مقایسه دقت برآورد ارزش اصلاحی ژنومی برای صفات تولید در گاوهای هلشتاین ایران با روشهای پارامتری و ناپارامتری | ||
| تولیدات دامی | ||
| مقاله 1، دوره 18، شماره 1، 1395، صفحه 1-11 اصل مقاله (563.67 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/jap.2016.55354 | ||
| نویسندگان | ||
| یحیی محمدی1؛ محمد مهدی شریعتی* 2؛ سعید زره داران3؛ محمد رزم کبیر4؛ محمدباقر صیادنژاد5؛ محمدباقر زندی5 | ||
| 1دانشجوی دکتری، گروه علوم دامی، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، ایران | ||
| 2استادیار، گروه علوم دامی، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، ایران | ||
| 3استاد، گروه علوم دامی، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، ایران | ||
| 4استادیار، گروه علوم دامی، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه کردستان، ایران | ||
| 5مرکز اصلاح نژآد و بهبود تولیدات دامی کشور | ||
| چکیده | ||
| انتخاب ژنومی ابزاری جدید برای برآورد ارزشهای اصلاحی صفات کمّی با استفاده از نشانگرهای مولکولی است. معیار کارایی انتخاب ژنومی، دقت پیشبینی ارزشهای اصلاحی ژنومی است. در تحقیق حاضر، دقت پیشبینی ژنومی روشهای پارامتری و ناپارامتری در 345 گاو هلشتاین محاسبه شد. صفات مطالعهشده مقدار شیر، میزان چربی، میزان پروتئین، و سلولهای سوماتیک شیر بود. دو روش پارامتری بهترین پیشبینی نااریب خطی ژنومیک (GBLUP) و بیز B و دو روش ناپارامتری فضای هیلبرت با هستۀ بازآفرین (RKHS) و شبکههای عصبی (NN) برای برآورد تأثیرات نشانگرها و پیشبینی و دقت ارزشهای اصلاحی ژنومی استفاده شد. دقت پیشبینی ژنومی در دامنۀ 39/0 (برای سلولهای سوماتیک) تا 73/0 (برای تولید چربی) محاسبه شد. بیز B و دو روش ناپارامتری در مقایسه با روش GBLUP دچار کوچککردن بیشتر پیشبینیها شده بودند (منحنی ضریب رگرسیون ارزش اصلاحی ژنومی بر ارزش اصلاحی کلاسیک بیشتر از یک بهدست آمد). درمقایسه با همۀ روشها دقت بیز B بیشتر شد. میانگین مربعات خطای پیشبینی برای روش GBLUP به نسبت دیگر روشها برای صفات مطالعهشده کمتر برآورد شد. مدل رگرسیون بیز B برای انتخاب ژنومی در این جمعیت مطلوب بود، ولی برای بهبود دقت با این روش نیاز به کاهش آبرفتگی پیشبینی در این روش است. | ||
| کلیدواژهها | ||
| انتخاب ژنومی؛ دقت انتخاب؛ روشهای پارامتری و ناپارامتری؛ نشانگرهای مولکولی | ||
| مراجع | ||
|
| ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 3,437 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,350 |
||