سامانه پشتیبانی خدمات اطلاعات

  اخبار و اعلانات

 آمار

تعداد نشریات161
تعداد شماره‌ها6,532
تعداد مقالات70,501
تعداد مشاهده مقاله124,105,012
تعداد دریافت فایل اصل مقاله97,210,635
نوراللهی, خشنود, شهبازی, معصومه. (1394). بررسی ساختار ژنتیکی جمعیت‌های قارچ Pyrenophora gramineaعامل بیماری لکه نواری جو با استفاده از نشانگر ISSR. , 46(1), 161-177. doi: 10.22059/ijpps.2015.54731
خشنود نوراللهی; معصومه شهبازی. "بررسی ساختار ژنتیکی جمعیت‌های قارچ Pyrenophora gramineaعامل بیماری لکه نواری جو با استفاده از نشانگر ISSR". , 46, 1, 1394, 161-177. doi: 10.22059/ijpps.2015.54731
نوراللهی, خشنود, شهبازی, معصومه. (1394). 'بررسی ساختار ژنتیکی جمعیت‌های قارچ Pyrenophora gramineaعامل بیماری لکه نواری جو با استفاده از نشانگر ISSR', , 46(1), pp. 161-177. doi: 10.22059/ijpps.2015.54731
نوراللهی, خشنود, شهبازی, معصومه. بررسی ساختار ژنتیکی جمعیت‌های قارچ Pyrenophora gramineaعامل بیماری لکه نواری جو با استفاده از نشانگر ISSR. , 1394; 46(1): 161-177. doi: 10.22059/ijpps.2015.54731

بررسی ساختار ژنتیکی جمعیت‌های قارچ Pyrenophora gramineaعامل بیماری لکه نواری جو با استفاده از نشانگر ISSR

