پیوندهای مفید
اخبار و اعلانات
آمار
| تعداد نشریات | 158 |
| تعداد شماره‌ها | 6,228 |
| تعداد مقالات | 67,750 |
| تعداد مشاهده مقاله | 115,085,569 |
| تعداد دریافت فایل اصل مقاله | 89,824,226 |
ارزیابی تنوع ژنتیکی در بین تعدادی از ژنوتیپ های انار به کمک نشانگرهای RAPD | ||
| مجله علوم کشاورزی ایران | ||
| مقاله 13، دوره 38، شماره 1 - شماره پیاپی 1786، آذر 1386 اصل مقاله (213.97 K) | ||
| نویسندگان | ||
| ذبیح اله زمانی؛ علی سرخوش؛ محمدرضا فتاحی مقدم؛ علی عبادی؛ علی پهلوانی* | ||
| چکیده | ||
| ایران دارای غنی‌ترین ذخایر ژنتیکی انار در جهان می‌باشد بطوریکه تنوع و تعداد ژنوتیپ‌های انار در ایران بی‌نظیر است. در این مطالعه از نشانگرهای RAPD برای تعیین سطح تنوع و خویشاوندی در 24 ژنوتیپ انار ایران استفاده شد. DNA ژنومی از برگها استخراج و کمیت و کیفیت آنها با استفاده از روش اسپکتروفتومتری و الکتروفورز ژل آگارز تعیین شد و پس از رقیق کردن در واکنش PCR استفاده گردید. تعداد 113 آغازگر تصادفی در انجام واکنش PCR بر روی نمونه ها آزمایش گردید که 27 آغازگر تکثیر DNA الگو را به خوبی انجام داده و بین ژنوتیپ ها چند شکلی نشان دادند. قطعه های با وضوح خوب که دارای تکرار پذیری بالایی بودند، برای محاسبات انتخاب شدند. این 27 آغازگر در مجموع 257 قطعه در کل ژنوتیپ ها تکثیر کردند که از بین آنها 158 قطعه چند شکل بودند. تجزیه خوشه ای ژنوتیپ ها براساس حضور نوار (یک) و عدم حضور نوار (صفر) با استفاده از ضریب تشابه جاکارد و به روش UPGMA انجام گرفت. بیشترین و کمترین تشابه ژنتیکی بین ژنوتیپ ها به ترتیب برابر 88% و 30% بدست آمد. در تجزیه خوشه‌ای، ژنوتیپ ها در درصد تشابه 64 در 8 گروه مجزا جای گرفتند. همچنین ضریب کوفنتیکی بین ماتریس تشابه و دندروگرام در حد 92/ 0 r =بدست آمد که برازش مناسب دندروگرام به ماتریس تشابه را نشان میدهد. بنابر نتایج بدست آمده ژنوتیپ های مورد بررسی از تنوع نسبتا بالایی برخوردار بودند که نشان دهنده غنی بودن ذخایر ژنتیکی انار در ایران است. همچنین این بررسی نشان داد که از اسامی مشابه ممکن است برای ژنوتیپ‌های متفاوت استفاده شده باشد و یا اینکه در ایجاد کلکسیون‌ها و در هنگام جابجایی ژنوتیپ‌ها ممکن است اختلاط و یا اشتباه بوجود آید. بعلاوه این آزمایش نشان داد که نشانگر RAPD برای گروه‌بندی ژنوتیپ‌های انار یک تکنیک موثر و مفید است. | ||
| کلیدواژه‌ها | ||
| انار؛ تنوع ژنتیکی؛ نشانگرهای مولکولی | ||
| عنوان مقاله [English] | ||
| - | ||
| چکیده [English] | ||
| Iran is in possession of the richest gene pool of pomegranate, with an amazing diversity and number of genotypes, in the world. In this study RAPD markers were mployed to determine the level of diversity, and phylogenetic relationships among 24 Iranian pomegranate genotypes. Genomic DNA extracted from leaves, and its quantity as well as quality were determined by use of spectrophotometry and agarose gel electrophoresis to be used for PCR after being adjusted for the concentrations. In total 113 primers were used for PCR reactions on the template DNAs among which 27 showed reasonable amplification and polymorphism. Bands with a acceptable resolution and high repeatability were selected for calculations. These 27 primers produced 257 bands, among them, 158 were polymorphic. Cluster analysis of the genotypes was performed based on the presence (1) or absence (0) of the bands, using Jaccard’s similarity coefficient and UPGMA method. The highest and lowest observed genetic similarity between genotypes was 0.88 and 0.30 respectively. At a distance of 0.64 similarities on the dendrogram, the genotypes were divided into 8 sub-clusters. A Cophenetic coefficient of r=0.92 between similarity matrices and the dendrogram is an indication of the dendrogram properly fitting the similarity data. The examined genotypes were to relatively high diversity, implying the richness of pomegranate genetic resources in Iran. Furthermore, this study reflected the possibility of similar names having been given to different genotypes or the mistakes and mixes in either collection establishments or during translocation of genotypes. Besides, RAPD markers were shown to be a useful technique for studying the genetic diversity in pomegranate | ||
| کلیدواژه‌ها [English] | ||
| pomegranate, RAPD, Genetic diversity, PCR, Molecular markers | ||
|
آمار تعداد مشاهده مقاله: 2,139 تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 2,289 |
||