (2010b) Determining BoLA-DRB3 exon 2 polymorphism in buffalo population in Khouzestan province by PCR-RFLP method. Gen Eng Biosafety J. 2: 121-128.## Rupp, R., Hernandez, A., Mallard, B.A. (2007) Association of bovine leukocyte antigen (BoLA)DRB3.2 with immune responce, mastitis and production and type traits. Dairy Sci. 90: 1029-1039.## Sena, L., Schneider, M.P.C., Brenig, B., Honeycutt, R.L., Womack, J.E., Skow L.C. (2003) Polymorphisms in MHC-DRA and -DRB alleles of water buffalo (Bubalus bubalis) reveal diferent features from cattle DR alleles. Anim Genet. 34: 1-10.## Sheikhmohammadi, R., Hashemi, A., Mardani, K. (2010) Analysis of polymorphism of MHC class II BuLA DRB3 exon 2 gene in North West Iranian populations of the Water buffalo (Bubalusbubalis) through PCR-SSCP. Int J Vet Res. 4: 265-268.## Takeshima, S.N., Ikegami, M., Morita, M., Nakaim, Y., Aida, Y. (2001) Identification of new cattle BoLA-DRB3 alleles by sequence-based typing. J Immunogenet. 53: 74-81.## Tizard, I.R. (2009) Acquired immunity: Antigen-presenting receptors. In: Veterinary Immunology., Saunders (7th ed.) Philadelphia. USA. p. 67-76.## Van Eijk, M.J., Stewart-Haynes, J.A., Lewin, H.A. (1992) Extensive polymorphism of the BoLA-DRB3 gene distinguished by PCR-RFLP. Anim Genet. 23: 483-496.## Wenink, P.W., Groen, A.F., Roelke-Parker, M.E., Prins, H.H. (1998) African buffalo maintain high genetic diversity in the major histocompatibility complex in spite of historically known population bottlenecks. Mol Ecol. 7: 1315-132.## | ||
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,321 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,136 |