دانش گیاهپزشکی ایران
مقاله 17، دوره 46، شماره 1، فروردین 1394، صفحه 161-177    اصل مقاله (588.49 K)
نوع مقاله: مقاله پژوهشی
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijpps.2015.54731
نویسندگان
خشنود نوراللهی* 1؛ معصومه شهبازی2
1استادیار، گروه گیاه‌پزشکی، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه ایلام
2کارشناس ارشد بیماری‌شناسی گیاهی، دانشکدۀ کشاورزی، دانشگاه ایلام
چکیده
لکه ‌نواری یکی از مهم‌ترین بیماری‌های جو در استان ایلام است که قارچ Pyrenophora graminea آن را ایجاد می‌کند. برای تعیین ساختار ژنتیکی جمعیت‌های قارچ P. graminea از گیاهان آلودۀ جو در مزارع مناطق مختلف استان ایلام که زخم‌های قهوه‌ای‌رنگ نواری در اندام‌های هوایی داشتند، به‌طور تصادفی نمونه‌برداری صورت گرفت. در نهایت 69 جدایه از نمونه‌های آلوده با استفاده از محیط کشت سیب‌زمینی ـ دکستروز ـ آگار به‌دست آمد. برای آزمون بیماری‌زایی عامل بیماری به دلیل تولید نشدن اسپور کافی در محیط کشت مصنوعی از روش ساندویچی برای آلوده‌سازی بذرها استفاده شد. برای مطالعۀ تنوع ژنتیکی در جدایه‌ها از هشت نشانگر ISSR مخصوص قارچP. gramineaاستفاده گردید. تعداد کل 171 آلل در بین همۀ جمعیت‌ها در اثر آغازگر بین ریزماهواره مشخص شدند. تعداد آلل‌ها برای هر نشانگر از 16 تا 30 عدد متغیر بودند.گروه‌بندی جدایه‌ها بر اساس ضریب تشابه دایس و روش UPGMA انجام گرفت و بر این اساس سیزده گروه مشخص شد. مقایسۀ پارامترهای مربوط به تنوع ژنتیکی در جمعیت‌ها نشان داد که جمعیت دره‌شهر )32/0 (h= دارای بالاترین تنوع ژنتیکی است. کوچک‌ترین فاصلۀ ژنتیکی به مقدار 019/0 بین جمعیت‌های آسمان‌آباد و سیروان مشاهده گردید. بر اساس فنوگرام به‌دست‌آمده برای جمعیت‌ها، دو گروه جمعیت نشان داده شد. یک گروه شامل جمعیت دره‌شهر و گروه بعدی شامل جمعیت‌های ایوان، آسمان‌آباد، سیروان و چرداول بود. تجزیۀ واریانس مولکولی برای مقایسۀ تنوع ژنتیکی داخل و بین جمعیت‌ها نشان داد که بیشترین تنوع مربوط به داخل جمعیت‌ها به مقدار 94 درصد است و میزان تنوع ژنتیکی در بین جمعیت‌ها بسیار کم است و این میزان تنوع ژنتیکی بین جمعیت‌ها را می‌توان با مقدار بالای جریان ژنی به مقدار 576/4 بین جمعیت‌ها توجیه کرد.
کلیدواژه‌ها
آغازگرهای بین ریزماهواره؛ جو؛ ساختار ژنتیکی؛ Pyrenophora graminea
مراجع
  1. Arabi, M. I. E. & Jawhar, M. (2007). Heterogeneity in Pyrenophora graminea as revealed by ITS-RFLP. Journalof Plant Pathology, 89, 391-395.
  2. Babadost, M. (1998). Barley Strip Disease (Pyrenophora graminea Itao and Kur.) Tabriz University publications. 32p.
  3. Bakonyi, J. & Justesen, A. F. (2007). Genetic relationship of Pyrenophora graminea, P. teres f. sp. aculata and P. teres f. sp. teres assessed by RAPD analysis. Journal of Phytopathology, 155, 76-83.
  4. Bahmnya, M. R. (1994). Cold cereal. Tehran University Institute of Publishing and Printing. 634p.
  5. Bayratkar, H. & Akan, K. (2012). Genetic characterization of Pyrenophora  graminea isolates and the reactions of some barley cultivars to leaf stripe disease under greenhouse conditions. Turkish Journal of Agriculture and Forestry, 36, 329-339.
  6. Bogacki, P., Keiper, F. J. & Oldach, K. H. (2011). Genetic structure of South Australian Pyrenophora teres populations as revealed by microsatellite analyses. Fungal Biology, 114, 834-841.
  7. Campbell, F. & Lucas, A. (2002). Evidence of recombination between net- and spot-type populations of Pyrenophora teres as determined by RAPD analysis. The British Mycological Society, 106, 602-608.
  8. Chadha, S. & Gopalakrishna, T. (2007). Comparative assessment of REMAP and ISSR marker assays for genetic polymorphism studies in Magnaporthe grisea. Current Science, 93, 688-692.
  9. Chakrabotry, S. & Newton, A. C. (2011). Climate change, plant diseases and food security. An overview. Plant Pathology, 60(1), 2-14.
  10. Chawla, H. S. (2002). Introduction to plant biotechnology, Technology & Engineering, 288p.
  11. Culley, T. (1999). Population genetic analysis of ISSR data. Biology Protocoles. Extraído el 5 de octubre de 2009 del sitio web: http://www.biology.uc.edu/faculty/culley/Protocols/Population%20Genetic%20Analysis%20of%20ISSR%20Data.pdf.
  12. Doyle, J. J. & Doyle, J. L. (1990). A rapid total DNA preparation procedure for fresh plant tissue. Focus, 12, 13-15.
  13. Freeman, J., Ward, E., Gutteridge, R. J. & Bateman, G. L. (2005). Methods for studying population structure, including sensitivity to the fungicide silthiofam, of the cereal take- all fungus, Gaeumannomyces graminis var. tritici. Plant Pathology, 54, 686-698.
