پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 158 |
| تعداد شماره‌ها | 6,230 |
| تعداد مقالات | 67,764 |
| تعداد مشاهده مقاله | 115,193,782 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 89,941,917 |
مطالعۀ تنوع ژنتیکی جدایه‌های قارچ Fusarium verticillioides عامل بیماری پوسیدگی ریشۀ برنج با استفاده از نشانگر SSR | ||
| دانش گیاهپزشکی ایران | ||
| مقاله 3، دوره 45، شماره 1، اردیبهشت 1393، صفحه 29-37 اصل مقاله (232.74 K) | ||
| نوع مقاله: مقاله پژوهشی | ||
| شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijpps.2014.52244 | ||
| نویسندگان | ||
| خشنود نوراللهی* 1؛ زینب حقی2؛ علی اشرف مهرابی اولادی2 | ||
| 1دانشجوی سابق کارشناسی ارشد، دانشگاه ایلام، ایران | ||
| 2استادیار، دانشگاه ایلام، ایران | ||
| چکیده | ||
| بیماری پوسیدگی ریشۀ ناشی از Fusarium verticillioides یکی از مهم‌ترین بیماری‌های برنج در ایلام است. برای تعیین تنوع ژنتیکی بیمارگر در شالیزارهای استان ایلام، تعداد 56 نمونۀ آلوده از مزارع شهرستان‌های مختلف جمع‌آوری شد. پس از کشت، خالص‌سازی و شناسایی جدایه‌ها، آزمون مولکولی با استفاده از پنج جفت آغازگر ریزماهواره انجام گرفت. از آغازگرهای ریزماهواره 26 آلل در جدایه‌ها تکثیر شد. میانگین تعداد آلل در هر جایگاه 2/5 است، بیشترین تعداد به میزان 40 آلل در جایگاه‌های ژنی 5H08 و5H09 و کمترین تعداد به میزان 24 در جایگاه 5H12 مشاهده شد. شاخص چندشکلی نشانگرها در آغازگر 5H07 با 37/0 بیشترین و آغازگر 4H18 با 14/0 کمترین مقدار را دارا بودند. توزیع مقادیر PIC به‌طور میانگین برای کل نشانگرها 25/0 بود. براساس دندروگرام در سطح تشابه 8 درصد، جدایه‌ها در 10 گروه قرار گرفتند. نتایج تجزیۀ واریانس مولکولی نشان داد که 98 درصد از تنوع ژنتیکی در بین کلیۀ جدایه‌ها و تنها 2 درصد آن به مناطق مختلف جغرافیایی اختصاص دارد. بنابراین بین جدایه‌ها از مناطق مختلف شباهت ژنتیکی زیادی وجود داشت. شباهت ژنتیکی بالا را می‌توان به مهاجرت ژن یا ژنوتیپ در اثر عوامل مختلف نسبت داد | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| برنج؛ تنوع ژنتیکی؛ Fusarium verticillioides؛ SSR | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| Study of genetic diversity of Fusarium verticillioides isolates the causal agent of crown and root rot in rice in ilam province using SSR marker | ||
| نویسندگان [English] | ||
| Khoshnood Nourollahi1؛ Zainab Haghi2؛ Aliashraf Mehrabi oladi2 | ||
| 1scientific board Ilam university | ||
| چکیده [English] | ||
| Root rot caused by Fusarium verticillioides is one of the most important rice diseases in Ilam. In order to determine genetic diversity, 56 samples were collected from rice paddies of different regions in Ilam province. Molecular test was carried out with a set of five pairs of SSR primers after purification and identification of isolates. The SSR primers amplified a total 26 alleles. The average of allele number was 5.2 per each primer. 40 alleles were observed in 5H08 and 5H09 loci as highest allele numbers and 24 alleles were observed in 5H12 locus as lowest. The polymorphism index content value was the highest in primers 5H07 with 0.37 and the lowest in primers 4H18 with 0.14. The average of PIC was 0.25 in all primers. Cluster analysis using Neighbor joining method and Jaccard's coefficient, divided the isolates into 10 groups at 8% similarity level. Result of AMOVA showed 98% of genetic diversity was in relation to isolates and only 2% was in related to different geographical regions. Therefore there is the high genetic similarity between isolates from different geographic regions. High genetic similarity can be attributed to emigration of gene or genotype as a result of various factors. | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| alleles, pathogen, SSR loci, Paddy field | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 1,960 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,858 |
||