سامانه پشتیبانی خدمات اطلاعات

  اخبار و اعلانات

 آمار

تعداد نشریات158
تعداد شماره‌ها6,230
تعداد مقالات67,762
تعداد مشاهده مقاله115,144,101
تعداد دریافت فایل اصل مقاله89,905,623
شیرعلی, مسعود, میرایی آشتیانی, سیدرضا, پاکدل, عباس, هیلی, کریس, پونگ ونوگ, ریکاردو. (1391). مقایسه بین ‌BayesC و GBLUP در برآورد ارزش‌های اصلاحی ژنومی در توزیع‌های متفاوت واریانس ژن‌های عمده اثر. , 43(2), 261-268. doi: 10.22059/ijas.2012.28534
مسعود شیرعلی; سیدرضا میرایی آشتیانی; عباس پاکدل; کریس هیلی; ریکاردو پونگ ونوگ. "مقایسه بین ‌BayesC و GBLUP در برآورد ارزش‌های اصلاحی ژنومی در توزیع‌های متفاوت واریانس ژن‌های عمده اثر". , 43, 2, 1391, 261-268. doi: 10.22059/ijas.2012.28534
شیرعلی, مسعود, میرایی آشتیانی, سیدرضا, پاکدل, عباس, هیلی, کریس, پونگ ونوگ, ریکاردو. (1391). 'مقایسه بین ‌BayesC و GBLUP در برآورد ارزش‌های اصلاحی ژنومی در توزیع‌های متفاوت واریانس ژن‌های عمده اثر', , 43(2), pp. 261-268. doi: 10.22059/ijas.2012.28534
شیرعلی, مسعود, میرایی آشتیانی, سیدرضا, پاکدل, عباس, هیلی, کریس, پونگ ونوگ, ریکاردو. مقایسه بین ‌BayesC و GBLUP در برآورد ارزش‌های اصلاحی ژنومی در توزیع‌های متفاوت واریانس ژن‌های عمده اثر. , 1391; 43(2): 261-268. doi: 10.22059/ijas.2012.28534

مقایسه بین ‌BayesC و GBLUP در برآورد ارزش‌های اصلاحی ژنومی در توزیع‌های متفاوت واریانس ژن‌های عمده اثر

علوم دامی ایران
مقاله 11، دوره 43، شماره 2 - شماره پیاپی 1119384، شهریور 1391، صفحه 261-268    اصل مقاله (292.93 K)
شناسه دیجیتال (DOI): 10.22059/ijas.2012.28534
نویسندگان
مسعود شیرعلی1؛ سیدرضا میرایی آشتیانی2؛ عباس پاکدل3؛ کریس هیلی4؛ ریکاردو پونگ ونوگ5
1دانشجوی دکتری دانشگاه تهران
2استاد دانشگاه تهران
3دانشیار دانشگاه تهران
4پژوهشگاه رازلین و مرکز سلطنتی مطالعات دامپزشکی، دانشگاه ادینبرو.
5بخش ژنتیک انسانی مرکز مطالعات پزشکی، پژوهشگاه ژنتیک و درمانهای مولکولی مرکز مطالعات پزشکی، دانشگاه ادینبرو.
چکیده
ژنومی حاوی 1000 چند شکلی تک نوکلئوتیدی دو آللی روی یک کروموزوم به طول 100 سانتی مورگان شبیه‌سازی شد و توزیع‌های مختلف واریانس ژن‌های عمده اثر (یکنواخت، نرمال و گاما) و نیز تعداد ژن‌های عمده اثر متنوع (5، 10 و 20) به صورت فرضیات شبیه‌سازی صفات در نظر گرفته شدند و در نتیجه 9 صفت متفاوت ایجاد گردید. مقایسه بین ارزش‌های اصلاحی ژنومی برآورد شده به وسیله BayesC و GBLUP نشان داد که ارزش‌های اصلاحی ژنومی برآورد شده و ارزش‌های اصلاحی واقعی در جمعیت مرجع در تمامی صفات، همبستگی بسیار بالایی (80/0
کلیدواژه‌ها
ارزش اصلاحی؛ توزیع واریانس ژن‌های عمده اثر
عنوان مقاله [English]
Comparison between Bayesc and GBLUP in Estimating Genomic Breeding Values under Different QTL Variance Distributions
نویسندگان [English]
Masoud Shirali1؛ Seyed Reza Miraei-Ashtiani2؛ Abbas Pakdel3؛ Chris Haley4؛ Ricardo Pong-Wong5
چکیده [English]
A genome consisted of 1000 biallelic single nucleotide polymorphisems (SNPs) on one chromosome with 100 CM length was simulated and different QTL variance distributions (Uniform, Normal and Gamma) and various numbers of QTL (5, 10 and 20) were considered as simulation assumptions and consecutively 9 various traits were generated. The comparison between GEBVs obtained from BayesC and GBLUP showed that GEBVs and true breeding values were largely correlated (r > 0.80) in training population for all traits. Comparing accuracies of GEBVs showed that both BayesC and GBLUP methods performed similarly, except in traits with 5 QTLs BayesC performed significantly better (P < 0.05). The accuracies of estimations using BayesC indicated that this method performed better under scenarios with low number of QTL and gamma variance distribution in trait of interest. However, GBLUP presented accurate estimations in all traits; and number of QTL and QTL variance distributions had no impact on accuracies of GBLUP estimations. These results can be due to assumed genetics model in trait of interest in each method.
کلیدواژه‌ها [English]
BayesC, Breeding value, GBLUP, Number of QTL, QTL variance distribution
آمار
تعداد مشاهده مقاله: 2,490
تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 1,140


سامانه مدیریت نشریات علمی. قدرت گرفته از سیناوب