  14. Gurjar, G., Barve, M., Giri, A. & Gupta, V. (2009). Identification of Indian pathogenic races of Fusarium oxysporum f. sp. ciceris with gene specific, ITS and random markers. Mycologia, 101, 480-491.
  15. Jamshidi, S., Ghaffari, A., Sadeghzadeh, M. & Mianaji, M. (2008). Assessment of barley seeds chemical treatments with some conventional fungicides on barley strip controlling. Journal of New Agriculture Sciences, 8, 17-25.
  16. Jawhar, M. & Arabi, M. I. E. (2006). Genetic variability among Pyrenophora graminea isolates. Australasian Plant Pathology, 35, 279-281.
  17. Kumar, M., Mishra, G. P., Singh, R., Kumar, J., Naik, P. K. & Singh, S. B. (2009). Correspondence of ISSR and RAPD markers for comparative analysis of genetic diversity among different apricot genotypes from cold arid deserts of trans-Himalayas. Physiology and Molecular Biology of Plants, 15(3), 225-236.
  18. Mcdonald, B. A. (1997). The population genetics of fungi. Tools and techniques. Symposium on population genetics of soilborne fungal Plant Pathogens. Phytopathology, 87(4), 448-453.
  19. Mcmullen, M. & Adhikari, T. (2009). Fungal leaf Spot diseases of wheat tan spot. Stagonospora nodorum blotch and Septoria tritici blotch, Plant Disease Management. 1249(revised).
  20. Mohammadi, S. A. & Prasanna, B. M. (2003). Analysis of genetic diversity in crop plant: Salien statistical tools and considerations. Crop Science, 43, 1248-1235.
  21. Nielsen, M. & Bent, J.  (2002). Screening for resistance to leaf stripe (Pyrenophora graminea) in barley, Proceedings of the second international workshop on barley leaf blights. ICARDA Aleppo. Syria, 277-280.
  22. Peakall, R. & Smouse, P. E. (2012). GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research-an update. Bioinformatics, 28, 2537-2539.
  23. Peever, T. L., Ibanez, A., Akimitsu, K. & Timmer, L. W. (2002). Worldwide phylogeography of  the citrus brown spot pathogen, Alternaria alternata. Phytopathology, 92, 794-802.
  24. Perrier, X. & Jacquemoud-Collet, J. P. (2007). DARwin software http://darwin.cirad.fr/darwin.
  25. Rachdowang, S. (1999). PCR-based test for differentiating varieties of Gaeumannomyces graminis, the take-all pathogens. Ph.D. thesis. Virginia polytechnic institute and state university. 184p.
  26. Ratnaparkhe, M. B., Tekeoglu, M. & Muehlbauer, F. J. (1998). Inter-simple-sequence-repeat (ISSR) polymorphism are useful for finding markers associated with disease resistance gene clusters. Theoretical and Applied Genetics, 97, 515-519.
  27. Rau, D., Attene, G., Brown, A. H. D., Nanni, L., Maier, F. J., Balmas, V., Saba, E., Schafer, W. & Papa, R. (2008). Diversity and evolution in the barley pathogen Pyrenophora teres. Options Mediterraneans, 81, 147-150.
  28. Reddy, M. P., Sarla, N. & Siddiq, E. A. (2002). Inter simple sequence repeat (ISSR) polymorphism and its application in plant breeding. Euphytica, 128, 9-17.
  29. Rodrigues, K. F., Sieber, T. N., Grunig, C. R. & Holdenrieder, O. (2004). Characterization of Guignardia mangiferae isolated from tropical plants based on morphology, ISSR-PCR amplifications and ITS1-5.8S-ITS2 sequences. Mycological Research, 108, 45-52.
  30. Rohlf, F. J. (1998). NTSYS-pc Numerical taxonomy and multivariate analysis system, version 2.02. Exeter Software. Setauket.
  31. Santos, A. M. & Vanderstand, M. (2002). Intra specific genetic diversity of Drechslera tritici-repentis as detected by random amplified polymorphic DNA analysis. Genetics and Molecular Biology, 25, 243-250.
  32. Statkeviciute, G., Brazauskas, G. & Semaskiene, R. (2010). Pyrenophora teres genetic diversity as detected by ISSR analysis. Zemdirbyste= Agriculture, 97(9), 91-98.
  33. Yeh, F.C., Yang, R.C. & Boyle, T. (1999). Microsoft Window-based freeware for population genetic analysis (POPGENE), ver.1.31, ftp://ftp.microsoft.com/softlib/MSLFILES/HPGL.EXE.
  34. Zein, I., Jawhar, M. & Arabi, M. (2010). Efficiency of IRAP and ITS-RFLP marker systems in accessing genetic variation of Pyrenophora graminea. Genetics and Molecular Biology, 33(2), 328-332.
 

آمار
تعداد مشاهده مقاله: 2,218
تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,618


سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب